Эмбриональная бычья сыворотка
Mary Johnson (mary at labome dot com)
Synatom Research, Princeton, New Jersey, United States
Перевод
Aleksei Stepanenko (a dot a dot stepanenko at gmail dot com)
Laboratory of Biosynthesis of Nucleic Acids, Department of Functional Genomics, 150 Zabolotnogo Street, Kyiv 03680, Ukraine
DOI
http://dx.doi.org/10.13070/mm.ru.2.117
Дата
последнего обновления : 2016-09-03; оригинальная версия : 2012-03-22
Цитировать как
MATER METHODS ru 2012;2:117
Абстракт

Углубленное обсуждение эмбриональной бычьей сыворотки и ее применение в эукариотической культуре клеток.

English Abstract

An in-depth discussion of fetal bovine serum and its applications in eukaryotic cell culture.

Что такое эмбриональная бычья сыворотка (ЭБС)?

Сывороткой является жидкая фракция свернувшейся крови из плода теленка, обедненная клетками, фибрином и факторами свертывания крови, но содержащая большое количество питательных и макромолекулярных факторов, необходимых для роста клеток. Бычий сывороточный альбумин является основным компонентом эмбриональной бычьей сыворотки (ЭБС). Очень важным является наличие в эмбриональной бычьей сыворотке множества факторов роста, которые необходимы для поддержания и роста культивируемых клеток [1, 2]. ЭБС содержит также небольшие молекулы, такие как аминокислоты, сахара, липиды и гормоны.

ЭБС используется в культуре эукариотических клеток и имеет широкий диапазон применений. Например, она используется в исследованиях, производстве и контроле человеческих и ветеринарных вакцин, и биотехнологических препаратов.

Почему используется эмбриональная сыворотка, а не сыворотка новорожденных или взрослых особей?

Эмбриональная сыворотка содержит большее количество факторов роста и имеет низкое содержание гамма-глобулина (иммуноглобулина). Кроме того, эмбриональная сыворотка содержит более низкие уровни факторов системы комплемента, чем сыворотка взрослых или новорожденных особей. Факторы системы комплемента имеют нежелательный эффект на клетки в культуре, индуцируя их лизис, а также мешают при иммуноанализе.

В чем разница между сывороткой и плазмой крови?

Сыворотку получают после свертывания крови, в то время как плазма содержит антикоагулянты и белки, участвующие в каскаде коагуляции. Следовательно, фибрин и белки, ассоциированные с фибрином, не присутствуют в сыворотке.

У человека около 22 белков: альбумин, общий IgG, трансферрин, фибриноген, общий IgA, альфа-2-макроглобулин, общий IgM, альфа-1-анти-трипсин, С3 комплемент, гаптоглобулин, , альфа-1-кислый гликопротеин, аполипопротеин-Б, аполипопротеин-A1, липопротеин (а), фактор Н, церулоплазмин, С4 комплемент, фактор Б комплемента, пре-альбумин, С9 комплемент, C1q комплемент и С8 комплемент составляют 99% от общего содержания белков плазмы [3, 4]. Остальной 1% содержит сотни белков.

Как тестируется эмбриональная бычья сыворотки перед упаковыванием и продажей?

Международная Ассоциация Сывороточной Промышленности (www.serumindustry.org), торговая организация поставщиков сыворотки крови, требует проведение следующих тестов с использованием специальных методик, и результаты испытаний должны быть доступны в виде сертификата анализа качества (Таблица 1).

Тест
бактерии и грибки - тестирование стерильности
микоплазма
цитопатические агенты - вирусное тестирование
гемадсорбирующие агенты - вирусное тестирование
бычий вирус диареи - вирусное тестирование
pH измерение
осмоляльность
общий белок, измеренный методом Биурета
эндотоксины
гемоглобин
электрофоретический паттерн
индивидуальные показатели, такие как культура стволовых клеток и т.д.
Table 1. Минимальные требования к тестированию сыворотки крови.
Тестирование на наличие эндотоксинов

Эндотоксины, также называемые липополисахариды или липоолигосахариды, по происхождению являются частью внешней мембраны грамотрицательных бактерий и вносят свой вклад в клинические проявления различных патогенных грамотрицательных бактерий, таких как Neisseria meningitidis. In vivo, эндотоксины вызывают повышение температуры и воспалительную реакцию, а в культуре клеток они вызывают значительные вариации в клеточных ответах.

Уровень эндотоксина определяется с помощью теста лизата амебоцитов Limulus (ЛАЛ-тест). ЛАЛ получают из крови Limulus polyphemus (мечехвосты), см. Рисунок 1. ЛАЛ очень чувствительный к эндотоксинам и свертывается при наличии их минимального количества. Амебоциты являются эквивалентами белых кровяных клеток у позвоночных.

Эмбриональная бычья сыворотка Рисунок 1
Рисунок 1. Мечехвосты.
Специальные сыворотки и другие виды обработки
Термоинактивация

Распространенной обработкой эмбриональной бычьей сыворотки (ЭБС) является термоинактивация, при которой ЭБС выдерживают при температуре 56°C в течение 30 минут на водяной бане при периодическом встряхивании. Важно, чтобы температура ЭБС была надлежащей, так как нагревание бутылки еще замороженного ЭБС до 56°C может занять значительное количество времени. Целью термической обработки является инактивация системы комплемента [5], а также, возможно, неизвестных ингибиторов роста клеток. Термоинактивация также может иметь нежелательные последствия [6]. Еще одной целью термоинактивации до недавнего времени могло быть удаление загрязнения микоплазмы, которое в настоящее время уже не является проблемой, так как вся сыворотка фильтруется через фильтры с гораздо меньшим размером пор для того, чтобы удалить микоплазму.

Стоит отметить, что некоторые поставщики сыворотки призвали не термоинактивировать ЭБС для большинства нужд клеточных культур. В любом случае, желательно оценить потребность тепловой инактивации в каждом конкретном применении, так как различные клетки демонстрируют различные реакции на термоинактивацию [7-10].

Как и все другие протоколы, связанные с эмбриональной бычьей сывороткой (ЭБС), процесс термоинактивации должен проводиться с осторожностью, так как слишком высокая температура или длительное нагревание инактивируют факторы роста, а также вызывают преципитацию.

Инактивированную нагреванием ЭБС от Life Technologies / Invitrogen / GIBCO использовали в клеточной культуре с целью изучения, например, UCP-2 и UCP-3 [11], ядерного фактора каппа-B [12], экспрессии капсидных белков FMDV в лизате экспрессионной системы шелкопряд-бакуловирус [13], субклинической болезни трансплантат против хозяина [14], эффектов интерферона-гамма [15], аутофагии [16], от Thermo Fisher Scientific для изучения белка нуклеокапсида коронавируса, вызывающего тяжелый острый респираторный синдром [17], для изучения окиси азота [18], активина C [19], IE1 [20], от Sigma для исследования химиотерапии [21] и механизма гамма-активации PI3K [22], а также от Equitech-Bio для изучения глутатион S-трансферазы Pi [23].

Обработка активированным углем

Активированный уголь может связываться с липофильными молекулами и, таким образом, используется для удаления из ЭБС таких гормонов, как андроген, эстрадиол, прогестерон, кортизол, тестостерон, Т3 и Т4. Эти липидные гормоны в сыворотке крови, как правило, мешают проведению иммунологических тестов и анализа эффектов инсулина.

Например, обработанную активированным углем ЭБС от Thermo Scientific HyClone использовали для культивирования клеток с целью идентификации белков семейства TGFбета [24].

Диализ

Диализ может удалить из ЭБС все молекулы с молекулярной массой менее 10,000 Да. Малые молекулы включают как полярные, так и неполярные химические вещества. Удаляются гормоны, цитокины, глюкоза, аминокислоты, а также многие другие молекулы.

Диализ также удаляет антибиотики и другие экзогенные молекулы из ЭБС.

Например, диализованную ЭБС от Life Technologies использовали для изучения кинезина 5B [25], инактивации пируваткиназы M2 [26], от Thermo Fisher Scientific для изучения влияния мутации в KRAS [27] и от Sigma для изучения PAH метаболизма [28].

Гамма-облучение

Гамма-облучение может быть частью процесса стерилизации эмбриональной бычьей сыворотки. ЭБС обычно фильтруют через 0,1 мкм фильтр несколько раз, чтобы исключить микроорганизмы. Гамма-облучение может инактивировать вирусы. Однако, некоторые вирусы устойчивы к действию гамма-облучения, такие как парвовирусы.

Низкий уровень IgG

ЭБС с низким IgG очень хорошо подходит для производства антител и других применений.

Культура стволовых клеток

Стволовые клеточные культуры имеют жесткие требования с точки зрения факторов роста. Некоторые из факторов роста, присутствующие в ЭБС, способствуют дифференцировке стволовых клеток, поэтому важно использовать специальные сыворотки для поддержания плюрипотентности/ тотипотентности различных типов стволовых клеток.

Страна происхождения

Основные страны-производители крупного рогатого скота являются основными поставщиками эмбриональной бычьей сыворотки (ЭБС). Эти страны включают США, Австралию, Новую Зеландию, Канаду, а также страны Южной и Центральной Америки.

Производство и сбор сыворотки регулируются государственными органами.

ЭБС маркируется как USDA стандарта или европейского стандарта. ЭБС USDA стандарта может быть импортирована в любую другую страну, в которой нет заболеваний бычьей губчатой энцефалопатии и ящура, в то время как ЭБС европейского стандарта может быть продана в большинстве стран Европы и Азии.

Как хранить эмбриональную бычью сыворотку?

Эмбриогальная бычья сыворотка хранится замороженной, в температурном интервале от -5 до -20°C, и может быть разморожена в температурном диапазоне от 2 до 8°C. Рекомендуется аликвотить сыворотку, например, в 50 мл пробирки, чтобы избежать повторного замораживания и размораживания.

После оттаивания в сыворотке может наблюдаться осадок. Осадок возникает, вероятно, из-за денатурации белков сыворотки, он может быть очищен после кратковременного центрифугирования, и это, как правило, не влияет на качество сыворотки.

Выбор эмбриональной бычьей сыворотки

Многие поставщики предлагают ЭБС разных классов, стран происхождения и обработки. Сама по себе ЭБС представляет собой сложную смесь, следовательно, стоит ожидать и вариабельность между различными разновидностями сыворотки, различными поставщиками и различными партиями.

Таким образом, важно установить процесс отбора и оценки ЭБС. Одним из важных моментов является изучение конкретного выбора ЭБС в литературе в подобных исследованиях или для одной и той же культуры клеток.

Labome провел анализ использования ЭБС среди 212 публикаций.

Эмбриональная бычья сыворотка в литературе

Labome провел анализ использования ЭБС в более чем 10,000 случайно выбранных публикаций.

Главными поставщиками ЭБС являются Life Technologies, Thermo Fisher Scientific и Sigma-Aldrich (Таблица 2).

suppliernum
Life Technologies87
Thermo Fisher Scientific43
Sigma-Aldrich28
Gemini Bio-Products10
Atlanta Biologicals6
PAA Laboratories6
PAN Biotech3
Biological Industries2
Omega Scientific2
others24
Table 2. Поставщики и количество публикаций со ссылкой на их ЭБС в обзоре литературы.
Life Technologies

Life Technologies является глобальной биотехнологической компанией со штаб-квартирой в городе Карлсбад, штат Калифорния. Она образована в 2008 году в результате слияния Invitrogen Corporation и Applied Biosystems Inc. Ее торговая марка GIBCO продает среды для культивирования клеток, ЭБС и другие реагенты для культуры клеток. Компания поставляла на рынок около 34 разновидностей ЭБС по состоянию на март 2012. Сейчас компания после слияния является частью Thermo Fisher Scientific.

Анализ литературы свидетельствует, что ЭБС от GIBCO использовалась в 87 из 212 публикаций. В таблице 3 приведены данные использования сыворотки среди различных областей исследований.

область исследованийnum
Физиология32
Иммунология18
Онкология18
Патология7
Неврология6
Вирусология1
Table 3. Число публикаций в каждой области исследований, цитирующие ЭБС от Life Technologies GIBCO.
Физиология

Физиология является самым популярным направлением исследований, и большинство публикаций фокусируются на функциях генов в физиологических процессах. Например, ЭБС от GIBCO использовали в культуре клеток для изучения экспрессии альбумина в клетках микроглии человека и тканях мозга [29], функции O-маннозил фосфорилирования альфа-дистрогликана при связывании ламинина [30], новой роли остатка D70 белка APE1 в скорости вырезания 3'-блокирующих концов [31], роли CENH3 в формировании центромер у дрозофилы [32], IGF1 изоформ и их функций [33], роли диолов в сигнальном пути окиси азота [34], эффектов PKC при опосредованной изофлураном защите [35], регуляции фактора, стоящего над RARalpha, на плейотропную эпигенетическую сеть [36], роли фактора, происходящего из стромальных клеток (SDF-1)/CXCR4, на TNF-индуцированную мобилизацию предшественников остеокластов [37], эффекта заякоривания C-конца субъединицы G белка альфа на скорость рециклирования [38], роли SRp20 и CUG-BP1 в модулировании альтернативного сплайсинга экзона 11 инсулинового рецептора [39], эффектов ростовых факторов на регуляцию экспрессии ADAMTS-4 [40], важности PRC2 в поддержании фенотип эмбриональных стволовых клеток [41], роли фактора транскрипции Ets-1 в регуляции экспрессии рецептора А натрийуретического пептида [42], роли of H+-ATФазы в mTOR сигнальном каскаде [43], эффекта ET-1 на синтез и секрецию коллагена в LC клетках [44] и роли калийного митохондриального канала Kv1.3 при Bax-индуцированном апоптозе в лимфоцитах [45].

Кроме того, ЭБС от GIBCO использовалась для изучения эффективности некоторых агентов, таких как местные иммунодепрессанты [46] и ингибитор деацетилазы гистонов LAQ824 [47]. Некоторые исследователи использовали ЭБС от GIBCO для изучения процесса апоптоза. Например, Atapattu et al. [48] and Lam et al. [49] использовали ЭБС для культивирования клеток при изучении деталей апоптического процесса. Некоторые ученые исследовали молекулярные механизмы [50-54] и роль некоторых молекул в сигнальных путях [55-57], например, взаимодействие между кадгерин-опосредованными адгезивными соединениями и сигнальным путем Wnt [56] и роль CHIP в сигнальном пути агресом [57].

Эмбриональная бычья сыворотка Рисунок 2
Рисунок 2. Разрешение от Gibco Life Technologies, владелец авторских прав.
Иммунология

Иммунология является еще одним популярным направлением исследований. ЭБС от GIBCO использовали для изучения роли IL-23 в инициировании воспалительных реакций [58], роли IL-23 и IL-12 в коактивации Dectin-1 и TLR сигнальных путей [59], роли рекогнации иммуносом в адаптивном иммунитете к вирусу гриппа [60], активации иммунитета, индуцированном агонистическими антителами к CD40 [61], иммунодефицита IL-17, ведущего к CMCD [62], важной роли IFN для CCL3-опосредованного привлечения нейтрофилов in vivo [63]. Есть также публикации, сфокусированные на иммуноцитах, например, изучение роли TNF-альфа для макрофагов [64], эффекты SP на экспрессию PPAR-гамма в моноцитах и макрофагах [65], роли пептида Tregitopes, полученного из IgG Fc, в активации натуральных регуляторных T клеток [66] и роли селектинов в NK клетках [67]. Также некоторые исследователи сфокусировались на иммунной системе, как врожденной, так и адаптивной [68, 69]. Недавно Kendirgi et al. исследовали ДНК вакцину против вируса гриппа типа A/H5N1 [70], тогда как Li et al. исследовали новую FMDV вакцину [13].

Онкология

ЭБС от GIBCO использовали для изучения эффектов дасатиниба на клетки меланомы [71], влияния целекоксиба на экспрессию ICAM-1 и VCAM-1 [72], экспрессии Foxp3 в опухолевых клетках человека [73], экспрессии FAS в клетках множественной меланомы человека [74], роли андроген рецептор-негативных клеток в терапии метастазов простаты в костный мозг [75], эффекта NO-высвобождающего пролекарства JS-K на инвазию клеток карциномы молочной железы [76], влияния белка ганкирина на р53 и Mdm2 [77], експресию SOSTDC1 в нормальных клетках почки человека и светлоклеточной карциноме почки [78], роли NF-kappaB в регуляции транскрипции онкогена PIK3CA при раке яичников [79], експрессии и внутриклеточного распределения альтернативно сплайсированных изоформ GFG крысы в клетках глиомы С6 [80], механизма регуляции GSK-3бета киназой Аврора A в клетках карциномы желудка [81]. Также несколько публикаций посвящены терапии рака. Например, Barkan et al. использовали ЭБС от GIBCO в культуре клеток для изучения эффекта ингибирования цитоскелета в супрессии метастатических опухолевых клеток [82]. Sahin et al. провели компьютерное моделирование, экспериментальную проверку результатов моделирования и реверсивный инжиниринг сети взаимодействия белков, чтобы определить потенциальные терапевтические стратегии для трастузумаб-резистентной карциномы молочной железы [83].

Патология

Несколько групп проводили патологичнские исследования с использованием ЭБС от GIBCO. Chae et al. изучили роль аквапорина 5 в прогрессировании хронического миелолейкоза [84]. Roberts et al. изучили роль внутренних тегументных белков pUL36 и pUL37 во время входа вирус простого герпеса 1-го типа [85]. Konigshoff et al. изучили экспрессию и активность Wnt/бета-катенин сигнального пути в идиопатическом легочном фиброзе [86]. Несколько других патологических исследований [87, 88] также цитировали ЭБС от GIBCO.

Неврология

ЭБС от GIBCO использовали для культивирования нейроцитов для изучения роли эстрадиола в активации бета-катенин зависимой транскрипции в нейронах [89], роли паразитического нейротрофического фактора в холинергической генной экспрессии в нейрональных клетках PC12 при Болезни Шагаса [90], физиологической роли дисбиндина-1 в центральной нервной системе [91], регулировании хрящевого кислотного белка-1B в аксональных отростках [92] и роли ядерного фактора каппа-B в селективной индукции нейрональной синтазы оксида азота в астроцитах во время низкоуровневой воспалительной стимуляции МРТР [12].

Вирусология

ЭБС от GIBCO была использована для культивирования клеток для изучения взаимодействия между вирусом вакцины P37 и белками клетки-хозяина [93].

Недавние публикации

Недавние публикации указывают, что ЭБС от Gibco / Invitrogen использовалась в клеточной культуре с целью изучения PAH метаболизма в клетках Лангерганса [28], картогенина в дифференциации хондроцитов [94], вовлечения Fam20C в фосфорилирование экстраклеточных белков [95], регулирующего эффекта наночастиц оксида железа на содержание глюкозы в крови у мышей [96] и регулирующего эффекта притока Ca2+ через катионный канал TRPV4 на функцию сосудов [97].

Thermo Fisher Scientific

Thermo Fisher Scientific является крупнейшим поставщиком приборов и реактивов для научных исследований. Компания впускала 19 разновидностей ЭБС под брендом Thermo Fisher Scientific HyClone по состоянию на 22 марта 2012 года. ЭБС от Thermo Scientific HyClone широко используется в биомедицинских исследованиях. Анализ указывает, что 40 из 193 публикаций цитировали ЭБС от Thermo Fisher Scientific. В таблице 4 приведены количества публикаций среди различных направлений исследований.

Эмбриональная бычья сыворотка Рисунок 3
Рисунок 3. Разрешение от Thermo Fisher Scientific, владелец авторских прав.
область исследованийnum
Физиология24
Иммунология5
Онкология5
Вирусология3
Неврология1
Table 4. Количество публикаций в каждой области исследований, цитирующие ЭБС от Thermo Fisher Scientific.
Физиология

Физиология является самым популярным направлением исследований со ссылкой на ЭБС от Thermo Fisher Scientific HyClone. ЭБС в культуре клеток использовали для изучения роли GDPD5 как GPC-PDE в осмотической регуляции клеточного GPC [98], вклада цис-регуляторных сайтов, фланкирующих элемент AP-1, на базальную и эстроген-зависимую регуляцию транскрипции BRCA1 [99], эффектов 17бета-E2 на экспрессию и активность супероксид-дисмутазы марганца, ассоциированной с митохондриями [100], ускорения заживления ран путем самосборки пептидных скафолдных нановолокон [101], влияние PM холестерола на PIP2-регулируемую структуру цитоскелета [102], регулирования активации PACT с помощью TRBP [103], механизма понижения синтеза маспина в стромальных фибробластах и миофибробластах роговицы человека [104], роли YKL-40 в модулировании биологической активности основного фактора роста фибробластов [105], биохимической природы рецептора серотонина 5НТ2С и его роли в передаче сигналов [106], роли насыщенных жирных кислот в ответе на ДНК повреждения [107], эффекта большого Т-антигена обезьяньего вируса 40 на целостность генома и ответ на ДНК повреждения [108] и влияния циклической деформации и дефицита декорина на 3D клеточный скелет коллагена [109].

Иммунология

Несколько работ были посвящены процессу взаимодействия хозяин-патоген. Например, Mendez-Samperio et al. использовали ЭБС от Thermo Fisher Scientific HyClone для изучения эффекта Mycobacterium bovis Bacillus Calmette-Guérin на экспрессию и секрецию кателицидина LL-37 в эпителиальных клетках человека [110], Round et al. провели исследование выявления роли Bacteroides fragilis в формировании симбиоза хозяин-микроб [111], and Vaishnava et al. сфокусировались на мутуализме хозяин-бактерия [112]. Другие статьи были сосредоточены на изучении функций металлопротеиназы-7 в ЦНС при экспериментальном аутоиммунном энцефаломиелите [113], функций некоторых провоспалительных цитокинов [114] и роли MDA5 в контроле MNV-1 инфекции [115].

Онкология

Beauvais et al. использовали ЭБС от Thermo Fisher Scientific HyClone в культуре клеток для изучения роли синдикана-1 в регуляции активации интегринов alphaVbeta3 и alphaVbeta5 во время ангиогенеза и онкогенеза [116]. Lee et al. исследовали влияние антрациклиновой химиотерапии на опухоли [117]. Shim et al. провели эксперимент по изучению регулирования и роли экспрессии NAG-1 в VES-обработанных PC3 клетках карциномы предстательной железы человека [118]. Casalbore et al. исследовали взаимосвязь между активацией TERT и Notch1 и онкогенным потенциалом нервных стволовых клеток из обонятельной луковицы взрослого человека [119].

Неврология

Только одна статья касается исследований в области нейробиологии. В работе изучили зависимое от активности высвобождения END-2 из первичных сенсорных нейронов крыс [120].

Вирусология

Schultz et al. использовали ЭБС от Thermo Fisher Scientific HyClone для тестирования того, является ли IE1 селективным активатором транскрипции во время ранней репликации бакуловируса [20]. Corti et al. провели исследования того, как нейтрализующие антитела взаимодействует с агглютининами группы 1 и 2 вируса гриппа А [121]. Han et al. использовали ЭБС в культуре клеток для изучения роли взаимодействия APOBEC3G и APOBEC3F с эндогенным кофактором в ингибировании репликации ВИЧ-1 [122].

Более недавние публикации ссылаются на использование ЭБС от Hyclone Laboratories в исследованиях роли глицина в быстрой пролиферации рака [123], геномных особенностей зародышевых клеточных линий Schistosomes [124] и в исследовании гомеостаза аминокислот [125].

Sigma-Aldrich

ЭБС от Sigma-Aldrich была процитирована в 22 статьях (см. Таблицу 5).

область исследованийnum
Онкология9
Физиология8
Патология4
Иммунология1
Table 5. Число публикаций в каждой области исследований, цитирующих ЭБС от Sigma-Aldrich.
Онгология

Девять статей сосредоточены на молекулярной онкологии. Например, ЭБС от Sigma-Aldrich использовали для идентификации генов-мишеней NF-kappaB, вовлеченных в рак щитовидной железы [126], для выявления вклада гипоксии в активацию р38 МАРК [127], для выявления роли микроРНК-27а и микроРНК-451 в регуляции экспрессии MDR1/P-гликопротеина в опухолевых клетках человека [128], роли экспрессии рецепторных тирозинкиназ (RTK) и активации пути IGF-I [129], анти-метастатической роли декорина при раке молочной железы [130] и онкогенной роли FGFR3 при раке мочевого пузыря [131].

Некоторые группы использовали ЭБС от Sigma-Aldrich для изучения терапии рака. Например, Xie et al. использовали ЭБС от Sigma в культуре клеток для демонстрации того, что специфические раковые клетки могут быть мишенью транскрипционной/пост-транскрипционной регуляторной цепи [132]. Ni Chonghaile et al. сосредоточились на изучении эффектов химиотерапии с высоким митохондриальным праймингом [21].

Физиология

ЭБС от Sigma использовали в культуре клеток для изучения структуры и функции мембранного белка CD81 [133], роли связывания UDP-N-ацетилглюкозамин 2-эпимеразы/ N-ацетилманнозамин-киназы (GNE) с альфа-актинином 1 в скелетных мышцах [134], эффекта октаноилирования пентапептидов на грелин O-ацилтрансферазу [135], влияния повышения экспрессии TRPC3 и TRPM7 кальциевых каналов на конститутивную секрецию [136], влияние FUSE-связывающего белка на репликацию вируса гепатита С [137] и регулирование концентрации АТФ инозитол пирофосфатазой [138].

Патология

Verma et al. изучили экспрессию шаперона ERp29 в мышиной модели Ccl2-/-/Cx3cr1-/- макулярной возрастной дистрофии [139]. Kowalski et al. изучили влияние стимуляции TLR2 и TLR4 на провоспалительную продукцию цитокинов мононуклеарными клетками периферической крови пациентов с недавно начавшимся ревматоидным артритом или остеоартритом [140]. Kami et al. изучили влияние белка гремлина на кардиомиогнез [141].

Иммунология

Bansal et al. показали, что в макрофагах PIM2-индуцированная экспрессия COX-2 и ММР-9 опосредована PI3K и Notch1 сигнальными каскадами [142].

Более недавние публикации со ссылкой на ЭБС от Sigma включают исследования важности регулирования уровня белка matrimony при переходе ооцита к эмбриону у дрозофилы [143], свойств стволовых эпителиальных клеток молочной железы мыши во время развития [144], роль PI4P в идентичности плазматической мембраны [145], функциональность СК2 киназы у дрозофилы [146] и механизм активации PI3K-гамма [22].

Gemini Bio-Products

Среди нами проанализированных публикаций, 9 ссылаются на сыворотку от Gemini. Hamanaka et al. изучили роль PERK в ответе на стресс в эндоплазматическом ретикулуме [147]. Kitareewan et al. исследовали роль G0S2 в ретиноидном ответе APL [148]. ЭБС от Gemini использовали для изучения активации Т-клеток [149] и CD8+ T-клеточного ответа [150], роли синдикана-1 в регуляции активации alphaVbeta3 и alphaVbeta5 интегринов во время ангиогенеза и онкогенеза [116], связи вариантов HFE и регулирования железа с нейродегенеративными заболеваниями [151], патогенеза кожных заболеваний [152] и роли MMS19 в метаболизме ДНК и геномной целостности [153].

Atlanta Biologicals

ЭБС от Atlanta Biologicals использовали для изучения как положительных, так и негативных эффектов гамма-интерферона во время вторичной инфекции RSV [154], для проверки гипотезы, что дополнительные мутации в RAS за пределами кодонов 12, 13 и 61 могут вносить вклад в процесс онкогенеза миелоидных злокачественных опухолей [155], для демонстрации того, что доза CBP является критическим регулятором гено-специфической сигнальной интеграции между ER- и NF-kappaB сигнальными путями [156] и для изучения быстрого, индуцированного алилированием, рекрутирования белков репарации ДНК в синхронизированных популяциях MMR-дефицитных клеток после обработки MNNG [157].

PAA Laboratories

PAA Laboratories являются частью GE Healthcare.

ЭБС от PAA Laboratories использовалась в культуре клеток для изучения сигнального пути митоген-активируемой протеинкиназы (МАРК) в хориокарциноме человека [158], для изучения кошаперона CDC37 [159]. Burdak-Rothkamm et al. идентифицировали ATM в качестве дополнительного компонента комплексной сигнальной сети радиационно-индуцированного повреждения ДНК [160]. Marschner et al. [161] and Sprynski et al. [162] также проводили физиологические исследования, используя ЭБС от PAA Laboratories.

Biological Industries

Cardoso et al. использовали ЭБС в культуре клеток для изучения роли кинезина 5B в опухолевых клетках [25], тогда как Avinoam et al. провели исследование структуры и функции AFF-1 (клеточный фузоген), представителя семейства белков-фузогенов в C. elegans [163].

PAN-Biotech GmbH

ЭБС от PAN-Biotech GmbH использовали для изучения роли аполипопротеинов в синтезе и сборке вирусных частиц гепатита С [164], для идентификации прогениторных клеток в костном мозге, специфичных для макрофагов и дендритных клеток [165] и для демонстрации того, что у мышей уровень глюкозы в крови можно контролировать с помощью синтетического оптогенетического транскрипционного устройства [166].

Omega Scientific

Witherden et al. использовали ЭБС от Omega Scientific для изучения роли соединительной адгезивной молекулы-подобного белка в качестве костимулирующего рецептора для активации гаммадельта Т-клеток [167]. Epting et al. показали, что Sca-1 локализуется в липидных микродоменах в миогенных предшественниках и ассоциируется с каталитически активным внутриклеточным мессенджером IDE [168].

ЭБС от других поставщиков

ЭБС также цитировалась от некоторых других поставщиков, таких как Equitech-Bio, Biochrom, Lonza, Biowest, and Clontech.

Hussain et al. использовали ЭБС от Clontech для демонстрации того, что гипогликемия у людей может быть вызвана активацией мутантной AKT2 [169]. Nold-Petry et al. использовали ЭБС от Lonza для изучения роли IL-32 в оказываемых эффектах IL-1 на функции эндотелиальных клеток [170]. Hokaiwado et al. использовали ЭБС от Equitech-Bio для изучения роли глутатион S-трансферазы Pi в пролиферации клеток андроген-независимой карциномы простаты [23]. Slipicevic et al. использовали ЭБС от Biochrom для изучения роли белка, связывающего жирные кислоты 7 (FABP7), в пролиферации и инвазии клеток меланомы [171]. Sato et al. использовали ЭБС от Biowest для демонстрации того, что рост аксонов может регулироваться хрящевым кислым белком-1B через ингибирование NgR1 [92]. ЭБС от BioWhittaker использовали в культуре клеток для анализа Dilp8 в регуляции тканевого роста дрозофилы [172]. ЭБС от PromoCell и Stemcell Technologies использовали в экспериментах по анализу клеточного происхождения функциональных кровеносных сосудов у взрослых [173].

Ссылки
  1. Shah G. Why do we still use serum in the production of biopharmaceuticals?. Dev Biol Stand. 1999;99:17-22 pubmed
  2. Even M, Sandusky C, Barnard N. Serum-free hybridoma culture: ethical, scientific and safety considerations. Trends Biotechnol. 2006;24:105-8 pubmed
  3. Issaq H, Xiao Z, Veenstra T. Serum and plasma proteomics. Chem Rev. 2007;107:3601-20 pubmed
  4. Anderson N, Anderson N. The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. Mol Cell Proteomics. 2002;1:845-67 pubmed
  5. Triglia R, Linscott W. Titers of nine complement components, conglutinin and C3b-inactivator in adult and fetal bovine sera. Mol Immunol. 1980;17:741-8 pubmed
  6. Giard D. Routine heat inactivation of serum reduces its capacity to promote cell attachment. In Vitro Cell Dev Biol. 1987;23:691-7 pubmed
  7. Okano S, Hurley D, Vandenplas M, Moore J. Effect of fetal bovine serum and heat-inactivated fetal bovine serum on microbial cell wall-induced expression of procoagulant activity by equine and canine mononuclear cells in vitro. Am J Vet Res. 2006;67:1020-4 pubmed
  8. Pinyopummintr T, Bavister B. Development of bovine embryos in a cell-free culture medium: Effects of type of serum, timing of its inclusion and heat inactivation. Theriogenology. 1994;41:1241-9 pubmed
  9. Meszaros K, Aberle S, White M, Parent J. Immunoreactivity and bioactivity of lipopolysaccharide-binding protein in normal and heat-inactivated sera. Infect Immun. 1995;63:363-5 pubmed
  10. Kuznetsov S, Mankani M, Bianco P, Robey P. Enumeration of the colony-forming units-fibroblast from mouse and human bone marrow in normal and pathological conditions. Stem Cell Res. 2009;2:83-94 pubmed publisher
  11. Li Y, Maedler K, Shu L, Haataja L. UCP-2 and UCP-3 proteins are differentially regulated in pancreatic beta-cells. PLoS ONE. 2008;3:e1397 pubmed publisher
  12. Carbone D, Moreno J, Tjalkens R. Nuclear factor kappa-B mediates selective induction of neuronal nitric oxide synthase in astrocytes during low-level inflammatory stimulation with MPTP. Brain Res. 2008;1217:1-9 pubmed publisher
  13. Li Z, Yi Y, Yin X, Zhang Z, Liu J. Expression of foot-and-mouth disease virus capsid proteins in silkworm-baculovirus expression system and its utilization as a subunit vaccine. PLoS ONE. 2008;3:e2273 pubmed publisher
  14. Capitini C, Herby S, Milliron M, Anver M, Mackall C, Fry T. Bone marrow deficient in IFN-{gamma} signaling selectively reverses GVHD-associated immunosuppression and enhances a tumor-specific GVT effect. Blood. 2009;113:5002-9 pubmed publisher
  15. Boost K, Sadik C, Bachmann M, Zwissler B, Pfeilschifter J, Muhl H. IFN-gamma impairs release of IL-8 by IL-1beta-stimulated A549 lung carcinoma cells. BMC Cancer. 2008;8:265 pubmed publisher
  16. Michaud M, Martins I, Sukkurwala A, Adjemian S, Ma Y, Pellegatti P, et al. Autophagy-dependent anticancer immune responses induced by chemotherapeutic agents in mice. Science. 2011;334:1573-7 pubmed publisher
  17. Zhou B, Liu J, Wang Q, Liu X, Li X, Li P, et al. The nucleocapsid protein of severe acute respiratory syndrome coronavirus inhibits cell cytokinesis and proliferation by interacting with translation elongation factor 1alpha. J Virol. 2008;82:6962-71 pubmed publisher
  18. Yasuoka H, Kodama R, Hirokawa M, Takamura Y, Miyauchi A, Sanke T, et al. CXCR4 expression in papillary thyroid carcinoma: induction by nitric oxide and correlation with lymph node metastasis. BMC Cancer. 2008;8:274 pubmed publisher
  19. Gold E, Jetly N, O'Bryan M, Meachem S, Srinivasan D, Behuria S, et al. Activin C antagonizes activin A in vitro and overexpression leads to pathologies in vivo. Am J Pathol. 2009;174:184-95 pubmed publisher
  20. Schultz K, Wetter J, Fiore D, Friesen P. Transactivator IE1 is required for baculovirus early replication events that trigger apoptosis in permissive and nonpermissive cells. J Virol. 2009;83:262-72 pubmed publisher
  21. Ní Chonghaile T, Sarosiek K, Vo T, Ryan J, Tammareddi A, Moore V, et al. Pretreatment mitochondrial priming correlates with clinical response to cytotoxic chemotherapy. Science. 2011;334:1129-33 pubmed publisher
  22. Walser R, Burke J, Gogvadze E, Bohnacker T, Zhang X, Hess D, et al. PKCβ phosphorylates PI3Kγ to activate it and release it from GPCR control. PLoS Biol. 2013;11:e1001587 pubmed publisher
  23. Hokaiwado N, Takeshita F, Naiki-Ito A, Asamoto M, Ochiya T, Shirai T. Glutathione S-transferase Pi mediates proliferation of androgen-independent prostate cancer cells. Carcinogenesis. 2008;29:1134-8 pubmed publisher
  24. Stoikos C, Harrison C, Salamonsen L, Dimitriadis E. A distinct cohort of the TGFbeta superfamily members expressed in human endometrium regulate decidualization. Hum Reprod. 2008;23:1447-56 pubmed publisher
  25. Cardoso C, Groth-Pedersen L, Høyer-Hansen M, Kirkegaard T, Corcelle E, Andersen J, et al. Depletion of kinesin 5B affects lysosomal distribution and stability and induces peri-nuclear accumulation of autophagosomes in cancer cells. PLoS ONE. 2009;4:e4424 pubmed publisher
  26. Anastasiou D, Poulogiannis G, Asara J, Boxer M, Jiang J, Shen M, et al. Inhibition of pyruvate kinase M2 by reactive oxygen species contributes to cellular antioxidant responses. Science. 2011;334:1278-83 pubmed publisher
  27. Yun J, Rago C, Cheong I, Pagliarini R, Angenendt P, Rajagopalan H, et al. Glucose deprivation contributes to the development of KRAS pathway mutations in tumor cells. Science. 2009;325:1555-9 pubmed publisher
  28. Modi B, Neustadter J, Binda E, Lewis J, Filler R, Roberts S, et al. Langerhans cells facilitate epithelial DNA damage and squamous cell carcinoma. Science. 2012;335:104-8 pubmed publisher
  29. Ahn S, Byun K, Cho K, Kim J, Yoo J, Kim D, et al. Human microglial cells synthesize albumin in brain. PLoS ONE. 2008;3:e2829 pubmed publisher
  30. Yoshida-Moriguchi T, Yu L, Stalnaker S, Davis S, Kunz S, Madson M, et al. O-mannosyl phosphorylation of alpha-dystroglycan is required for laminin binding. Science. 2010;327:88-92 pubmed publisher
  31. Castillo-Acosta V, Ruiz-Perez L, Yang W, Gonzalez-Pacanowska D, Vidal A. Identification of a residue critical for the excision of 3'-blocking ends in apurinic/apyrimidinic endonucleases of the Xth family. Nucleic Acids Res. 2009;37:1829-42 pubmed publisher
  32. Mendiburo M, Padeken J, Fülöp S, Schepers A, Heun P. Drosophila CENH3 is sufficient for centromere formation. Science. 2011;334:686-90 pubmed publisher
  33. Gatto M, Drudi-Metalli V, Torrice A, Alpini G, Cantafora A, Blotta I, et al. Insulin-like growth factor-1 isoforms in rat hepatocytes and cholangiocytes and their involvement in protection against cholestatic injury. Lab Invest. 2008;88:986-94 pubmed publisher
  34. Shoulars K, Rodriguez M, Thompson T, Turk J, Crowley J, Markaverich B. Regulation of the nitric oxide pathway genes by tetrahydrofurandiols: microarray analysis of MCF-7 human breast cancer cells. Cancer Lett. 2008;264:265-73 pubmed publisher
  35. Xu X, Kim J, Zuo Z. Isoflurane preconditioning reduces mouse microglial activation and injury induced by lipopolysaccharide and interferon-gamma. Neuroscience. 2008;154:1002-8 pubmed publisher
  36. Corlazzoli F, Rossetti S, Bistulfi G, Ren M, Sacchi N. Derangement of a factor upstream of RARalpha triggers the repression of a pleiotropic epigenetic network. PLoS ONE. 2009;4:e4305 pubmed publisher
  37. Zhang Q, Guo R, Schwarz E, Boyce B, Xing L. TNF inhibits production of stromal cell-derived factor 1 by bone stromal cells and increases osteoclast precursor mobilization from bone marrow to peripheral blood. Arthritis Res Ther. 2008;10:R37 pubmed publisher
  38. Di Certo M, Batassa E, Casella I, Serafino A, Floridi A, Passananti C, et al. Delayed internalization and lack of recycling in a beta2-adrenergic receptor fused to the G protein alpha-subunit. BMC Cell Biol. 2008;9:56 pubmed publisher
  39. Sen S, Talukdar I, Webster N. SRp20 and CUG-BP1 modulate insulin receptor exon 11 alternative splicing. Mol Cell Biol. 2009;29:871-80 pubmed publisher
  40. Corps A, Jones G, Harrall R, Curry V, Hazleman B, Riley G. The regulation of aggrecanase ADAMTS-4 expression in human Achilles tendon and tendon-derived cells. Matrix Biol. 2008;27:393-401 pubmed publisher
  41. Chamberlain S, Yee D, Magnuson T. Polycomb repressive complex 2 is dispensable for maintenance of embryonic stem cell pluripotency. Stem Cells. 2008;26:1496-505 pubmed publisher
  42. Kumar P, Bolden G, Arise K, Krazit S, Pandey K. Regulation of natriuretic peptide receptor-A gene expression and stimulation of its guanylate cyclase activity by transcription factor Ets-1. Biosci Rep. 2009;29:57-70 pubmed publisher
  43. Zoncu R, Bar-Peled L, Efeyan A, Wang S, Sancak Y, Sabatini D. mTORC1 senses lysosomal amino acids through an inside-out mechanism that requires the vacuolar H(+)-ATPase. Science. 2011;334:678-83 pubmed publisher
  44. Rao V, Krishnamoorthy R, Yorio T. Endothelin-1 mediated regulation of extracellular matrix collagens in cells of human lamina cribrosa. Exp Eye Res. 2008;86:886-94 pubmed publisher
  45. Szabo I, Bock J, Grassme H, Soddemann M, Wilker B, Lang F, et al. Mitochondrial potassium channel Kv1.3 mediates Bax-induced apoptosis in lymphocytes. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:14861-6 pubmed publisher
  46. Shin Y, Kim M, Oh J, Wee W, Lee J, Ko J, et al. Short-term Efficacy of Topical Immunosuppressive Agents on the Survival of Cultivated Allo-Conjunctival Equivalents. Korean J Ophthalmol. 2008;22:123-9 pubmed publisher
  47. Chung Y, Troy H, Kristeleit R, Aherne W, Jackson L, Atadja P, et al. Noninvasive magnetic resonance spectroscopic pharmacodynamic markers of a novel histone deacetylase inhibitor, LAQ824, in human colon carcinoma cells and xenografts. Neoplasia. 2008;10:303-13 pubmed
  48. Atapattu D, Albrecht R, McClenahan D, Czuprynski C. Dynamin-2-dependent targeting of mannheimia haemolytica leukotoxin to mitochondrial cyclophilin D in bovine lymphoblastoid cells. Infect Immun. 2008;76:5357-65 pubmed publisher
  49. Lam W, Tang J, Yeung A, Chiu L, Sung J, Chan P. Avian influenza virus A/HK/483/97(H5N1) NS1 protein induces apoptosis in human airway epithelial cells. J Virol. 2008;82:2741-51 pubmed publisher
  50. de Jesus Perez V, Alastalo T, Wu J, Axelrod J, Cooke J, Amieva M, et al. Bone morphogenetic protein 2 induces pulmonary angiogenesis via Wnt-beta-catenin and Wnt-RhoA-Rac1 pathways. J Cell Biol. 2009;184:83-99 pubmed publisher
  51. Liang M, Wendland J, Chuang D. Lithium inhibits Smad3/4 transactivation via increased CREB activity induced by enhanced PKA and AKT signaling. Mol Cell Neurosci. 2008;37:440-53 pubmed
  52. Kim Y, Sharov A, McDole K, Cheng M, Hao H, Fan C, et al. Mouse B-type lamins are required for proper organogenesis but not by embryonic stem cells. Science. 2011;334:1706-10 pubmed publisher
  53. Marshall L, Moore A, Ohki M, Kitabayashi I, Patterson D, Ornelles D. RUNX1 permits E4orf6-directed nuclear localization of the adenovirus E1B-55K protein and associates with centers of viral DNA and RNA synthesis. J Virol. 2008;82:6395-408 pubmed publisher
  54. Thomas B, Woznica I, Mierke D, Wittelsberger A, Rosenblatt M. Conformational changes in the parathyroid hormone receptor associated with activation by agonist. Mol Endocrinol. 2008;22:1154-62 pubmed publisher
  55. Honda M, Eriksson K, Zhang S, Tanaka S, Lin L, Salehi A, et al. IGFBP3 colocalizes with and regulates hypocretin (orexin). PLoS ONE. 2009;4:e4254 pubmed publisher
  56. Kam Y, Quaranta V. Cadherin-bound beta-catenin feeds into the Wnt pathway upon adherens junctions dissociation: evidence for an intersection between beta-catenin pools. PLoS ONE. 2009;4:e4580 pubmed publisher
  57. Sha Y, Pandit L, Zeng S, Eissa N. A critical role for CHIP in the aggresome pathway. Mol Cell Biol. 2009;29:116-28 pubmed publisher
  58. Godinez I, Raffatellu M, Chu H, Paixao T, Haneda T, Santos R, et al. Interleukin-23 orchestrates mucosal responses to Salmonella enterica serotype Typhimurium in the intestine. Infect Immun. 2009;77:387-98 pubmed publisher
  59. Dennehy K, Willment J, Williams D, Brown G. Reciprocal regulation of IL-23 and IL-12 following co-activation of Dectin-1 and TLR signaling pathways. Eur J Immunol. 2009;39:1379-86 pubmed publisher
  60. Ichinohe T, Lee H, Ogura Y, Flavell R, Iwasaki A. Inflammasome recognition of influenza virus is essential for adaptive immune responses. J Exp Med. 2009;206:79-87 pubmed publisher
  61. Li F, Ravetch J. Inhibitory Fcγ receptor engagement drives adjuvant and anti-tumor activities of agonistic CD40 antibodies. Science. 2011;333:1030-4 pubmed publisher
  62. Puel A, Cypowyj S, Bustamante J, Wright J, Liu L, Lim H, et al. Chronic mucocutaneous candidiasis in humans with inborn errors of interleukin-17 immunity. Science. 2011;332:65-8 pubmed publisher
  63. Bonville C, Percopo C, Dyer K, Gao J, Prussin C, Foster B, et al. Interferon-gamma coordinates CCL3-mediated neutrophil recruitment in vivo. BMC Immunol. 2009;10:14 pubmed publisher
  64. Tran T, Temkin V, Shi B, Pagliari L, Daniel S, Ferran C, et al. TNFalpha-induced macrophage death via caspase-dependent and independent pathways. Apoptosis. 2009;14:320-32 pubmed publisher
  65. Amoruso A, Bardelli C, Gunella G, Ribichini F, Brunelleschi S. A novel activity for substance P: stimulation of peroxisome proliferator-activated receptor-gamma protein expression in human monocytes and macrophages. Br J Pharmacol. 2008;154:144-52 pubmed publisher
  66. De Groot A, Moise L, McMurry J, Wambre E, Van Overtvelt L, Moingeon P, et al. Activation of natural regulatory T cells by IgG Fc-derived peptide "Tregitopes". Blood. 2008;112:3303-11 pubmed publisher
  67. Sobolev O, Stern P, Lacy-Hulbert A, Hynes R. Natural killer cells require selectins for suppression of subcutaneous tumors. Cancer Res. 2009;69:2531-9 pubmed publisher
  68. Franklin B, Parroche P, Ataíde M, Lauw F, Ropert C, de Oliveira R, et al. Malaria primes the innate immune response due to interferon-gamma induced enhancement of toll-like receptor expression and function. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:5789-94 pubmed publisher
  69. Méndez-Samperio P, Trejo A, Pérez A. Mycobacterium bovis bacillus Calmette-Guerin induces CCL5 secretion via the Toll-like receptor 2-NF-kappaB and -Jun N-terminal kinase signaling pathways. Clin Vaccine Immunol. 2008;15:277-83 pubmed
  70. Kendirgi F, Yun N, Linde N, Zacks M, Smith J, Smith J, et al. Novel linear DNA vaccines induce protective immune responses against lethal infection with influenza virus type A/H5N1. Hum Vaccin. 2008;4:410-9 pubmed
  71. Eustace A, Crown J, Clynes M, O'Donovan N. Preclinical evaluation of dasatinib, a potent Src kinase inhibitor, in melanoma cell lines. J Transl Med. 2008;6:53 pubmed publisher
  72. Dianzani C, Brucato L, Gallicchio M, Rosa A, Collino M, Fantozzi R. Celecoxib modulates adhesion of HT29 colon cancer cells to vascular endothelial cells by inhibiting ICAM-1 and VCAM-1 expression. Br J Pharmacol. 2008;153:1153-61 pubmed
  73. Karanikas V, Speletas M, Zamanakou M, Kalala F, Loules G, Kerenidi T, et al. Foxp3 expression in human cancer cells. J Transl Med. 2008;6:19 pubmed publisher
  74. Wang W, Zhao X, Wang H, Liang Y. Increased fatty acid synthase as a potential therapeutic target in multiple myeloma. J Zhejiang Univ Sci B. 2008;9:441-7 pubmed publisher
  75. Li Z, Mathew P, Yang J, Starbuck M, Zurita A, Liu J, et al. Androgen receptor-negative human prostate cancer cells induce osteogenesis in mice through FGF9-mediated mechanisms. J Clin Invest. 2008;118:2697-710 pubmed publisher
  76. Simeone A, McMurtry V, Nieves-Alicea R, Saavedra J, Keefer L, Johnson M, et al. TIMP-2 mediates the anti-invasive effects of the nitric oxide-releasing prodrug JS-K in breast cancer cells. Breast Cancer Res. 2008;10:R44 pubmed publisher
  77. Kim S, Hur W, Choi J, Kim D, Wang J, Yoon H, et al. Functional characterization of human oncoprotein gankyrin in Zebrafish. Exp Mol Med. 2009;41:8-16 pubmed
  78. Blish K, Wang W, Willingham M, Du W, Birse C, Krishnan S, et al. A human bone morphogenetic protein antagonist is down-regulated in renal cancer. Mol Biol Cell. 2008;19:457-64 pubmed
  79. Yang N, Huang J, Greshock J, Liang S, Barchetti A, Hasegawa K, et al. Transcriptional regulation of PIK3CA oncogene by NF-kappaB in ovarian cancer microenvironment. PLoS ONE. 2008;3:e1758 pubmed publisher
  80. Zhang S, MacDonald K, Baguma-Nibasheka M, Geldenhuys L, Casson A, Murphy P. Alternative splicing and differential subcellular localization of the rat FGF antisense gene product. BMC Mol Biol. 2008;9:10 pubmed publisher
  81. Dar A, Belkhiri A, El-Rifai W. The aurora kinase A regulates GSK-3beta in gastric cancer cells. Oncogene. 2009;28:866-75 pubmed publisher
  82. Barkan D, Kleinman H, Simmons J, Asmussen H, Kamaraju A, Hoenorhoff M, et al. Inhibition of metastatic outgrowth from single dormant tumor cells by targeting the cytoskeleton. Cancer Res. 2008;68:6241-50 pubmed publisher
  83. Sahin O, Frohlich H, Löbke C, Korf U, Burmester S, Majety M, et al. Modeling ERBB receptor-regulated G1/S transition to find novel targets for de novo trastuzumab resistance. BMC Syst Biol. 2009;3:1 pubmed publisher
  84. Chae Y, Kang S, Kim M, Woo J, Lee J, Chang S, et al. Human AQP5 plays a role in the progression of chronic myelogenous leukemia (CML). PLoS ONE. 2008;3:e2594 pubmed publisher
  85. Roberts A, Abaitua F, O'Hare P, McNab D, Rixon F, Pasdeloup D. Differing roles of inner tegument proteins pUL36 and pUL37 during entry of herpes simplex virus type 1. J Virol. 2009;83:105-16 pubmed publisher
  86. Konigshoff M, Balsara N, Pfaff E, Kramer M, Chrobak I, Seeger W, et al. Functional Wnt signaling is increased in idiopathic pulmonary fibrosis. PLoS ONE. 2008;3:e2142 pubmed publisher
  87. Ausseil J, Desmaris N, Bigou S, Attali R, Corbineau S, Vitry S, et al. Early neurodegeneration progresses independently of microglial activation by heparan sulfate in the brain of mucopolysaccharidosis IIIB mice. PLoS ONE. 2008;3:e2296 pubmed publisher
  88. Chiu Y, Hornsey M, Klinge L, Jørgensen L, Laval S, Charlton R, et al. Attenuated muscle regeneration is a key factor in dysferlin-deficient muscular dystrophy. Hum Mol Genet. 2009;18:1976-89 pubmed publisher
  89. Varea O, Garrido J, Dopazo A, Mendez P, Garcia-Segura L, Wandosell F. Estradiol activates beta-catenin dependent transcription in neurons. PLoS ONE. 2009;4:e5153 pubmed publisher
  90. Akpan N, Caradonna K, Chuenkova M, PereiraPerrin M. Chagas' disease parasite-derived neurotrophic factor activates cholinergic gene expression in neuronal PC12 cells. Brain Res. 2008;1217:195-202 pubmed publisher
  91. Oyama S, Yamakawa H, Sasagawa N, Hosoi Y, Futai E, Ishiura S. Dysbindin-1, a schizophrenia-related protein, functionally interacts with the DNA- dependent protein kinase complex in an isoform-dependent manner. PLoS ONE. 2009;4:e4199 pubmed publisher
  92. Sato Y, Iketani M, Kurihara Y, Yamaguchi M, Yamashita N, Nakamura F, et al. Cartilage acidic protein-1B (LOTUS), an endogenous Nogo receptor antagonist for axon tract formation. Science. 2011;333:769-73 pubmed publisher
  93. Chen Y, Honeychurch K, Yang G, Byrd C, Harver C, Hruby D, et al. Vaccinia virus p37 interacts with host proteins associated with LE-derived transport vesicle biogenesis. Virol J. 2009;6:44 pubmed publisher
  94. Johnson K, Zhu S, Tremblay M, Payette J, Wang J, Bouchez L, et al. A stem cell-based approach to cartilage repair. Science. 2012;336:717-21 pubmed publisher
  95. Tagliabracci V, Engel J, Wen J, Wiley S, Worby C, Kinch L, et al. Secreted kinase phosphorylates extracellular proteins that regulate biomineralization. Science. 2012;336:1150-3 pubmed publisher
  96. Stanley S, Gagner J, Damanpour S, Yoshida M, Dordick J, Friedman J. Radio-wave heating of iron oxide nanoparticles can regulate plasma glucose in mice. Science. 2012;336:604-8 pubmed publisher
  97. Sfeir A, de Lange T. Removal of shelterin reveals the telomere end-protection problem. Science. 2012;336:593-7 pubmed publisher
  98. Gallazzini M, Ferraris J, Burg M. GDPD5 is a glycerophosphocholine phosphodiesterase that osmotically regulates the osmoprotective organic osmolyte GPC. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:11026-31 pubmed publisher
  99. Hockings J, Degner S, Morgan S, Kemp M, Romagnolo D. Involvement of a specificity proteins-binding element in regulation of basal and estrogen-induced transcription activity of the BRCA1 gene. Breast Cancer Res. 2008;10:R29 pubmed publisher
  100. Gottipati S, Cammarata P. Mitochondrial superoxide dismutase activation with 17 beta-estradiol-treated human lens epithelial cells. Mol Vis. 2008;14:898-905 pubmed
  101. Schneider A, Garlick J, Egles C. Self-assembling peptide nanofiber scaffolds accelerate wound healing. PLoS ONE. 2008;3:e1410 pubmed publisher
  102. Horvath E, Tackett L, McCarthy A, Raman P, Brozinick J, Elmendorf J. Antidiabetogenic effects of chromium mitigate hyperinsulinemia-induced cellular insulin resistance via correction of plasma membrane cholesterol imbalance. Mol Endocrinol. 2008;22:937-50 pubmed publisher
  103. Daher A, Laraki G, Singh M, Melendez-Peña C, Bannwarth S, Peters A, et al. TRBP control of PACT-induced phosphorylation of protein kinase R is reversed by stress. Mol Cell Biol. 2009;29:254-65 pubmed publisher
  104. Horswill M, Narayan M, Warejcka D, Cirillo L, Twining S. Epigenetic silencing of maspin expression occurs early in the conversion of keratocytes to fibroblasts. Exp Eye Res. 2008;86:586-600 pubmed publisher
  105. Bonneh-Barkay D, Bissel S, Wang G, Fish K, Nicholl G, Darko S, et al. YKL-40, a marker of simian immunodeficiency virus encephalitis, modulates the biological activity of basic fibroblast growth factor. Am J Pathol. 2008;173:130-43 pubmed publisher
  106. Mancia F, Assur Z, Herman A, Siegel R, Hendrickson W. Ligand sensitivity in dimeric associations of the serotonin 5HT2c receptor. EMBO Rep. 2008;9:363-9 pubmed publisher
  107. Zeng L, Wu G, Goh K, Lee Y, Ng C, You A, et al. Saturated fatty acids modulate cell response to DNA damage: implication for their role in tumorigenesis. PLoS ONE. 2008;3:e2329 pubmed publisher
  108. Hein J, Boichuk S, Wu J, Cheng Y, Freire R, Jat P, et al. Simian virus 40 large T antigen disrupts genome integrity and activates a DNA damage response via Bub1 binding. J Virol. 2009;83:117-27 pubmed publisher
  109. Ferdous Z, Lazaro L, Iozzo R, Hook M, Grande-Allen K. Influence of cyclic strain and decorin deficiency on 3D cellularized collagen matrices. Biomaterials. 2008;29:2740-8 pubmed publisher
  110. Méndez-Samperio P, Miranda E, Trejo A. Expression and secretion of cathelicidin LL-37 in human epithelial cells after infection by Mycobacterium bovis Bacillus Calmette-Guérin. Clin Vaccine Immunol. 2008;15:1450-5 pubmed publisher
  111. Round J, Lee S, Li J, Tran G, Jabri B, Chatila T, et al. The Toll-like receptor 2 pathway establishes colonization by a commensal of the human microbiota. Science. 2011;332:974-7 pubmed publisher
  112. Vaishnava S, Yamamoto M, Severson K, Ruhn K, Yu X, Koren O, et al. The antibacterial lectin RegIIIgamma promotes the spatial segregation of microbiota and host in the intestine. Science. 2011;334:255-8 pubmed publisher
  113. Buhler L, Samara R, Guzman E, Wilson C, Krizanac-Bengez L, Janigro D, et al. Matrix metalloproteinase-7 facilitates immune access to the CNS in experimental autoimmune encephalomyelitis. BMC Neurosci. 2009;10:17 pubmed publisher
  114. Tjabringa G, Bergers M, van Rens D, de Boer R, Lamme E, Schalkwijk J. Development and validation of human psoriatic skin equivalents. Am J Pathol. 2008;173:815-23 pubmed publisher
  115. McCartney S, Thackray L, Gitlin L, Gilfillan S, Virgin H, Virgin Iv H, et al. MDA-5 recognition of a murine norovirus. PLoS Pathog. 2008;4:e1000108 pubmed publisher
  116. Beauvais D, Ell B, McWhorter A, Rapraeger A. Syndecan-1 regulates alphavbeta3 and alphavbeta5 integrin activation during angiogenesis and is blocked by synstatin, a novel peptide inhibitor. J Exp Med. 2009;206:691-705 pubmed publisher
  117. Lee K, Qian D, Rey S, Wei H, Liu J, Semenza G. Anthracycline chemotherapy inhibits HIF-1 transcriptional activity and tumor-induced mobilization of circulating angiogenic cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2353-8 pubmed publisher
  118. Shim M, Eling T. Vitamin E succinate induces NAG-1 expression in a p38 kinase-dependent mechanism. Mol Cancer Ther. 2008;7:961-71 pubmed publisher
  119. Casalbore P, Budoni M, Ricci-Vitiani L, Cenciarelli C, Petrucci G, Milazzo L, et al. Tumorigenic potential of olfactory bulb-derived human adult neural stem cells associates with activation of TERT and NOTCH1. PLoS ONE. 2009;4:e4434 pubmed publisher
  120. Scanlin H, Carroll E, Jenkins V, Balkowiec A. Endomorphin-2 is released from newborn rat primary sensory neurons in a frequency- and calcium-dependent manner. Eur J Neurosci. 2008;27:2629-42 pubmed publisher
  121. Corti D, Voss J, Gamblin S, Codoni G, Macagno A, Jarrossay D, et al. A neutralizing antibody selected from plasma cells that binds to group 1 and group 2 influenza A hemagglutinins. Science. 2011;333:850-6 pubmed publisher
  122. Han Y, Wang X, Dang Y, Zheng Y. APOBEC3G and APOBEC3F require an endogenous cofactor to block HIV-1 replication. PLoS Pathog. 2008;4:e1000095 pubmed publisher
  123. Jain M, Nilsson R, Sharma S, Madhusudhan N, Kitami T, Souza A, et al. Metabolite profiling identifies a key role for glycine in rapid cancer cell proliferation. Science. 2012;336:1040-4 pubmed publisher
  124. Wang B, Collins J, Newmark P. Functional genomic characterization of neoblast-like stem cells in larval Schistosoma mansoni. elife. 2013;2:e00768 pubmed publisher
  125. Liu B, Du H, Rutkowski R, Gartner A, Wang X. LAAT-1 is the lysosomal lysine/arginine transporter that maintains amino acid homeostasis. Science. 2012;337:351-4 pubmed publisher
  126. Iannetti A, Pacifico F, Acquaviva R, Lavorgna A, Crescenzi E, Vascotto C, et al. The neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL), a NF-kappaB-regulated gene, is a survival factor for thyroid neoplastic cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:14058-63 pubmed publisher
  127. Khandrika L, Lieberman R, Koul S, Kumar B, Maroni P, Chandhoke R, et al. Hypoxia-associated p38 mitogen-activated protein kinase-mediated androgen receptor activation and increased HIF-1alpha levels contribute to emergence of an aggressive phenotype in prostate cancer. Oncogene. 2009;28:1248-60 pubmed publisher
  128. Zhu H, Wu H, Liu X, Evans B, Medina D, Liu C, et al. Role of MicroRNA miR-27a and miR-451 in the regulation of MDR1/P-glycoprotein expression in human cancer cells. Biochem Pharmacol. 2008;76:582-8 pubmed publisher
  129. Yu L, Saile K, Swartz C, He H, Zheng X, Kissling G, et al. Differential expression of receptor tyrosine kinases (RTKs) and IGF-I pathway activation in human uterine leiomyomas. Mol Med. 2008;14:264-75 pubmed publisher
  130. Goldoni S, Seidler D, Heath J, Fassan M, Baffa R, Thakur M, et al. An antimetastatic role for decorin in breast cancer. Am J Pathol. 2008;173:844-55 pubmed publisher
  131. Qing J, Du X, Chen Y, Chan P, Li H, Wu P, et al. Antibody-based targeting of FGFR3 in bladder carcinoma and t(4;14)-positive multiple myeloma in mice. J Clin Invest. 2009;119:1216-29 pubmed publisher
  132. Xie Z, Wroblewska L, Prochazka L, Weiss R, Benenson Y. Multi-input RNAi-based logic circuit for identification of specific cancer cells. Science. 2011;333:1307-11 pubmed publisher
  133. Takayama H, Chelikani P, Reeves P, Zhang S, Khorana H. High-level expression, single-step immunoaffinity purification and characterization of human tetraspanin membrane protein CD81. PLoS ONE. 2008;3:e2314 pubmed publisher
  134. Amsili S, Zer H, Hinderlich S, Krause S, Becker-Cohen M, MacArthur D, et al. UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase (GNE) binds to alpha-actinin 1: novel pathways in skeletal muscle?. PLoS ONE. 2008;3:e2477 pubmed publisher
  135. Yang J, Zhao T, Goldstein J, Brown M. Inhibition of ghrelin O-acyltransferase (GOAT) by octanoylated pentapeptides. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:10750-5 pubmed publisher
  136. Lavender V, Chong S, Ralphs K, Wolstenholme A, Reaves B. Increasing the expression of calcium-permeable TRPC3 and TRPC7 channels enhances constitutive secretion. Biochem J. 2008;413:437-46 pubmed publisher
  137. Zhang Z, Harris D, Pandey V. The FUSE binding protein is a cellular factor required for efficient replication of hepatitis C virus. J Virol. 2008;82:5761-73 pubmed publisher
  138. Szijgyarto Z, Garedew A, Azevedo C, Saiardi A. Influence of inositol pyrophosphates on cellular energy dynamics. Science. 2011;334:802-5 pubmed publisher
  139. Verma V, Sauer T, Chan C, Zhou M, Zhang C, Maminishkis A, et al. Constancy of ERp29 expression in cultured retinal pigment epithelial cells in the Ccl2/Cx3cr1 deficient mouse model of age-related macular degeneration. Curr Eye Res. 2008;33:701-7 pubmed publisher
  140. Kowalski M, Wolska A, Grzegorczyk J, Hilt J, Jarzebska M, Drobniewski M, et al. Increased responsiveness to toll-like receptor 4 stimulation in peripheral blood mononuclear cells from patients with recent onset rheumatoid arthritis. Mediators Inflamm. 2008;2008:132732 pubmed publisher
  141. Kami D, Shiojima I, Makino H, Matsumoto K, Takahashi Y, Ishii R, et al. Gremlin enhances the determined path to cardiomyogenesis. PLoS ONE. 2008;3:e2407 pubmed publisher
  142. Bansal K, Kapoor N, Narayana Y, Puzo G, Gilleron M, Balaji K. PIM2 Induced COX-2 and MMP-9 expression in macrophages requires PI3K and Notch1 signaling. PLoS ONE. 2009;4:e4911 pubmed publisher
  143. Whitfield Z, Chisholm J, Hawley R, Orr-Weaver T. A meiosis-specific form of the APC/C promotes the oocyte-to-embryo transition by decreasing levels of the Polo kinase inhibitor matrimony. PLoS Biol. 2013;11:e1001648 pubmed publisher
  144. Makarem M, Kannan N, Nguyen L, Knapp D, Balani S, Prater M, et al. Developmental changes in the in vitro activated regenerative activity of primitive mammary epithelial cells. PLoS Biol. 2013;11:e1001630 pubmed publisher
  145. Hammond G, Fischer M, Anderson K, Holdich J, Koteci A, Balla T, et al. PI4P and PI(4,5)P2 are essential but independent lipid determinants of membrane identity. Science. 2012;337:727-30 pubmed publisher
  146. Szabó A, Papin C, Zorn D, Ponien P, Weber F, Raabe T, et al. The CK2 kinase stabilizes CLOCK and represses its activity in the Drosophila circadian oscillator. PLoS Biol. 2013;11:e1001645 pubmed publisher
  147. Hamanaka R, Bobrovnikova-Marjon E, Ji X, Liebhaber S, Diehl J. PERK-dependent regulation of IAP translation during ER stress. Oncogene. 2009;28:910-20 pubmed publisher
  148. Kitareewan S, Blumen S, Sekula D, Bissonnette R, Lamph W, Cui Q, et al. G0S2 is an all-trans-retinoic acid target gene. Int J Oncol. 2008;33:397-404 pubmed
  149. Yang H, Shen L, Siliciano R, Pomerantz J. Isolation of a cellular factor that can reactivate latent HIV-1 without T cell activation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:6321-6 pubmed publisher
  150. Yu Y, Pilgrim P, Yan J, Zhou W, Jenkins M, Gagliano N, et al. Protective CD8+ T-cell responses to cytomegalovirus driven by rAAV/GFP/IE1 loading of dendritic cells. J Transl Med. 2008;6:56 pubmed publisher
  151. Mitchell R, Lee S, Randazzo W, Simmons Z, Connor J. Influence of HFE variants and cellular iron on monocyte chemoattractant protein-1. J Neuroinflammation. 2009;6:6 pubmed publisher
  152. Che X, Reichelt M, Sommer M, Rajamani J, Zerboni L, Arvin A. Functions of the ORF9-to-ORF12 gene cluster in varicella-zoster virus replication and in the pathogenesis of skin infection. J Virol. 2008;82:5825-34 pubmed publisher
  153. Stehling O, Vashisht A, Mascarenhas J, Jonsson Z, Sharma T, Netz D, et al. MMS19 assembles iron-sulfur proteins required for DNA metabolism and genomic integrity. Science. 2012;337:195-9 pubmed publisher
  154. Castilow E, Olson M, Meyerholz D, Varga S. Differential role of gamma interferon in inhibiting pulmonary eosinophilia and exacerbating systemic disease in fusion protein-immunized mice undergoing challenge infection with respiratory syncytial virus. J Virol. 2008;82:2196-207 pubmed
  155. Tyner J, Erickson H, Deininger M, Willis S, Eide C, Levine R, et al. High-throughput sequencing screen reveals novel, transforming RAS mutations in myeloid leukemia patients. Blood. 2009;113:1749-55 pubmed publisher
  156. Nettles K, Gil G, Nowak J, Métivier R, Sharma V, Greene G. CBP Is a dosage-dependent regulator of nuclear factor-kappaB suppression by the estrogen receptor. Mol Endocrinol. 2008;22:263-72 pubmed
  157. Schroering A, Williams K. Rapid induction of chromatin-associated DNA mismatch repair proteins after MNNG treatment. DNA Repair (Amst). 2008;7:951-69 pubmed publisher
  158. Rauh A, Windischhofer W, Kovacevic A, DeVaney T, Huber E, Semlitsch M, et al. Endothelin (ET)-1 and ET-3 promote expression of c-fos and c-jun in human choriocarcinoma via ET(B) receptor-mediated G(i)- and G(q)-pathways and MAP kinase activation. Br J Pharmacol. 2008;154:13-24 pubmed publisher
  159. Smith J, Clarke P, de Billy E, Workman P. Silencing the cochaperone CDC37 destabilizes kinase clients and sensitizes cancer cells to HSP90 inhibitors. Oncogene. 2009;28:157-69 pubmed publisher
  160. Burdak-Rothkamm S, Rothkamm K, Prise K. ATM acts downstream of ATR in the DNA damage response signaling of bystander cells. Cancer Res. 2008;68:7059-65 pubmed publisher
  161. Marschner K, Kollmann K, Schweizer M, Braulke T, Pohl S. A key enzyme in the biogenesis of lysosomes is a protease that regulates cholesterol metabolism. Science. 2011;333:87-90 pubmed publisher
  162. Sprynski A, Hose D, Caillot L, Reme T, Shaughnessy J, Barlogie B, et al. The role of IGF-1 as a major growth factor for myeloma cell lines and the prognostic relevance of the expression of its receptor. Blood. 2009;113:4614-26 pubmed publisher
  163. Avinoam O, Fridman K, Valansi C, Abutbul I, Zeev-Ben-Mordehai T, Maurer U, et al. Conserved eukaryotic fusogens can fuse viral envelopes to cells. Science. 2011;332:589-92 pubmed publisher
  164. Icard V, Diaz O, Scholtes C, Perrin-Cocon L, Ramière C, Bartenschlager R, et al. Secretion of hepatitis C virus envelope glycoproteins depends on assembly of apolipoprotein B positive lipoproteins. PLoS ONE. 2009;4:e4233 pubmed publisher
  165. Fogg D, Sibon C, Miled C, Jung S, Aucouturier P, Littman D, et al. A clonogenic bone marrow progenitor specific for macrophages and dendritic cells. Science. 2006;311:83-7 pubmed
  166. Ye H, Daoud-El Baba M, Peng R, Fussenegger M. A synthetic optogenetic transcription device enhances blood-glucose homeostasis in mice. Science. 2011;332:1565-8 pubmed publisher
  167. Witherden D, Verdino P, Rieder S, Garijo O, Mills R, Teyton L, et al. The junctional adhesion molecule JAML is a costimulatory receptor for epithelial gammadelta T cell activation. Science. 2010;329:1205-10 pubmed publisher
  168. Epting C, King F, Pedersen A, Zaman J, Ritner C, Bernstein H. Stem cell antigen-1 localizes to lipid microdomains and associates with insulin degrading enzyme in skeletal myoblasts. J Cell Physiol. 2008;217:250-60 pubmed publisher
  169. Hussain K, Challis B, Rocha N, Payne F, Minic M, Thompson A, et al. An activating mutation of AKT2 and human hypoglycemia. Science. 2011;334:474 pubmed publisher
  170. Nold-Petry C, Nold M, Zepp J, Kim S, Voelkel N, Dinarello C. IL-32-dependent effects of IL-1beta on endothelial cell functions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:3883-8 pubmed publisher
  171. Slipicevic A, Jørgensen K, Skrede M, Rosnes A, Trøen G, Davidson B, et al. The fatty acid binding protein 7 (FABP7) is involved in proliferation and invasion of melanoma cells. BMC Cancer. 2008;8:276 pubmed publisher
  172. Colombani J, Andersen D, Leopold P. Secreted peptide Dilp8 coordinates Drosophila tissue growth with developmental timing. Science. 2012;336:582-5 pubmed publisher
  173. Fang S, Wei J, Pentinmikko N, Leinonen H, Salven P. Generation of functional blood vessels from a single c-kit+ adult vascular endothelial stem cell. PLoS Biol. 2012;10:e1001407 pubmed publisher
ISSN : 2329-5139