Среда для культуры клеток: Обзор
Meenakshi Arora (arormx at UPMC dot EDU)
University of Pittsburgh Medical Center, United States
Перевод
Aleksei Stepanenko (a dot a dot stepanenko at gmail dot com)
Laboratory of Biosynthesis of Nucleic Acids, Department of Functional Genomics, 150 Zabolotnogo Street, Kyiv 03680, Ukraine
DOI
//dx.doi.org/10.13070/mm.ru.3.175
Дата
последнего обновления : 2016-10-02; оригинальная версия : 2013-03-05
Цитировать как
MATER METHODS ru 2013;3:175
Абстракт

Углубленный анализ среды для культуры клеток, проведенный Labome на основании 750 публикаций.

English Abstract

A comprehensive review of cell culture media and Labome survey results on cell culture media from 750 formal publications.

Введение

Клеточная культура является одним из основных методов в области наук о жизни. Это общий термин, используемый при выделении клеток, тканей или органов из животных или растений и их последующего размещения в искусственной среде, благоприятной для выживания и/или пролиферации. Основными требованиями для оптимально роста клеток являются: контролируемая температура, субстрат для прикрепления клеток, а также соответствующая растительная среда и инкубатор, который поддерживает подходящий рН и осмоляльность. Самым важным и решающим шагом в культуре клеток является выбор соответствующей среды для культивирования in vitro. Среда для роста или культуральная среда представляет собой жидкость или гель, предназначенные для поддержания роста микроорганизмов, животных клеток или небольших растений. Среды для культивирования клеток, как правило, включают соответствующий источник энергии и соединения, регулирующие клеточный цикл. Типичная питательная среда состоит из набора аминокислот, витаминов, минеральных солей, глюкозы и сыворотки в качестве источника факторов роста, гормонов и факторов адгезии. Помимо питательных веществ среда также помогает поддерживать рН и осмоляльность.

Типы клеточных сред

Клетки животных могут культивироваться или с использованием совершенно естественных сред, или искусственных/синтетических сред наряду с некоторыми натуральными компонентами.

Тип средыПримерыИспользование
Натуральная средаБиологические жидкостиПлазма, сыворотка, лимфа, человеческая плацентарная пуповинная сыворотка, амниотическая жидкость
Экстракты тканейЭкстракт печени, селезенки, опухолей, лейкоцитов и костного мозга, экстракт бычьего эмбриона и куриного эмбриона
СгусткиКоагулянты или плазменные сгустки
Искусственная средаСбалансированные солевые растворыPBS, DPBS, HBSS, EBSSОбразуют основу сложных сред
Основная средаMEM DMEMПервичные и диплоидные культуры
Сложная средаRPMI-1640, IMDMПоддерживает широкий спектр клеток млекопитающих
Таблица 1. Виды натуральных и искусственных сред.
Натуральная среда

Натуральные среды состоят исключительно из встречающихся в природе биологических жидкостей. Натуральные среды подходят для широкого спектра клеток животных культур. Основным недостатком натуральных сред является их плохая воспроизводимость из-за отсутствия знаний об их точном составе.

Искусственная среда

Были разработаны различные искусственные среды, чтобы удовлетворить одну или несколько из следующих целей: 1) немедленное выживание клеток (сбалансированный солевой раствор со специфическим рН и осмотическим давлением); 2) увеличенная выживаемость клеток (сбалансированный солевой раствор с добавлением различного состава органических соединений и/или сыворотки); 3) бесконечный рост клеток; 4) проявление и анализ специальных функций.

Искусственные среды сгруппированы в четыре категории:

Среды, содержащие сыворотку

Эмбриональная бычья сыворотка является наиболее распространенной добавкой к культуре животных клеток. Она используется как недорогое дополнение для обеспечения оптимальной культуральной среды. Сыворотка содержит носители или сорбенты лабильных или нерастворимых в воде питательных веществ, гормонов и факторов роста, ингибиторов протеаз и связывает, и нейтрализует токсичные остатки.

Среды, не содержащие сыворотки

Наличие сыворотки в среде имеет много недостатков и может привести к неверной интерпретации результатов в иммунологических исследованиях [1, 2]. Были разработаны ряд сред, не содержащих сыворотки [3, 4]. Эти среды, как правило, специально разработаны, чтобы поддержать культуру одного типа клеток и предусматривают наличие некоторого количества очищенных факторов роста, липопротеинов и других белков, которые обычно содержатся в сыворотке [5]. Эти средства также называют «установленные культуральные среды», так как их состав известен [6, 7].

Химически определенная среда

Такая среда содержит сверхчистые неорганические и органические компоненты, а также может содержать чистые протеиновые добавки, такие как факторы роста [8]. Ее компоненты производятся в бактериях или дрожжах с помощью генной инженерии; она также содержит витамины, холестерин, специфические аминокислоты и жирные кислоты [9].

Безбелковая среда

Безбелковая среда не содержит никаких белков, а содержит только небелковые компоненты. В сравнении со средой с добавлением сыворотки, использование безбелковой среды способствует превосходному росту клеток и экспрессии белка и облегчает очистку любого экспрессируемого продукта [10-12]. Рецептуры, такие как MEM, RPMI-1640 не содержат белков, и белковые добавки вносятся, когда необходимо.

Основные компоненты культуральной среды

Питательные среды содержат смесь аминокислот, глюкозы, солей, витаминов и других питательных веществ и доступны или в виде порошка, или в жидкой форме от коммерческих поставщиков [13-17]. Требования, предъявляемые к этим компонентам, меняются в зависимости от клеточных линий, и эти различия частично объясняют наличие такого многочисленного количества сред [18]. Каждый компонент играет определенную роль, как описано ниже:

Буферные системы

Регулирование рН имеет решающее значение для достижения оптимальных условий культивирования и, как правило, достигается за счет одной из двух буферных систем:

Природная буферная система

В природной буферной системе газообразный CO2 уравновешен с CO3/HCO3 содержанием питательной среды. Культуры с естественной буферной системой необходимо поддерживать в атмосфере воздуха с 5-10% CO 2, как правило, поддерживаемой с помощью CO2 инкубатора. Естественная буферная система недорогая и нетоксичная [19, 20].

HEPES

Химическая буферизация с помощью цвиттериона, HEPES, обладает превосходной буферной емкостью в диапазоне рН 7.2-7.4 и не требует контролируемой газовой атмосферы [21]. HEPES является относительно дорогим, но он токсичен при более высокой концентрации для некоторых типов клеток. HEPES, как было показано, значительно увеличивает чувствительность среды к фототоксическим эффектам, вызванным воздействием флуоресцентного света [22].

Феноловый красный

Большинство коммерчески доступных питательных сред включают фенол красный в качестве индикатора рН, который позволяет постоянно контролировать рН [23]. В процессе роста клеток среда меняет цвет, так как рН изменяется из-за метаболитов, высвобождаемых клетками. При низких уровнях рН фенол красный становится желтым, в то время как при более высоких значениях рН среда имеет фиолетовый цвет. Среда имеет ярко-красный цвет при рН 7,4, оптимальном значении рН для культивирования клеток. Тем не менее, есть определенные недостатки использования фенола красного: 1) Фенол красный имитирует действие некоторых стероидных гормонов, в частности эстрогенов [24]. Таким образом, целесообразно использовать среды без фенола красного для исследований с использованием эстроген-чувствительных клеток, таких как ткани молочной железы. 2) Наличие фенола красного в некоторых бессывороточных средах мешает гомеостазу натрия-калия. Этот эффект можно нейтрализовать путем включения в среду сыворотки или бычьего гормона гипофиза [25]. 3) Фенол красный интерферирует в исследованиях с использованием проточной цитометрии.

Неорганическая соль

Неорганическая соль в средах помогает сохранить осмотический баланс и помогает в регулировании мембранного потенциала в качестве источника натрия, калия и ионов кальция [26].

Аминокислоты

Аминокислоты являются строительными блоками белков и, таким образом, являются обязательными составляющими всех известных сред для культивирования клеток. Незаменимые аминокислоты должны быть включены в культуральную среду, так как клетки не могут синтезировать их сами. Аминокислоты требуются для пролиферации клеток, и их концентрация определяет максимально достижимую плотность клеток. L-глутамин, незаменимая аминокислота, особенно важна [27]. L-глутамин обеспечивает азот для НАД, НАДФН и нуклеотидов и служит в качестве вторичного источника энергии для обмена веществ. L-глютамин является неустойчивой аминокислотой, которая со временем превращается в форму, которая не может быть использована клетками, и, таким образом, должен быть добавлен в среду непосредственно перед использованием [28]. Следует помнить, что добавление большого количества L-глютамина, большего, чем это предусмотрено в первоначальной формулировке среды, может быть токсичным, поскольку его деградация приводит к увеличению аммиака. Аммиак может иметь негативный эффект на некоторые клеточные линии. Концентрация L-глутамина для культивирования клеток млекопитающих может варьировать от 0,68 мМ в среде 199 до 4 мм в DMEM. Среда для клеток беспозвоночных может содержать до 12,3 мМ L-глутамина. Добавки, такие как GlutaMAX, более стабильны и могут заменить глютамин для длительного культивирования медленно растущих клеток.

Заменимые аминокислоты также могут быть добавлены в среду, чтобы заменить те, которые были истощены в процессе роста. Обогащение среды заменимыми аминокислотами стимулирует рост и увеличивает жизнеспособность клеток.

Углеводы

Углеводы в виде сахара являются основным источником энергии. Большинство сред содержат глюкозу и галактозу; однако, некоторые содержат мальтозу и фруктозу.

Белки и пептиды

Наиболее часто используемыми белками и пептидами являются альбумин, трансферрин и фибронектин. Они особенно важны в среде, не содержащей сыворотки. Сыворотка является богатым источником белков и включает в себя альбумин, трансферрин, апротинин, фетуин и фибронектин. Альбумин является основным белком крови, связывающий воду, соли, свободные жирные кислоты, гормоны и витамины, а также транспортирующий их между тканями и клетками. Связывающая способность альбумина делает его подходящим для удаления токсичных веществ из клеточной культуральной среды.

Апротинин представляет собой защитное средство в системах клеточных культур, устойчив при нейтральном и кислом рН и устойчив к высоким температурам и деградации протеолитическими ферментами. Он обладает способностью ингибировать несколько сериновых протеаз, таких как трипсин. Фетуин представляет собой гликопротеин, обнаруживаемый в эмбриональной сыворотке и сыворотке новорожденных в больших концентрациях, чем во взрослой сыворотке. Он также является ингибитором сериновых протеаз. Фибронектин является ключевым фактором в прикреплении клеток. Трансферрин представляет собой транспортный белок железа, который доставляет железо к клеточной мембране.

Жирные кислоты и липиды

Жирные кислоты и липиды особенно важны в среде, не содержащей сыворотки, в которой они, как правило, присутствуют.

Витамины

Многие витамины необходимы для роста и пролиферации клеток. Витамины не могут быть синтезированы в достаточном количестве клетками и, следовательно, их необходимо добавлять к культуре ткани. Сыворотка является основным источником витаминов в клеточной культуре, тем не менее, среда также обогащена различными витаминами, что делает ее пригодной для конкретной клеточной линии. Витамины группы В наиболее часто добавляют для стимуляции роста.

Микроэлементы

Микроэлементы часто добавляют в среду, не содержащую сыворотки, чтобы заменить те, которые обычно находятся в сыворотке крови. Микроэлементы, такие как медь, цинк, селен и промежуточные трикарбоновые кислоты являются химическими элементами, которые необходимы в малых количествах для надлежащего роста клеток [29]. Эти микроэлементы необходимы для многих биологических процессов, например, поддержания функциональности ферментов.

Добавки к среде

Полная питательная среда, рекомендуемая для определенных клеточных линий, требует дополнительных компонентов, которые не присутствуют в базальных средах и в сыворотке. Эти компоненты, добавки, помогают поддерживать пролиферацию и поддерживать нормальный клеточный метаболизм [30, 31]. Хотя добавки, такие как гормоны, факторы роста и сигнальные вещества необходимы для нормального роста некоторых клеточных линий, всегда лучше принять следующие меры предосторожности: поскольку добавление добавки может изменить осмоляльность полной ростовой среды, что может негативно повлиять на рост клеток, всегда лучше перепроверить осмоляльность после внесения добавки. Для большинства клеточных линий оптимальная осмоляльность должна быть в пределах между 260 мОсм/кг и 320 мОсм/кг.

Срок хранения среды после внесения добавок изменяется. Полная среда, содержащая белковые добавки, как правило, деградируют быстрее, чем базальная среда.

Антибиотики

Хотя и не требуются для роста клеток, антибиотики часто используются для контроля роста бактериальных и грибковых загрязнителей [32]. Регулярное использование антибиотиков для культивирования клеток не рекомендуется, так как антибиотики могут замаскировать загрязнения микоплазмы и устойчивых бактерий [33, 34]. Кроме того, антибиотики могут также влиять на метаболизм чувствительных клеток.

Сыворотка в среде

Сыворотка представляет собой сложное сочетание альбуминов, факторов роста и ингибиторов роста [35]. Сыворотка является одним из наиболее важных компонентов среды для культивирования клеток и служит в качестве источника аминокислот, белков, витаминов (особенно жирорастворимых витаминов, таких как А, D, Е и К), углеводов, липидов, гормонов, факторов роста, минеральных и микроэлементов. Сыворотку из плода теленка и крупного рогатого скота, как правило, используют для поддержки роста клеток в культуре [36]. Фетальная сыворотка является богатым источником факторов роста и подходит для клонирования клеток и для роста прихотливых клеток [37]. Телячья сыворотка используется в исследованиях контактного ингибирования из-за ее низких ростовых свойств. Обычная ростовая среда часто содержит 2-10% сыворотки. Добавление сыворотки в среду выполняет следующие функции [38] :

  • Сыворотка содержит основные питательные вещества (как в растворе, а также связанные с белками).
  • Сыворотка содержит ростовые факторы и гормоны, стимулирующие рост и специализированные функции клеток.
  • Содержит несколько связывающих белков, таких как альбумин, трансферрин, которые могут нести и другие молекулы в клетку. Например: альбумин переносит липиды, витамины, гормоны и т.д. в клетки.
  • Сыворотка является источником белков, таких как фибронектин, которые способствуют прикреплению клеток к подложке. Она также содержит факторы, которые помогают клеткам распространяться, прежде чем они начинают делиться.
  • Содержит ингибиторы протеаз, которые защищают клетки от протеолиза.
  • Содержит минералы, такие как Na +, K +, Zn2 +, Fe2 + и т.д.
  • Увеличивает вязкость среды и, таким образом, защищает клетки от механических повреждений во время перемешивания суспензионных культур.
  • Действует как буфер.

Из-за наличия как факторов роста, так и ингибиторов, роль сыворотки в культуре клеток является очень сложной. К сожалению, в дополнение к выполнению различных полезных функций использование сыворотки в культуре ткани имеет и ряд недостатков [11, 39, 40]. В таблице 2 приведены преимущества и недостатки использования сыворотки в средах [11, 39, 40].

Преимущества сыворотки в средеНедостатки сыворотки в среде
Сыворотка содержит различные факторы роста и гормоны, которые стимулируют рост и функции клетокОтсутствие единообразия в составе сыворотки
Помогает в прикреплении клетокДолжно быть сделано тестирование, чтобы поддерживать качество каждой партии перед использованием
Действует как фактор, стимулирующий миграцию клетокМожет содержать некоторые количества рост-ингибирующих факторов
Действует как буферный агент, который помогает в поддержании рН культуральной средыУвеличение риска загрязнения
Функции в качестве связывающего белкаПрисутствие сыворотки в средах может помешать очистке и выделению продуктов клеточных культур
Минимизирует механические повреждения или повреждения, вызванные вязкостью
Таблица 2. Преимущества и недостатки использования сыворотки в средах
Приготовление среды

Питательная среда доступна в трех формах от коммерческих поставщиков:

  1. Порошкообразная форма: она должна быть подготовлена и простерилизована исследователем.
  2. Концентрированная форма: разбавляется исследователем.
  3. Рабочий раствор: используется непосредственно без дальнейшей обработки

Сухая среда является наименее дорогой, но должна быть простерилизована [41]. Желательно, чтобы стерилизация прошла перед добавлением сыворотки, так как вспенивание, которое происходит в присутствии сыворотки, денатурирует белки. Эмбриональная бычья или конская сыворотка могут быть добавлены после фильтрации. Среда всегда должна быть проверена на стерильность, поместив ее в 37oC CO2 инкубатор на 72 часа перед использованием, чтобы гарантировать, что упаковка без загрязнения. Среда должна храниться при 4oC. Так как некоторые компоненты среды являются светочувствительными, ее следует хранить в темноте.

Критерии выбора среды
Клеточные линии

Выбор среды для культивирования клеток является чрезвычайно важным и существенно влияет на успех экспериментов на клеточных культурах [42]. Выбор среды зависит от типа культивируемых клеток, а также от цели культуры и ресурсов, имеющихся в лаборатории [43, 44]. Различные типы клеток имеют весьма специфические ростовые требования, поэтому наиболее подходящая среда для каждого типа клеток должна быть определена экспериментально [45-47]. В общем, всегда хорошо начать с MEM для прикрепленных клеток и RPMI-1640 для суспензий клеток. В таблице 3 приведено описание наиболее часто используемых клеточных линий и рекомендуемые питательные среды.

Клеточная линияМорфология ВидСредаПрименение
HeLa BЭпителиальнаяЧеловекMEM+ 2mM глутамин+ 10% FBS + 1% заменимые аминокислотыИзучение туморогенности и вирусов
HL60ЛимфобластнаяЧеловекRPMI 1640 + 2mM Glutamine + 10-20% FBSРазное
3T3 клон A31ФибробластнаяМышьDMEM + 2mM глутамин +5% сыворотка новорожденного теленка + 5% FBSИзучение туморогенности и вирусов
COS-7ФибробластнаяОбезьянаDMEM+ 2mM глутамин + 10% FBSЭкспрессия генов и репликация вирусов
CHOЭпителальнаяХомякHam′s F12 + 2mM глутамин + 10% FBS Экспрессия генов
HEK 293ЭпителиальнаяЧеловекEMEM (EBSS) + 2mM глутамин + 1% заменимые аминокислоты + 10% FBSТрансформация
HUVECЭндотелиальнаяЧеловекF-12 K + 10% FBS + 100 мкг/мл ГепаринАнгиогенез
JurkatЛимфобластнаяЧеловекRPMI-1640 + 10% FBSИзучение внутриклеточного сигналинга
Таблица 3. Часто используемые клеточные линии и рекомендуемые питательные среды
Первичная клеточная культура

Первичная культура клеток дает уникальную и ценную информацию, однако главным ограничением является число клеток. Для критических образцов, особенно таких, как биопсия от заболевшего человека, требуется среда высокого качества. Большинство компаний продают полную и готовую к использованию, содержащую все необходимое кондиционированную среду. Это снижает риск заражения, а также экономит время, силы и деньги, устраняя этапы подготовки питательной среды с добавками. Более того, все эти среды подвергаются всесторонним испытаниям по контролю качества, и каждая партия тщательно тестируется (стимуляция роста, отсутствие цитотоксичности, осмотическое давление и уровень рН). В таблице 4 перечислены рекомендуемые среды, продаваемые различными компаниями для часто используемых первичных клеток.

Cells Среда
Эндотелиальные клеткиEndoGRO-LS Complete Media Kit (EMD Millipore), HUVEC Basal Medium CB HUVEC (AllCells), Human Endothelial-SFM (Life Technologies), Endothelial Cell Medium (ScienCell Research Laboratories)
Клетки красного костного мозгаMarrowMAX Bone Marrow Medium (Life Technologies), Bone Marrow Medium Plus (Sigma)
Глиальные клеткиGIBCO® Astrocyte Medium
Эпителиальные клеткиEpithelial cell medium (ScienCell Research Laboratory), EpiGRO primary epithelial cells (EMD Millipore)
T клеткиHuman StemXVivo Serum-Free T cell Base Media (R&D systems), Stemline T cell Expansion Medium (Sigma Aldrich)
Гематопоэтические стволовые клеткиStemPro-34 SFM (Life Technologies), MethoCult (STEMCELL Technologies, Inc)
Table 4. Рекомендуемые среды для первичных клеток
Среды для культуры клеток

Наиболее часто используемыми питательными средами являются следующие (подробно обсуждаются в Sigma, АТСС и Life Technologies).

Eagle’s Minimum Essential Medium (EMEM)

ЕМЕМ является одной из первых широко используемых сред и была сформулирована Гарри Иглом из более простой базальной среды (BME). ЕМЕМ содержит сбалансированный солевой раствор, заменимые аминокислоты и пируват натрия. Она содержит пониженную концентрацию бикарбоната натрия (1500 мл / л) для использования с 5% CO2. Так как ЕМЕМ не является сложной средой, она, как правило, обогащается дополнительными добавками или более высоким уровнем сыворотки, что делает ее пригодной для широкого спектра клеток млекопитающих.

Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium (DMEM)

DMEM имеет почти в два раза большую концентрацию аминокислот и в четыре раза большее количество витаминов, чем ЕМЕМ, а также содержит нитрат трехвалентного железа, пируват натрия и некоторые дополнительные аминокислоты. Оригинальный состав включал 1000 мг/л глюкозы и был впервые описан для культивирования эмбриональных клеток мышей. Еще одно изменение, 4500 мг/л глюкозы, как было доказано, является оптимальным для культивирования различных типов клеток. DMEM представляет собой базальную среду и не содержит белков или рост-стимулирующих агентов. Поэтому она требует добавки, чтобы быть "полной" средой. Чаще всего это добавление 5-10% фетальной бычьей сыворотки (FBS). DMEM использует буферную систему бикарбоната натрия (3,7 г/л) и, следовательно, требует искусственный уровнь CO 2 для поддержания требуемого рН. Порошкообразная среда не содержит бикарбонат натрия, поскольку он имеет тенденцию к испарению в порошкообразном состоянии. Порошкообразная среда требует добавления 3,7 г/л бикарбоната натрия при растворении ее в воде. DMEM первоначально использовался для культивирования эмбриональных стволовых клеток мыши. Она нашла широкое применение для первичных мышиных и куриных клеток, образования вирусных бляшек и исследования контактного ингибирования.

RPMI-1640

RPMI-1640 является универсальной средой с широким спектром применения для клеток млекопитающих, особенно кроветворных клеток. RPMI-1640 была разработана в Roswell Park Memorial Институте (RPMI) в Буффало, штат Нью-Йорк. Среда RPMI-1640 является модификацией среды 5А Маккоя и была разработан для долгосрочной культуры лимфоцитов периферической крови. Среда RPMI-1640 использует буферную систему бикарбоната и отличается от среды для культивирования клеток млекопитающих тем, что имеет рН 8. Среда RPMI-1640 поддерживает рост широкого спектра клеток в суспензии и в виде монослоя. Если ее надлежащим образом дополнить сывороткой, среда RPMI-1640 имеет широкий диапазон применений для клеток млекопитающих, в том числе культур первичных человеческих лимфоцитов, протоколов слияния и роста гибридных клеток.

Питательные смеси Хэма

Они изначально были разработаны для поддержки клонального роста клеток яичника китайского хомячка (СНО). Было множество модификаций оригинального состава, включая F-12 среды более сложного состава, чем оригинальная F-10, подходящая для роста без сыворотки. Смеси были разработаны для использования с или без добавки сыворотки, в зависимости от типа клеток, которые культивируются.

Ham’s F-10: Как было показано, поддерживает рост человеческих диплоидных клеток и белых кровяных клеток для анализа хромосом.

Хэма F-12: Было показано, что поддерживать рост первичных гепатоцитов и эпителиальных клеток простаты крысы. F-12 Хэма, дополненная 25 мМ HEPES, обеспечивает более оптимальную буферизацию.

Модификация Куном среды Хэма F-12: Данная среда вмещает почти в два раза большее количество аминокислот и пирувата по сравнению с F-12, а также включает в себя аскорбиновую кислоту. Она была разработана для культивирования гибридных клеток, полученных с помощью вирусного слияния.

DMEM/F12: представляет собой смесь DMEM и среды Хэма F-12 и является чрезвычайно богатой и сложной средой. Она поддерживает рост широкого спектра типов клеток как при наличии сыворотки, так и без нее. HEPES буфер включен в состав с конечной концентрацией 15 мМ, чтобы компенсировать потери буферной емкости за счет устранения сыворотки.

Iscove’s Modified Dulbecco’s Medium (IMDM)

IMDM является сильно обогащенной синтетической средой и хорошо подходит для быстро размножающихся клеточных культур с высокой плотностью. IMDM является модификацией DMEM, содержащей селен, и имеет дополнительные аминокислоты, витамины и неорганические соли по сравнению с DMEM. Она содержит нитрат калия вместо нитрата трехвалентного железа, а также содержит HEPES и натрия пируват. Она была сформулирована для роста лимфоцитов и гибридов. Исследования показали, что IMDM может поддерживать рост мышиных В-лимфоцитов, гемопоэтическую ткань из костного мозга, В-клеток, стимулированных липополисахаридом, Т-лимфоцитов, а также множества гибридных клеток.

В таблице 5 описаны различные клеточные линии, которые можно культивировать с использованием упомянутых выше сред:

СредаТкань или клеточная линия
MEMФибробласты куриных эмбрионов, клетки СНО, эмбриональные нервные клетки, альвеолярные типы клеток, эндотелий, эпидермис, фибробласты, глия, глиома, опухоли человека, меланома
DMEMЭндотелий, альвеолярные клетки плода эпителиального типа II, желудочно-кишечные клетки, мышиная нейробластома, свиные клетки из щитовидной железы, клетки карциномы яичников, скелетные мышечные клетки, клетки Сертоли, фибробласты сирийского хомяка
RPMI-1640Т-клетки и тимоциты, гемопоэтические стволовые клетки, человеческие опухоли, линии миелоидной лейкемии человека, лимфобластоидные линии лейкозных клеток человека, мышиная миелома, лейкемия мыши, клеток печени крыс
Питательная смесь F-10 и F-12Пигментированная сетчатка глаза куриного эмбриона, кости, хрящи, жировая ткань, эмбриональные клетки легких, скелетные мышечные клетки
IMDMКостный мозг, гемопоэтические клетки-предшественники, клеточные линии лимфобластоидного лейкоза человека
Table 5. Часто используемые среды и их применение
Оптимизация среды для культивирования клеток

Сложность состава клеточной культуры является проблемой для оптимизации отдельных компонентов сред. Большинство классических сред были разработаны для малых культур с низкой плотностью и часто требуют сыворотку в качестве одного из ключевых питательных веществ. Тем не менее, в биотехнологической промышленности, где существует необходимость поддерживать высокие плотности клеток и обеспечивать увеличение клеточной продуктивности, развитие и оптимизация питательных сред имеет очень важное значение [48]. Как правило, среды для биотехнологической промышленности не содержат сыворотки и имеют гораздо более высокую концентрацию питательных веществ, чем классические среды [49, 50]. Для оптимизации сред необходимо учитывать следующие параметры:

Продукт, который должен быть получен

Тип необходимо продукта будет определять стратегию оптимизации среды.

Для быстрого наращивания клеток скорость роста клеток и их жизнеспособность являются критическими факторами. Таким образом, среда для культуры клеток должна поддерживать максимальный рост клеток и жизнеспособность при увеличивающейся плотности клеток.

Для продукции вируса необходимы не только высокая плотность клеток, но и достаточное количество питательных веществ для поддержания репликации вируса после инфекции

Для получения рекомбинантного белка также требуется высокая плотность клеток. Тем не менее, питательные вещества, необходимые для роста клеток, могут конкурировать с теми, которые необходимы для получения белков. Поэтому очень важно тщательно определить максимальную клеточную плотность, которую данная среда может поддерживать на требуемом уровне производительности. Кроме того, очень важно учитывать, что изменения в среде в процессе оптимизации не должны влиять на качество продукта.

Клеточные линии, которые будут использоваться

Некоторые клеточные линии имеют специфические пищевые потребности, такие как холестерин для клеток миеломы NS0. Нормальные диплоидные фибробласты требуют факторы прикрепления для адгезии и миграции по поверхности подложки. Они растут при гораздо более низких плотностях и, следовательно, не нуждаются в питательные веществах в больших количествах. Клетки гибридомных линий, как правило, сильно зависят от глутамина. Обычно они не имеют стационарной фазы после достижения пика плотности клеток, после чего они быстро снижают жизнеспособность. Оптимизация среды, таким образом, могла бы уменьшить снижение жизнеспособности и улучшить продукцию моноклональных антител.

Производственный процесс

Производственный процесс не только влияет на выбор клеточной среды, но и подходы к оптимизации. Используемые производственные процессы включают следующие:

Batch Process: Единственная среда используется для поддержания роста и продуктивности клеток. Поэтому среда должна быть богатой питательными веществами, но сохранять физиологические показатели для клеток.

Fed-batch: Несколько видов сред используется во время культивирования клеток в зависимости от стадии процесса. Ростовая среда составлена таким образом, чтобы она содержала меньшее количество питательных веществ, когда плотность клеток низкая во время инокуляции, но поддерживала высокие темпы роста клеток в процессе масштабного культивирования. Используют отдельную производственную питательную среду, которая имеет увеличенную концентрацию питательных веществ, когда культура достигает стадии производства.

Проблемы развития сред

Технологии питательных сред чрезвычайно продвинулись в течение последних нескольких десятилетий. Подбор хорошей клеточной культуральной среды является очень важным для производительности клеточной культуры. Сегодня задача состоит в том, чтобы разработать сложные среды, которые могут быть индивидуально оптимизированы для различных клеточных культур. Разнообразие клеточных линий и вовлечение большого количества компонентов среды делает задачу трудной. Тот факт, что многие из этих компонентов являются взаимозависимыми из-за сложности клеточных метаболических процессов, накладывает еще один уровень сложности.

Систематический анализ культуральной среды в научной литературе, проведенный Labome

Labome проводит систематический анализ survey реагентов и инструментов, цитируемых в научных публикациях. Labome проанализировал более 750 статей с цитатами клеточных культуральных сред. В таблице 6 перечислены основные виды сред и основные поставщики.

СредаКоличество публикацийПоставщикКоличество публикаций
DMEM223
Invitrogen182
Sigma25
MEM117
Invitrogen100
RPMI-1640117
Invitrogen79
Sigma14
DMEM/F1243
Invitrogen33
Ham’s F-1217
Invitrogen8
Среда Шнейдера для дрозофилы13
Invitrogen6
Sigma4
Нейробазальгая среда13
Invitrogen13
Среда Маккоя 5A9
Invitrogen6
Другие среды
Ростовая среда для эндотелиальных клеток (EGM-2 среда)8
Среда 1996
MethoCult среда5
Leibovitz's L-15 среда5
IMDM4
M2 среда4
MCDB 131 среда3
Среда для дифференцировки скелетных мышц3
TC-100 среда для насекомых3
YPD среда3
ESF 921 ростовая среда3
Epilife добавка к среде2
Express Five SF среда2
2
Среда для разделения лимфоцитов2
Ростовая среда для кератиноцитов2
M16 среда2
M9 минимальная среда2
Среда для эпителиальных клеток молочной железы2
Shields и Sang среда для насекомых2
Terrific Broth среда2
Таблица 6. Статистика использования сред в литературе и ее главные поставщики.
DMEM среда

Invitrogen является одним из основных поставщиков DMEM среды. Invitrogen DMEM среду использовали во многих исследовательских работах [51-54], [55, 56, 56-70, 70-117, 117-155, 155-218, 218-226].

DMEM среда от Sigma была процитирована множеством публикаций [56, 227-234, 234-248] и [249].

Другие поставщики также продают DMEM среду, такие как ATCC [250], Biochrom [251], Biological Industries [252], BioWhittaker [253, 254], Caisson labs [255], Cambrex Biosciences [256], Cellgro [240, 257-261], Chemicon [262], Fisher Scientific [263, 264], Hyclone [265-267], Lonza [268, 269], Mediatech [55, 122, 270-273], Nissui Pharmaceutical Co [217, 235], PAA [274, 275], PAN Biotech [276], Peprotech [277], SAFC Biosciences [278], Welgene [279] и Dundee Cell Products [280].

MEM среда

МЕМ (минимальная незаменимая среда) может быть использована для различных суспензионных и адгезивных клеток млекопитающих. Invitrogen является основным поставщиком MEM среды. Применение данной среды упомянуто во многих работах [58, 59, 63, 70, 71, 98, 99, 111, 119, 132, 162, 167, 175, 181, 182, 185, 188, 204, 227, 243, 261, 279, 281, 282, 282, 283, 283-285, 285-287, 287-290, 290, 291, 291, 292, 292-349].

Другие поставщики MEM среды были также процитированы, в том числе American Type Culture Collection [201], BioWhittaker [350], Gemini Bio-Products [351], HaartBio Ltd [352], Lonza [269, 302, 353], Mediatech [149, 354], Irvine Scientific [348] and Sigma [59, 241, 300, 355-358].

RPMI-1640 среда

Roswell Park Memorial Institute (RPMI)-1640 среда была первоначально разработана для культуры лейкозных клеток человека. Среда RPMI-1640 от Invitrogen была использована для различных клеток млекопитающих [51, 59, 63, 89, 94, 113, 114, 116, 122, 126, 132, 133, 138, 144, 155, 159, 164, 192, 199, 221, 241, 242, 250, 272, 273, 284, 302, 313, 326, 359-366, 366-373, 373, 374, 374-403].

RPMI-1640 от Sigma также часто цитируется [133, 139, 278, 404-416].

Кроме того, ATCC [175, 211, 297, 417], Athena Enzyme Systems [165], Biochrom [251], BioWhitaker [254, 418-420], Cambrex [421], Cellgro [331], CRUK [422], HyClone [184, 359, 423-425], Lonza [239, 426], Mediatech [122], Societ Prodotti Antibiotici [427], Nacalai Tesque [217] и US Biological [278] также продают RPMI-1640 среду.

DMEM/F12 среда

DMEM/F12 представляет собой смесь 1: 1 из DMEM и Хэма F-12. Это чрезвычайно богатая комплексная среда. Чаще всего данную сместь покупают в Invitrogen. Данная среда использовалась для поддержки роста широкого спектра типов клеток и изучения их биологических характеристик [69, 70, 73, 96, 127, 133, 213, 266, 268, 287, 292, 320, 381, 428-445].

Другие поставщики также продают DMEM/F12 среду, такие как Sigma [352, 408, 446-448], Kibbutz Beit-Ha'Emek [449], Mediatech [450], STEMCELL Technologies [451], Trace Biosciences [452] и Wako [318].

Ham’s F-12

Питательная смесь Хэма F-12 используется для поддержания роста СНО культуры без сыворотки, а также роста других клеток млекопитающих с сывороткой. Invitrogen предлагает различные F-12 модификации для целого ряда клеточных культур [84, 117, 125, 175, 184, 202, 204, 241].

Кроме того, среда от ATCC [384], BioSource [201], BioWhittaker [254], Gemini Bioproducts [453], Mediatech Inc [253], Roche Diagnostics [324], Sigma [126, 231] and Wako [454] также цитируется в литературе.

Нейробазальная среда

Нейробазальная среда представляет собой базальную среду, которая отвечает особым требованиям клеточной культуры посленатальных и взрослых нервных клеток. Вся нейробазальная среда, цитируемая в исследованиях, по происхождению от Invitrogen [255, 310, 322, 454-463].

Среда Шнайдера для дрозофил

Среда была первоначально разработана для роста клеток S2 от плодовой мушки, Drosophila melanogaser. Invitrogen [278, 464-468], Sigma [469-472] и другие поставщики, такие как Lonza [473], Serva [474] и US Biological [278] предлагают среду Шнайдера для дрозофил. Другой часто используемой средой для клеток дрозофилы является Gibco Express Five SF Medium [278, 475, 476].

5A среда Маккоя

5A среда Маккоя является средой общего назначения, которая поддерживает рост многих типов клеток. Invitrogen является основным поставщиком 5А среды Маккоя [140, 151, 175, 184, 477, 478]. Другие поставщики включают CellGro [417], Mediatech [149] и Promocell GmBH [151].

Другие среды

Другие среды, которые цитировали, включают YPD среду [335, 479, 480] для роста дрожжей, TC-100 среда [466, 481, 482] для культур клеток насекомых, EGM-2 среда [192, 483-489] для эндотелиальных клеток, Среда 199 [55, 259, 367, 490-492], IMDM [361, 422, 493, 494], Terrific Broth среда [123, 479], среда для дифференцировки мышечных клеток [100, 495], Shields и Sang среда для насекомых [496, 497], MethoCult среда [128, 498-501], M9 минимальная среда [296, 502], среда для роста эпителиальных клеток молочной железы [125, 158], MCDB 131 среда [93, 503, 504], M2 среда [275, 505-507], среда для разделения лимфоцитов [508, 509], M16 среда [505, 506], среда для роста кератиноцитов [126, 137], Leibovitz's L-15 среда [70, 83, 175, 510, 511], Insect Xpress среда [473], Epilife добавка к среде [194], ESF 921 ростовая среда [473, 512], Express Five SF среда [475, 476], 1 ITS жидкая добавка к среде [513], AIMV среда [494], Barbour-Stoenner-Kelly-H (BSK-H) среда [514], BBL Brewers модифицированная тиогликолатная среда [515], BGJ среда [132], BioWhittaker Ultraculture среда [121], BMGY среда [516], среда для роста бронхиальных эпителиальных клеток [149], Broth Heart Infusion среда [284], Cellgro среда для разделения лимфоцитов [408], CnT07 среда [353], EPC среда [517], ESGRO Complete PLUS Clonal Grade среда [167], Ex-CELL 400 среда [518], explant среда [55], Graces культуральная среда для насекомых [519], HBSS среда [284, 520], HCMTM среда для гепатоцитов [521], Hibernate E среда [522], Histopaque density среда [509], Hybridoma SFM среда [267], HyQ-SFX insect serum free среда [510], Insect Medium Supplement [523], IPL-41 среда [524], LHC-8 среда [58], LHC-9 среда [525], Linsmaier and Skoog (LS) среда [526], M17 среда [527], M3:10 среда [528], MCDB153 среда [529], Среда 200 [291], среда для мезенхимальных стволовых клеток [266], MesenPro среда [530], среда, не содержащая метионин и цистеин [531], среда для мезенхимальных стволовых клеток [517], N1 добавка к среде [300], PrEC среда [532], базальная среда для почечных эпителиальных клеток [151], богатая среда [533], S2 среда [523], Sabouraud декстрозная среда [534], бессывороточная произвольная среда [535], бессывороточная среда, содержащая Neurobasal-A среду [536], бессывороточная N2.1 среда [408], SFM4CHO среда [537], SFX-Insect среда [538], среда для скелетных мышечных клеток [279], sStemSpan SFEM среда [539], тиогликолатная среда [374], среда кондиционированных Т-лимфоцитов [540], VP-SFM среда [362], YNB среда [335], среда для дифференцировки адипоцитов [347], среда для дифференцировки хондроцитов [347], EGM-2 среда [211],M3434 среда на осное метилцеллюлозы [541], Mesencult среда [347], Murashige и Skoog среда [542].

Ссылки
  1. Kerbel R, Blakeslee D. Rapid adsorption of a foetal calf serum component by mammalian cells in culture. A potential source of artifacts in studies of antisera to cell-specific antigens. Immunology. 1976;31:881-91 pubmed
  2. Sula K, Draber P, Nouza K. Addition of serum to the medium used for preparation of cell suspensions as a possible source of artifacts in cell-mediated reactions studied by means of the popliteal lymph node test. J Immunogenet. 1980;7:483-9 pubmed
  3. Mariani E, Mariani A, Monaco M, Lalli E, Vitale M, Facchini A. Commercial serum-free media: hybridoma growth and monoclonal antibody production. J Immunol Methods. 1991;145:175-83 pubmed
  4. Barnes D, Sato G. Methods for growth of cultured cells in serum-free medium. Anal Biochem. 1980;102:255-70 pubmed
  5. Iscove N, Melchers F. Complete replacement of serum by albumin, transferrin, and soybean lipid in cultures of lipopolysaccharide-reactive B lymphocytes. J Exp Med. 1978;147:923-33 pubmed
  6. Waymouth C. Получение и использование бессывороточной культуральной среды. In: Barnes DW, Sirbasku DA, Sato GH, editors. Методы получения сред, добавок и субстратов для бессывороточной культуры клеток животных. New York: Liss; 1984.
  7. Mendelson J, Caviles A Jr, Castagnola J. Культура лимфоцитов человека в среде без сыворотки. In: Barnes DW, Sirbasku DA, Sato GH, editors. Методы для бессывороточной культуры нейронов и лимфоидных клеток. New York: Liss; 1984.
  8. Nagle S. Heat-stable chemically defined medium for growth of animal cells in suspension. Appl Microbiol. 1968;16:53-5 pubmed
  9. Stoll T, Muhlethaler K, von Stockar U, Marison I. Systematic improvement of a chemically-defined protein-free medium for hybridoma growth and monoclonal antibody production. J Biotechnol. 1996;45:111-23 pubmed
  10. Darfler F. A protein-free medium for the growth of hybridomas and other cells of the immune system. In Vitro Cell Dev Biol. 1990;26:769-78 pubmed
  11. Barnes D, Sato G. Serum-free cell culture: a unifying approach. Cell. 1980;22:649-55 pubmed
  12. Hamilton W, Ham R. Clonal growth of chinese hamster cell lines in protein-free media. In Vitro. 1977;13:537-47 pubmed
  13. Freshney RI. Культура клеток животных: Руководство по базовой технике. 5th ed. New York: Wiley; 2005.
  14. Freshney RI. Основные принципы клеточной культуры. Hoboken: John Wiley and Sons; 2006.
  15. Ham RG, MeKeehan WL. Питательные требования для клонального роста нетрансформированных клеток. In: Katsuta H, editor. Питательные требования культивируемых клеток. Baltimore: University Park Press; 1978.
  16. Ham R, McKeehan W. Media and growth requirements. Methods Enzymol. 1979;58:44-93 pubmed
  17. Heby O, Emanuelsson H. Role of the polyamines in germ cell differentiation and in early embryonic development. Med Biol. 1981;59:417-22 pubmed
  18. Eagle H. Nutrition needs of mammalian cells in tissue culture. Science. 1955;122:501-14 pubmed
  19. Howorth P. The physiological assessment of acid-base balance. Br J Dis Chest. 1975;69:75-102 pubmed
  20. Rothblat GH, Cristofalo VJ. Growth, Рост, питание и метаболизм клеток в культуре. New York: Academic Press; 1972.
  21. Shipman C. Evaluation of 4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineëthanesulfonic acid (HEPES) as a tissue culture buffer. Proc Soc Exp Biol Med. 1969;130:305-10 pubmed
  22. Zigler J, Lepe-Zuniga J, Vistica B, Gery I. Analysis of the cytotoxic effects of light-exposed HEPES-containing culture medium. In Vitro Cell Dev Biol. 1985;21:282-7 pubmed
  23. Reznikov B. [Incubation of Brucella on solid nutrient media with a phenol red indicator]. Veterinariia. 1972;7:109-10 pubmed
  24. Berthois Y, Katzenellenbogen J, Katzenellenbogen B. Phenol red in tissue culture media is a weak estrogen: implications concerning the study of estrogen-responsive cells in culture. Proc Natl Acad Sci U S A. 1986;83:2496-500 pubmed
  25. Karmiol S. Разработка бессывороточной среды. In: Master JRW, editor. Animal Cell culture, 3rd ed. Oxford:Oxford University Press; 2000.
  26. Cinatl J. Inorganic-organic multimolecular complexes of salt solutions, culture media and biological fluids and their possible significance for the origin of life. J Theor Biol. 1969;23:1-10 pubmed
  27. Lane C, Pax R, Bennett J. L-glutamine: an amino acid required for maintenance of the tegumental membrane potential of Schistosoma mansoni. Parasitology. 1987;94:233-42 pubmed
  28. Pasieka A, Morgan J. Glutamine metabolism of normal and malignant cells cultivated in synthetic media. Nature. 1959;183:1201-2 pubmed
  29. Sternberg J, Benoit J, Mercier A, PAQUETTE J. ROLE OF SOME TRACE ELEMENTS (ZINC AND COBALT) IN THE GROWTH OF B.C.G. Rev Can Biol. 1964;23:353-65 pubmed
  30. Bettger W, Boyce S, Walthall B, Ham R. Rapid clonal growth and serial passage of human diploid fibroblasts in a lipid-enriched synthetic medium supplemented with epidermal growth factor, insulin, and dexamethasone. Proc Natl Acad Sci U S A. 1981;78:5588-92 pubmed
  31. Bottenstein J, Hayashi I, Hutchings S, Masui H, Mather J, McClure D, et al. The growth of cells in serum-free hormone-supplemented media. Methods Enzymol. 1979;58:94-109 pubmed
  32. Perlman D. Use of antibiotics in cell culture media. Methods Enzymol. 1979;58:110-6 pubmed
  33. McGarrity G. Spread and control of mycoplasmal infection of cell cultures. In Vitro. 1976;12:643-8 pubmed
  34. Masters J, Stacey G. Changing medium and passaging cell lines. Nat Protoc. 2007;2:2276-84 pubmed
  35. Lane B, Miller S. Preparation of large numbers of uniform tracheal organ cultures for long term studies. I. Effects of serum on establishment in culture. In Vitro. 1976;12:147-54 pubmed
  36. von Seefried A, Macmorine H. The use of foetal, calf and adult bovine sera for the growth of serially subcultivated diploid cells. Dev Biol Stand. 1976;37:83-9 pubmed
  37. Hornsby P, Sturek M, Harris S, Simonian M. Serum and growth factor requirements for proliferation of human adrenocortical cells in culture: comparison with bovine adrenocortical cells. In Vitro. 1983;19:863-9 pubmed
  38. Kragh-Hansen U. Molecular aspects of ligand binding to serum albumin. Pharmacol Rev. 1981;33:17-53 pubmed
  39. Ulreich J, Chvapil M. Altered activity in cultured cells caused by contaminants in tubes widely used for blood collection and serum preparation. In Vitro. 1982;18:117-21 pubmed
  40. Sandstrom C, Miller W, Papoutsakis E. Serum-free media for cultures of primitive and mature hematopoietic cells. Biotechnol Bioeng. 1994;43:706-33 pubmed
  41. Kenny C, Diena B, Greenberg L. Autoclaving: a modification in the preparation of tissue culture medium 199. Can J Microbiol. 1972;18:272-3 pubmed
  42. Weller T, Wheeldon S. The cultivation in vitro of cells derived from adult Schistosoma mansoni. I. Methodology; criteria for evaluation of cultures; and development of media. Am J Trop Med Hyg. 1982;31:335-48 pubmed
  43. Yang H. [Selection of culture media for human and rabbit corneal epithelia]. Zhonghua Yan Ke Za Zhi. 1991;27:351-3 pubmed
  44. Clifford W, Anellis A, Ross E. Evaluation of media, time and temperature of incubation, and method of enumeration of several strains fo Clostridium perfringens spores. Appl Microbiol. 1974;27:784-92 pubmed
  45. Sato JD, Hayashi I, Hayashi J, Hoshi H, Kawamoto T, McKeehan WL et al. Типы клеток и их требования. In: Davis JM, editor. Клеточная культура: практический подход. Oxford: Oxford University Press; 1994.
  46. Schumpp B, Schlaeger E. Optimization of culture conditions for high cell density proliferation of HL-60 human promyelocytic leukemia cells. J Cell Sci. 1990;97:639-47 pubmed
  47. McKeehan W, Barnes D, Reid L, Stanbridge E, Murakami H, Sato G. Frontiers in mammalian cell culture. In Vitro Cell Dev Biol. 1990;26:9-23 pubmed
  48. Chambers S, Swalley S. Designing experiments for high-throughput protein expression. Methods Mol Biol. 2009;498:19-29 pubmed publisher
  49. Keen M, Rapson N. Development of a serum-free culture medium for the large scale production of recombinant protein from a Chinese hamster ovary cell line. Cytotechnology. 1995;17:153-63 pubmed publisher
  50. Jayme D, Watanabe T, Shimada T. Basal medium development for serum-free culture: a historical perspective. Cytotechnology. 1997;23:95-101 pubmed publisher
  51. Shah S, Blumen S, Pitha-Rowe I, Kitareewan S, Freemantle S, Feng Q, et al. UBE1L represses PML/RAR{alpha} by targeting the PML domain for ISG15ylation. Mol Cancer Ther. 2008;7:905-14 pubmed publisher
  52. Schulz C, Gomez Perdiguero E, Chorro L, Szabo-Rogers H, Cagnard N, Kierdorf K, et al. A lineage of myeloid cells independent of Myb and hematopoietic stem cells. Science. 2012;336:86-90 pubmed publisher
  53. Di Certo M, Batassa E, Casella I, Serafino A, Floridi A, Passananti C, et al. Delayed internalization and lack of recycling in a beta2-adrenergic receptor fused to the G protein alpha-subunit. BMC Cell Biol. 2008;9:56 pubmed publisher
  54. Kumar P, Bolden G, Arise K, Krazit S, Pandey K. Regulation of natriuretic peptide receptor-A gene expression and stimulation of its guanylate cyclase activity by transcription factor Ets-1. Biosci Rep. 2009;29:57-70 pubmed publisher
  55. Hirota T, Lee J, St John P, Sawa M, Iwaisako K, Noguchi T, et al. Identification of small molecule activators of cryptochrome. Science. 2012;337:1094-7 pubmed publisher
  56. Lamia K, Sachdeva U, DiTacchio L, Williams E, Alvarez J, Egan D, et al. AMPK regulates the circadian clock by cryptochrome phosphorylation and degradation. Science. 2009;326:437-40 pubmed publisher
  57. Mauger D, Lin C, Garcia-Blanco M. hnRNP H and hnRNP F complex with Fox2 to silence fibroblast growth factor receptor 2 exon IIIc. Mol Cell Biol. 2008;28:5403-19 pubmed publisher
  58. Kitareewan S, Blumen S, Sekula D, Bissonnette R, Lamph W, Cui Q, et al. G0S2 is an all-trans-retinoic acid target gene. Int J Oncol. 2008;33:397-404 pubmed
  59. Hokaiwado N, Takeshita F, Naiki-Ito A, Asamoto M, Ochiya T, Shirai T. Glutathione S-transferase Pi mediates proliferation of androgen-independent prostate cancer cells. Carcinogenesis. 2008;29:1134-8 pubmed publisher
  60. Corps A, Jones G, Harrall R, Curry V, Hazleman B, Riley G. The regulation of aggrecanase ADAMTS-4 expression in human Achilles tendon and tendon-derived cells. Matrix Biol. 2008;27:393-401 pubmed publisher
  61. Tagliabracci V, Engel J, Wen J, Wiley S, Worby C, Kinch L, et al. Secreted kinase phosphorylates extracellular proteins that regulate biomineralization. Science. 2012;336:1150-3 pubmed publisher
  62. Liu Y, Li N, You L, Liu X, Li H, Wang X. HSP70 is associated with endothelial activation in placental vascular diseases. Mol Med. 2008;14:561-6 pubmed publisher
  63. Zhou B, Liu J, Wang Q, Liu X, Li X, Li P, et al. The nucleocapsid protein of severe acute respiratory syndrome coronavirus inhibits cell cytokinesis and proliferation by interacting with translation elongation factor 1alpha. J Virol. 2008;82:6962-71 pubmed publisher
  64. Dilly A, Rajala R. Insulin growth factor 1 receptor/PI3K/AKT survival pathway in outer segment membranes of rod photoreceptors. Invest Ophthalmol Vis Sci. 2008;49:4765-73 pubmed publisher
  65. Zhang D, Fan G, Zhou X, Zhao T, Pasha Z, Xu M, et al. Over-expression of CXCR4 on mesenchymal stem cells augments myoangiogenesis in the infarcted myocardium. J Mol Cell Cardiol. 2008;44:281-92 pubmed publisher
  66. Zhang S, MacDonald K, Baguma-Nibasheka M, Geldenhuys L, Casson A, Murphy P. Alternative splicing and differential subcellular localization of the rat FGF antisense gene product. BMC Mol Biol. 2008;9:10 pubmed publisher
  67. Ahn S, Byun K, Cho K, Kim J, Yoo J, Kim D, et al. Human microglial cells synthesize albumin in brain. PLoS ONE. 2008;3:e2829 pubmed publisher
  68. Walker M, Brown R, Cronin T, Robinson P. Photochemistry of retinal chromophore in mouse melanopsin. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:8861-5 pubmed publisher
  69. Misawa T, Arima K, Mizusawa H, Satoh J. Close association of water channel AQP1 with amyloid-beta deposition in Alzheimer disease brains. Acta Neuropathol. 2008;116:247-60 pubmed publisher
  70. Panigone S, Hsieh M, Fu M, Persani L, Conti M. Luteinizing hormone signaling in preovulatory follicles involves early activation of the epidermal growth factor receptor pathway. Mol Endocrinol. 2008;22:924-36 pubmed publisher
  71. Nerenz R, Martowicz M, Pike J. An enhancer 20 kilobases upstream of the human receptor activator of nuclear factor-kappaB ligand gene mediates dominant activation by 1,25-dihydroxyvitamin D3. Mol Endocrinol. 2008;22:1044-56 pubmed publisher
  72. Sonnberg S, Seet B, Pawson T, Fleming S, Mercer A. Poxvirus ankyrin repeat proteins are a unique class of F-box proteins that associate with cellular SCF1 ubiquitin ligase complexes. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:10955-60 pubmed publisher
  73. Kerkis I, Ambrosio C, Kerkis A, Martins D, Zucconi E, Fonseca S, et al. Early transplantation of human immature dental pulp stem cells from baby teeth to golden retriever muscular dystrophy (GRMD) dogs: Local or systemic?. J Transl Med. 2008;6:35 pubmed publisher
  74. Ausseil J, Desmaris N, Bigou S, Attali R, Corbineau S, Vitry S, et al. Early neurodegeneration progresses independently of microglial activation by heparan sulfate in the brain of mucopolysaccharidosis IIIB mice. PLoS ONE. 2008;3:e2296 pubmed publisher
  75. Schneider A, Garlick J, Egles C. Self-assembling peptide nanofiber scaffolds accelerate wound healing. PLoS ONE. 2008;3:e1410 pubmed publisher
  76. Southwell A, Khoshnan A, Dunn D, Bugg C, Lo D, Patterson P. Intrabodies binding the proline-rich domains of mutant huntingtin increase its turnover and reduce neurotoxicity. J Neurosci. 2008;28:9013-20 pubmed publisher
  77. Maitra R, Clement C, Crisi G, Cobelli N, Santambrogio L. Immunogenecity of modified alkane polymers is mediated through TLR1/2 activation. PLoS ONE. 2008;3:e2438 pubmed publisher
  78. Nettles K, Gil G, Nowak J, Métivier R, Sharma V, Greene G. CBP Is a dosage-dependent regulator of nuclear factor-kappaB suppression by the estrogen receptor. Mol Endocrinol. 2008;22:263-72 pubmed
  79. Konigshoff M, Balsara N, Pfaff E, Kramer M, Chrobak I, Seeger W, et al. Functional Wnt signaling is increased in idiopathic pulmonary fibrosis. PLoS ONE. 2008;3:e2142 pubmed publisher
  80. Wang B, Wei H, Yuan J, Li Q, Li Y, Li N, et al. Identification of a surface protein from Lactobacillus reuteri JCM1081 that adheres to porcine gastric mucin and human enterocyte-like HT-29 cells. Curr Microbiol. 2008;57:33-8 pubmed publisher
  81. Peralta-Ramirez J, Hernandez J, Manning-Cela R, Luna-Munoz J, Garcia-Tovar C, Nougayrede J, et al. EspF Interacts with nucleation-promoting factors to recruit junctional proteins into pedestals for pedestal maturation and disruption of paracellular permeability. Infect Immun. 2008;76:3854-68 pubmed publisher
  82. Horvath E, Tackett L, McCarthy A, Raman P, Brozinick J, Elmendorf J. Antidiabetogenic effects of chromium mitigate hyperinsulinemia-induced cellular insulin resistance via correction of plasma membrane cholesterol imbalance. Mol Endocrinol. 2008;22:937-50 pubmed publisher
  83. Naderi A, Hughes-Davies L. A functionally significant cross-talk between androgen receptor and ErbB2 pathways in estrogen receptor negative breast cancer. Neoplasia. 2008;10:542-8 pubmed
  84. Giannopoulou M, Dai C, Tan X, Wen X, Michalopoulos G, Liu Y. Hepatocyte growth factor exerts its anti-inflammatory action by disrupting nuclear factor-kappaB signaling. Am J Pathol. 2008;173:30-41 pubmed publisher
  85. Yasuoka H, Kodama R, Hirokawa M, Takamura Y, Miyauchi A, Sanke T, et al. CXCR4 expression in papillary thyroid carcinoma: induction by nitric oxide and correlation with lymph node metastasis. BMC Cancer. 2008;8:274 pubmed publisher
  86. Mazurkiewicz P, Thomas J, Thompson J, Liu M, Arbibe L, Sansonetti P, et al. SpvC is a Salmonella effector with phosphothreonine lyase activity on host mitogen-activated protein kinases. Mol Microbiol. 2008;67:1371-83 pubmed publisher
  87. Xu L, Xiao N, Liu F, Ren H, Gu J. Inhibition of RIG-I and MDA5-dependent antiviral response by gC1qR at mitochondria. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:1530-5 pubmed publisher
  88. Fallon J, Baker M, Xiong L, Loy R, Yang G, Dirksen R, et al. Crystal structure of dimeric cardiac L-type calcium channel regulatory domains bridged by Ca2+* calmodulins. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:5135-40 pubmed publisher
  89. Shao G, Patterson-Fortin J, Messick T, Feng D, Shanbhag N, Wang Y, et al. MERIT40 controls BRCA1-Rap80 complex integrity and recruitment to DNA double-strand breaks. Genes Dev. 2009;23:740-54 pubmed publisher
  90. Kodani A, Kristensen I, Huang L, Sutterlin C. GM130-dependent control of Cdc42 activity at the Golgi regulates centrosome organization. Mol Biol Cell. 2009;20:1192-200 pubmed publisher
  91. Kam Y, Quaranta V. Cadherin-bound beta-catenin feeds into the Wnt pathway upon adherens junctions dissociation: evidence for an intersection between beta-catenin pools. PLoS ONE. 2009;4:e4580 pubmed publisher
  92. Scorah J, McGowan C. Claspin and Chk1 regulate replication fork stability by different mechanisms. Cell Cycle. 2009;8:1036-43 pubmed
  93. Chabot C, Spring K, Gratton J, Elchebly M, Royal I. New role for the protein tyrosine phosphatase DEP-1 in Akt activation and endothelial cell survival. Mol Cell Biol. 2009;29:241-53 pubmed publisher
  94. Franklin B, Parroche P, Ataíde M, Lauw F, Ropert C, de Oliveira R, et al. Malaria primes the innate immune response due to interferon-gamma induced enhancement of toll-like receptor expression and function. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:5789-94 pubmed publisher
  95. Honda M, Eriksson K, Zhang S, Tanaka S, Lin L, Salehi A, et al. IGFBP3 colocalizes with and regulates hypocretin (orexin). PLoS ONE. 2009;4:e4254 pubmed publisher
  96. Mitchell R, Lee S, Randazzo W, Simmons Z, Connor J. Influence of HFE variants and cellular iron on monocyte chemoattractant protein-1. J Neuroinflammation. 2009;6:6 pubmed publisher
  97. Icard V, Diaz O, Scholtes C, Perrin-Cocon L, Ramière C, Bartenschlager R, et al. Secretion of hepatitis C virus envelope glycoproteins depends on assembly of apolipoprotein B positive lipoproteins. PLoS ONE. 2009;4:e4233 pubmed publisher
  98. Seder C, Hartojo W, Lin L, Silvers A, Wang Z, Thomas D, et al. Upregulated INHBA expression may promote cell proliferation and is associated with poor survival in lung adenocarcinoma. Neoplasia. 2009;11:388-96 pubmed
  99. Kitamura N, Araya R, Kudoh M, Kishida H, Kimura T, Murayama M, et al. Beneficial effects of estrogen in a mouse model of cerebrovascular insufficiency. PLoS ONE. 2009;4:e5159 pubmed publisher
  100. Holt I, Jacquemin V, Fardaei M, Sewry C, Butler-Browne G, Furling D, et al. Muscleblind-like proteins: similarities and differences in normal and myotonic dystrophy muscle. Am J Pathol. 2009;174:216-27 pubmed publisher
  101. Kim S, Hur W, Choi J, Kim D, Wang J, Yoon H, et al. Functional characterization of human oncoprotein gankyrin in Zebrafish. Exp Mol Med. 2009;41:8-16 pubmed
  102. Takikita S, Myerowitz R, Zaal K, Raben N, Plotz P. Murine muscle cell models for Pompe disease and their use in studying therapeutic approaches. Mol Genet Metab. 2009;96:208-17 pubmed publisher
  103. Efeyan A, Murga M, Martinez-Pastor B, Ortega-Molina A, Soria R, Collado M, et al. Limited role of murine ATM in oncogene-induced senescence and p53-dependent tumor suppression. PLoS ONE. 2009;4:e5475 pubmed publisher
  104. Berger K, Lindh R, Wierup N, Zmuda-Trzebiatowska E, Lindqvist A, Manganiello V, et al. Phosphodiesterase 3B is localized in caveolae and smooth ER in mouse hepatocytes and is important in the regulation of glucose and lipid metabolism. PLoS ONE. 2009;4:e4671 pubmed publisher
  105. Galvez A, Duran A, Linares J, Pathrose P, Castilla E, Abu-Baker S, et al. Protein kinase Czeta represses the interleukin-6 promoter and impairs tumorigenesis in vivo. Mol Cell Biol. 2009;29:104-15 pubmed publisher
  106. Leaner V, Chick J, Donninger H, Linniola I, Mendoza A, Khanna C, et al. Inhibition of AP-1 transcriptional activity blocks the migration, invasion, and experimental metastasis of murine osteosarcoma. Am J Pathol. 2009;174:265-75 pubmed publisher
  107. Maklad A, Nicolai J, Bichsel K, Evenson J, Lee T, Threadgill D, et al. The EGFR is required for proper innervation to the skin. J Invest Dermatol. 2009;129:690-8 pubmed publisher
  108. Guzman-Ayala M, Lee K, Mavrakis K, Goggolidou P, Norris D, Episkopou V. Graded Smad2/3 activation is converted directly into levels of target gene expression in embryonic stem cells. PLoS ONE. 2009;4:e4268 pubmed publisher
  109. Martín Caballero I, Hansen J, Leaford D, Pollard S, Hendrich B. The methyl-CpG binding proteins Mecp2, Mbd2 and Kaiso are dispensable for mouse embryogenesis, but play a redundant function in neural differentiation. PLoS ONE. 2009;4:e4315 pubmed publisher
  110. Wang W, Pan H, Murray K, Jefferson B, Li Y. Matrix metalloproteinase-1 promotes muscle cell migration and differentiation. Am J Pathol. 2009;174:541-9 pubmed publisher
  111. Maciejewska I, Qin D, Huang B, Sun Y, Mues G, Svoboda K, et al. Distinct compartmentalization of dentin matrix protein 1 fragments in mineralized tissues and cells. Cells Tissues Organs. 2009;189:186-91 pubmed publisher
  112. Lee Y, Lan Tran H, Van Ta Q. Regulation of expression of matrix metalloproteinase-9 by JNK in Raw 264.7 cells: presence of inhibitory factor(s) suppressing MMP-9 induction in serum and conditioned media. Exp Mol Med. 2009;41:259-68 pubmed publisher
  113. Kepp O, Gottschalk K, Churin Y, Rajalingam K, Brinkmann V, Machuy N, et al. Bim and Bmf synergize to induce apoptosis in Neisseria gonorrhoeae infection. PLoS Pathog. 2009;5:e1000348 pubmed publisher
  114. Hernanz-Falcón P, Joffre O, Williams D, Reis E Sousa C. Internalization of Dectin-1 terminates induction of inflammatory responses. Eur J Immunol. 2009;39:507-13 pubmed publisher
  115. Granja A, Sánchez E, Sabina P, Fresno M, Revilla Y. African swine fever virus blocks the host cell antiviral inflammatory response through a direct inhibition of PKC-theta-mediated p300 transactivation. J Virol. 2009;83:969-80 pubmed publisher
  116. Li F, Ravetch J. Inhibitory Fcγ receptor engagement drives adjuvant and anti-tumor activities of agonistic CD40 antibodies. Science. 2011;333:1030-4 pubmed publisher
  117. Moon B, Yoon J, Kim M, Lee S, Choi T, Choi K. Bone morphogenetic protein 4 stimulates neuronal differentiation of neuronal stem cells through the ERK pathway. Exp Mol Med. 2009;41:116-25 pubmed
  118. Ye H, Daoud-El Baba M, Peng R, Fussenegger M. A synthetic optogenetic transcription device enhances blood-glucose homeostasis in mice. Science. 2011;332:1565-8 pubmed publisher
  119. Marschner K, Kollmann K, Schweizer M, Braulke T, Pohl S. A key enzyme in the biogenesis of lysosomes is a protease that regulates cholesterol metabolism. Science. 2011;333:87-90 pubmed publisher
  120. Paige J, Wu K, Jaffrey S. RNA mimics of green fluorescent protein. Science. 2011;333:642-6 pubmed publisher
  121. Hussain K, Challis B, Rocha N, Payne F, Minic M, Thompson A, et al. An activating mutation of AKT2 and human hypoglycemia. Science. 2011;334:474 pubmed publisher
  122. Anastasiou D, Poulogiannis G, Asara J, Boxer M, Jiang J, Shen M, et al. Inhibition of pyruvate kinase M2 by reactive oxygen species contributes to cellular antioxidant responses. Science. 2011;334:1278-83 pubmed publisher
  123. Meister S, Plouffe D, Kuhen K, Bonamy G, Wu T, Barnes S, et al. Imaging of Plasmodium liver stages to drive next-generation antimalarial drug discovery. Science. 2011;334:1372-7 pubmed publisher
  124. Szijgyarto Z, Garedew A, Azevedo C, Saiardi A. Influence of inositol pyrophosphates on cellular energy dynamics. Science. 2011;334:802-5 pubmed publisher
  125. Kessler J, Kahle K, Sun T, Meerbrey K, Schlabach M, Schmitt E, et al. A SUMOylation-dependent transcriptional subprogram is required for Myc-driven tumorigenesis. Science. 2012;335:348-53 pubmed publisher
  126. Modi B, Neustadter J, Binda E, Lewis J, Filler R, Roberts S, et al. Langerhans cells facilitate epithelial DNA damage and squamous cell carcinoma. Science. 2012;335:104-8 pubmed publisher
  127. Chu H, Pazgier M, Jung G, Nuccio S, Castillo P, de Jong M, et al. Human α-defensin 6 promotes mucosal innate immunity through self-assembled peptide nanonets. Science. 2012;337:477-81 pubmed publisher
  128. Fang S, Wei J, Pentinmikko N, Leinonen H, Salven P. Generation of functional blood vessels from a single c-kit+ adult vascular endothelial stem cell. PLoS Biol. 2012;10:e1001407 pubmed publisher
  129. Higashida K, Kim S, Jung S, Asaka M, Holloszy J, Han D. Effects of resveratrol and SIRT1 on PGC-1α activity and mitochondrial biogenesis: a reevaluation. PLoS Biol. 2013;11:e1001603 pubmed publisher
  130. Ehehalt R, Sparla R, Kulaksiz H, Herrmann T, Fullekrug J, Stremmel W. Uptake of long chain fatty acids is regulated by dynamic interaction of FAT/CD36 with cholesterol/sphingolipid enriched microdomains (lipid rafts). BMC Cell Biol. 2008;9:45 pubmed publisher
  131. Epting C, King F, Pedersen A, Zaman J, Ritner C, Bernstein H. Stem cell antigen-1 localizes to lipid microdomains and associates with insulin degrading enzyme in skeletal myoblasts. J Cell Physiol. 2008;217:250-60 pubmed publisher
  132. Li Z, Mathew P, Yang J, Starbuck M, Zurita A, Liu J, et al. Androgen receptor-negative human prostate cancer cells induce osteogenesis in mice through FGF9-mediated mechanisms. J Clin Invest. 2008;118:2697-710 pubmed publisher
  133. Yi W, Clark P, Mason D, Keenan M, Hill C, Goddard W, et al. Phosphofructokinase 1 glycosylation regulates cell growth and metabolism. Science. 2012;337:975-80 pubmed publisher
  134. Yang N, Huang J, Greshock J, Liang S, Barchetti A, Hasegawa K, et al. Transcriptional regulation of PIK3CA oncogene by NF-kappaB in ovarian cancer microenvironment. PLoS ONE. 2008;3:e1758 pubmed publisher
  135. Liang S, Yang N, Pan Y, Deng S, Lin X, Yang X, et al. Expression of activated PIK3CA in ovarian surface epithelium results in hyperplasia but not tumor formation. PLoS ONE. 2009;4:e4295 pubmed publisher
  136. Avinoam O, Fridman K, Valansi C, Abutbul I, Zeev-Ben-Mordehai T, Maurer U, et al. Conserved eukaryotic fusogens can fuse viral envelopes to cells. Science. 2011;332:589-92 pubmed publisher
  137. Puel A, Cypowyj S, Bustamante J, Wright J, Liu L, Lim H, et al. Chronic mucocutaneous candidiasis in humans with inborn errors of interleukin-17 immunity. Science. 2011;332:65-8 pubmed publisher
  138. Delloye-Bourgeois C, Gibert B, Rama N, Delcros J, Gadot N, Scoazec J, et al. Sonic Hedgehog promotes tumor cell survival by inhibiting CDON pro-apoptotic activity. PLoS Biol. 2013;11:e1001623 pubmed publisher
  139. Wu C, Sahoo D, Arvanitis C, Bradon N, Dill D, Felsher D. Combined analysis of murine and human microarrays and ChIP analysis reveals genes associated with the ability of MYC to maintain tumorigenesis. PLoS Genet. 2008;4:e1000090 pubmed publisher
  140. Yun J, Rago C, Cheong I, Pagliarini R, Angenendt P, Rajagopalan H, et al. Glucose deprivation contributes to the development of KRAS pathway mutations in tumor cells. Science. 2009;325:1555-9 pubmed publisher
  141. Kansara M, Tsang M, Kodjabachian L, Sims N, Trivett M, Ehrich M, et al. Wnt inhibitory factor 1 is epigenetically silenced in human osteosarcoma, and targeted disruption accelerates osteosarcomagenesis in mice. J Clin Invest. 2009;119:837-51 pubmed publisher
  142. Huang H, Wang S, Yin M, Dong L, Wang C, Wu W, et al. Par-1 regulates tissue growth by influencing hippo phosphorylation status and hippo-salvador association. PLoS Biol. 2013;11:e1001620 pubmed publisher
  143. Topisirovic I, Siddiqui N, Orolicki S, Skrabanek L, Tremblay M, Hoang T, et al. Stability of eukaryotic translation initiation factor 4E mRNA is regulated by HuR, and this activity is dysregulated in cancer. Mol Cell Biol. 2009;29:1152-62 pubmed publisher
  144. Sobolev O, Stern P, Lacy-Hulbert A, Hynes R. Natural killer cells require selectins for suppression of subcutaneous tumors. Cancer Res. 2009;69:2531-9 pubmed publisher
  145. Peng T, Huang B, Sun Y, Lu Y, Bonewald L, Chen S, et al. Blocking of proteolytic processing and deletion of glycosaminoglycan side chain of mouse DMP1 by substituting critical amino acid residues. Cells Tissues Organs. 2009;189:192-7 pubmed publisher
  146. Vijayaragavan K, Szabo E, Bosse M, Ramos-Mejia V, Moon R, Bhatia M. Noncanonical Wnt signaling orchestrates early developmental events toward hematopoietic cell fate from human embryonic stem cells. Cell Stem Cell. 2009;4:248-62 pubmed publisher
  147. Chan C, Lau S, Woo P, Tse H, Zheng B, Chen L, et al. Identification of major histocompatibility complex class I C molecule as an attachment factor that facilitates coronavirus HKU1 spike-mediated infection. J Virol. 2009;83:1026-35 pubmed publisher
  148. Qu X, Metz R, Porter W, Cassone V, Earnest D. Disruption of period gene expression alters the inductive effects of dioxin on the AhR signaling pathway in the mouse liver. Toxicol Appl Pharmacol. 2009;234:370-7 pubmed publisher
  149. Sha Y, Pandit L, Zeng S, Eissa N. A critical role for CHIP in the aggresome pathway. Mol Cell Biol. 2009;29:116-28 pubmed publisher
  150. Tang W, Lu Y, Tian Q, Zhang Y, Guo F, Liu G, et al. The growth factor progranulin binds to TNF receptors and is therapeutic against inflammatory arthritis in mice. Science. 2011;332:478-84 pubmed publisher
  151. Blish K, Wang W, Willingham M, Du W, Birse C, Krishnan S, et al. A human bone morphogenetic protein antagonist is down-regulated in renal cancer. Mol Biol Cell. 2008;19:457-64 pubmed
  152. Stamm I, Mohr M, Bridger P, Schröpfer E, König M, Stoffregen W, et al. Epithelial and mesenchymal cells in the bovine colonic mucosa differ in their responsiveness to Escherichia coli Shiga toxin 1. Infect Immun. 2008;76:5381-91 pubmed publisher
  153. Pattyn E, Verhee A, Uyttendaele I, Piessevaux J, Timmerman E, Gevaert K, et al. HyperISGylation of Old World monkey ISG15 in human cells. PLoS ONE. 2008;3:e2427 pubmed publisher
  154. Chung Y, Troy H, Kristeleit R, Aherne W, Jackson L, Atadja P, et al. Noninvasive magnetic resonance spectroscopic pharmacodynamic markers of a novel histone deacetylase inhibitor, LAQ824, in human colon carcinoma cells and xenografts. Neoplasia. 2008;10:303-13 pubmed
  155. Wall A, Persigehl T, Hauff P, Licha K, Schirner M, Müller S, et al. Differentiation of angiogenic burden in human cancer xenografts using a perfusion-type optical contrast agent (SIDAG). Breast Cancer Res. 2008;10:R23 pubmed publisher
  156. Rauh A, Windischhofer W, Kovacevic A, DeVaney T, Huber E, Semlitsch M, et al. Endothelin (ET)-1 and ET-3 promote expression of c-fos and c-jun in human choriocarcinoma via ET(B) receptor-mediated G(i)- and G(q)-pathways and MAP kinase activation. Br J Pharmacol. 2008;154:13-24 pubmed publisher
  157. Chao K, Chao K, Fu Y, Liu S. Islet-like clusters derived from mesenchymal stem cells in Wharton's Jelly of the human umbilical cord for transplantation to control type 1 diabetes. PLoS ONE. 2008;3:e1451 pubmed publisher
  158. Corlazzoli F, Rossetti S, Bistulfi G, Ren M, Sacchi N. Derangement of a factor upstream of RARalpha triggers the repression of a pleiotropic epigenetic network. PLoS ONE. 2009;4:e4305 pubmed publisher
  159. Meng Y, Gu C, Wu Z, Zhao Y, Si Y, Fu X, et al. Id2 promotes the invasive growth of MCF-7 and SKOV-3 cells by a novel mechanism independent of dimerization to basic helix-loop-helix factors. BMC Cancer. 2009;9:75 pubmed publisher
  160. Rodriguez R, Rubio R, Masip M, Catalina P, Nieto A, de la Cueva T, et al. Loss of p53 induces tumorigenesis in p21-deficient mesenchymal stem cells. Neoplasia. 2009;11:397-407 pubmed
  161. MacPherson M, Beatty L, Zhou W, Du M, Sadowski P. The CTCF insulator protein is posttranslationally modified by SUMO. Mol Cell Biol. 2009;29:714-25 pubmed publisher
  162. Ambagala A, Bosma T, Ali M, Poustovoitov M, Chen J, Gershon M, et al. Varicella-zoster virus immediate-early 63 protein interacts with human antisilencing function 1 protein and alters its ability to bind histones h3.1 and h3.3. J Virol. 2009;83:200-9 pubmed publisher
  163. Goicoechea S, Bednarski B, Garcia-Mata R, Prentice-Dunn H, Kim H, Otey C. Palladin contributes to invasive motility in human breast cancer cells. Oncogene. 2009;28:587-98 pubmed publisher
  164. Daher A, Laraki G, Singh M, Melendez-Peña C, Bannwarth S, Peters A, et al. TRBP control of PACT-induced phosphorylation of protein kinase R is reversed by stress. Mol Cell Biol. 2009;29:254-65 pubmed publisher
  165. Cheong R, Rhee A, Wang C, Nemenman I, Levchenko A. Information transduction capacity of noisy biochemical signaling networks. Science. 2011;334:354-8 pubmed publisher
  166. Yoshida-Moriguchi T, Yu L, Stalnaker S, Davis S, Kunz S, Madson M, et al. O-mannosyl phosphorylation of alpha-dystroglycan is required for laminin binding. Science. 2010;327:88-92 pubmed publisher
  167. Kim Y, Sharov A, McDole K, Cheng M, Hao H, Fan C, et al. Mouse B-type lamins are required for proper organogenesis but not by embryonic stem cells. Science. 2011;334:1706-10 pubmed publisher
  168. Garcia-Gonzalo F, Izpisua Belmonte J. Albumin-associated lipids regulate human embryonic stem cell self-renewal. PLoS ONE. 2008;3:e1384 pubmed publisher
  169. Riby J, Firestone G, Bjeldanes L. 3,3'-diindolylmethane reduces levels of HIF-1alpha and HIF-1 activity in hypoxic cultured human cancer cells. Biochem Pharmacol. 2008;75:1858-67 pubmed publisher
  170. Koinuma D, Tsutsumi S, Kamimura N, Taniguchi H, Miyazawa K, Sunamura M, et al. Chromatin immunoprecipitation on microarray analysis of Smad2/3 binding sites reveals roles of ETS1 and TFAP2A in transforming growth factor beta signaling. Mol Cell Biol. 2009;29:172-86 pubmed publisher
  171. Assadian S, Aliaga A, Del Maestro R, Evans A, Bedell B. FDG-PET imaging for the evaluation of antiglioma agents in a rat model. Neuro Oncol. 2008;10:292-9 pubmed publisher
  172. Hitani K, Yokoo S, Honda N, Usui T, Yamagami S, Amano S. Transplantation of a sheet of human corneal endothelial cell in a rabbit model. Mol Vis. 2008;14:1-9 pubmed
  173. Chuang H, Kardosh A, Gaffney K, Petasis N, Schonthal A. COX-2 inhibition is neither necessary nor sufficient for celecoxib to suppress tumor cell proliferation and focus formation in vitro. Mol Cancer. 2008;7:38 pubmed publisher
  174. Barkan D, Kleinman H, Simmons J, Asmussen H, Kamaraju A, Hoenorhoff M, et al. Inhibition of metastatic outgrowth from single dormant tumor cells by targeting the cytoskeleton. Cancer Res. 2008;68:6241-50 pubmed publisher
  175. Sahin O, Frohlich H, Löbke C, Korf U, Burmester S, Majety M, et al. Modeling ERBB receptor-regulated G1/S transition to find novel targets for de novo trastuzumab resistance. BMC Syst Biol. 2009;3:1 pubmed publisher
  176. Kouzu-Fujita M, Mezaki Y, Sawatsubashi S, Matsumoto T, Yamaoka I, Yano T, et al. Coactivation of estrogen receptor beta by gonadotropin-induced cofactor GIOT-4. Mol Cell Biol. 2009;29:83-92 pubmed publisher
  177. Liton P, Li G, Luna C, Gonzalez P, Epstein D. Cross-talk between TGF-beta1 and IL-6 in human trabecular meshwork cells. Mol Vis. 2009;15:326-34 pubmed
  178. Fichorova R, Richardson-Harman N, Alfano M, Belec L, Carbonneil C, Chen S, et al. Biological and technical variables affecting immunoassay recovery of cytokines from human serum and simulated vaginal fluid: a multicenter study. Anal Chem. 2008;80:4741-51 pubmed publisher
  179. Kawanami Y, Morimoto Y, Kim H, Nakamura T, Machida K, Kido T, et al. Calcitonin gene-related peptide stimulates proliferation of alveolar epithelial cells. Respir Res. 2009;10:8 pubmed publisher
  180. Doh Y, Kim H, Jung E, Choi S, Kim J, Kim B, et al. Novel LMNA gene mutation in a patient with Atypical Werner's Syndrome. Korean J Intern Med. 2009;24:68-72 pubmed publisher
  181. Zaitseva L, Cherepanov P, Leyens L, Wilson S, Rasaiyaah J, Fassati A. HIV-1 exploits importin 7 to maximize nuclear import of its DNA genome. Retrovirology. 2009;6:11 pubmed publisher
  182. Zhu H, Wu H, Liu X, Evans B, Medina D, Liu C, et al. Role of MicroRNA miR-27a and miR-451 in the regulation of MDR1/P-glycoprotein expression in human cancer cells. Biochem Pharmacol. 2008;76:582-8 pubmed publisher
  183. Liu X, Wang L, Zhang S, Lin J, Zhang S, Feitelson M, et al. Mutations in the C-terminus of the X protein of hepatitis B virus regulate Wnt-5a expression in hepatoma Huh7 cells: cDNA microarray and proteomic analyses. Carcinogenesis. 2008;29:1207-14 pubmed publisher
  184. Marshall L, Moore A, Ohki M, Kitabayashi I, Patterson D, Ornelles D. RUNX1 permits E4orf6-directed nuclear localization of the adenovirus E1B-55K protein and associates with centers of viral DNA and RNA synthesis. J Virol. 2008;82:6395-408 pubmed publisher
  185. Thomas B, Woznica I, Mierke D, Wittelsberger A, Rosenblatt M. Conformational changes in the parathyroid hormone receptor associated with activation by agonist. Mol Endocrinol. 2008;22:1154-62 pubmed publisher
  186. Boutsma E, Noback S, Van Lohuizen M. The Polycomb protein and E3 ubiquitin ligase Ring1B harbors an IRES in its highly conserved 5' UTR. PLoS ONE. 2008;3:e2322 pubmed publisher
  187. Méndez-Samperio P, Miranda E, Trejo A. Expression and secretion of cathelicidin LL-37 in human epithelial cells after infection by Mycobacterium bovis Bacillus Calmette-Guérin. Clin Vaccine Immunol. 2008;15:1450-5 pubmed publisher
  188. Park J, Cawley N, Loh Y. Carboxypeptidase E cytoplasmic tail-driven vesicle transport is key for activity-dependent secretion of peptide hormones. Mol Endocrinol. 2008;22:989-1005 pubmed publisher
  189. Gao J, DeRouen M, Chen C, Nguyen M, Nguyen N, Ido H, et al. Laminin-511 is an epithelial message promoting dermal papilla development and function during early hair morphogenesis. Genes Dev. 2008;22:2111-24 pubmed publisher
  190. Urbanska K, Pannizzo P, Lassak A, Gualco E, Surmacz E, Croul S, et al. Estrogen receptor beta-mediated nuclear interaction between IRS-1 and Rad51 inhibits homologous recombination directed DNA repair in medulloblastoma. J Cell Physiol. 2009;219:392-401 pubmed publisher
  191. Feng S, Muraoka-Cook R, Hunter D, Sandahl M, Caskey L, Miyazawa K, et al. The E3 ubiquitin ligase WWP1 selectively targets HER4 and its proteolytically derived signaling isoforms for degradation. Mol Cell Biol. 2009;29:892-906 pubmed publisher
  192. Tsai Y, Wu M, Wu Y, Chang S, Lin S, Sharp T, et al. The M type K15 protein of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus regulates microRNA expression via its SH2-binding motif to induce cell migration and invasion. J Virol. 2009;83:622-32 pubmed publisher
  193. Ramachandran A, Parisien J, Horvath C. STAT2 is a primary target for measles virus V protein-mediated alpha/beta interferon signaling inhibition. J Virol. 2008;82:8330-8 pubmed publisher
  194. Xu M, Luo W, Elzi D, Grandori C, Galloway D. NFX1 interacts with mSin3A/histone deacetylase to repress hTERT transcription in keratinocytes. Mol Cell Biol. 2008;28:4819-28 pubmed publisher
  195. Dettenhofer M, Zhou F, Leder P. Formin 1-isoform IV deficient cells exhibit defects in cell spreading and focal adhesion formation. PLoS ONE. 2008;3:e2497 pubmed publisher
  196. Rao V, Krishnamoorthy R, Yorio T. Endothelin-1 mediated regulation of extracellular matrix collagens in cells of human lamina cribrosa. Exp Eye Res. 2008;86:886-94 pubmed publisher
  197. Akpan N, Caradonna K, Chuenkova M, PereiraPerrin M. Chagas' disease parasite-derived neurotrophic factor activates cholinergic gene expression in neuronal PC12 cells. Brain Res. 2008;1217:195-202 pubmed publisher
  198. Zhu L, Sun G, Zhang H, Zhang Y, Chen X, Jiang X, et al. PGC-1alpha is a key regulator of glucose-induced proliferation and migration in vascular smooth muscle cells. PLoS ONE. 2009;4:e4182 pubmed publisher
  199. Michaud M, Martins I, Sukkurwala A, Adjemian S, Ma Y, Pellegatti P, et al. Autophagy-dependent anticancer immune responses induced by chemotherapeutic agents in mice. Science. 2011;334:1573-7 pubmed publisher
  200. Lange S, Mitchell D, Vasquez K. High mobility group protein B1 enhances DNA repair and chromatin modification after DNA damage. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:10320-5 pubmed publisher
  201. Gallazzini M, Ferraris J, Burg M. GDPD5 is a glycerophosphocholine phosphodiesterase that osmotically regulates the osmoprotective organic osmolyte GPC. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:11026-31 pubmed publisher
  202. Tjabringa G, Bergers M, van Rens D, de Boer R, Lamme E, Schalkwijk J. Development and validation of human psoriatic skin equivalents. Am J Pathol. 2008;173:815-23 pubmed publisher
  203. Zhang C, An J, Strickland D, Yepes M. The low-density lipoprotein receptor-related protein 1 mediates tissue-type plasminogen activator-induced microglial activation in the ischemic brain. Am J Pathol. 2009;174:586-94 pubmed publisher
  204. Smith E, Omerbasic D, Lechner S, Anirudhan G, Lapatsina L, Lewin G. The molecular basis of acid insensitivity in the African naked mole-rat. Science. 2011;334:1557-60 pubmed publisher
  205. Yi C, Ma M, Ran L, Zheng J, Tong J, Zhu J, et al. Function and molecular mechanism of acetylation in autophagy regulation. Science. 2012;336:474-7 pubmed publisher
  206. Niewiadomska A, Gifford R. The extraordinary evolutionary history of the reticuloendotheliosis viruses. PLoS Biol. 2013;11:e1001642 pubmed publisher
  207. Luo X, Zuo X, Zhou Y, Zhang B, Shi Y, Liu M, et al. Extracellular heat shock protein 70 inhibits tumour necrosis factor-alpha induced proinflammatory mediator production in fibroblast-like synoviocytes. Arthritis Res Ther. 2008;10:R41 pubmed publisher
  208. Indzhykulian A, Stepanyan R, Nelina A, Spinelli K, Ahmed Z, Belyantseva I, et al. Molecular remodeling of tip links underlies mechanosensory regeneration in auditory hair cells. PLoS Biol. 2013;11:e1001583 pubmed publisher
  209. Lavieu G, Zheng H, Rothman J. Stapled Golgi cisternae remain in place as cargo passes through the stack. elife. 2013;2:e00558 pubmed publisher
  210. Mitrovic S, Nogueira C, Cantero-Recasens G, Kiefer K, Fernández-Fernández J, Popoff J, et al. TRPM5-mediated calcium uptake regulates mucin secretion from human colon goblet cells. elife. 2013;2:e00658 pubmed publisher
  211. Pavlova N, Pallasch C, Elia A, Braun C, Westbrook T, Hemann M, et al. A role for PVRL4-driven cell-cell interactions in tumorigenesis. elife. 2013;2:e00358 pubmed publisher
  212. Shimomura K, Kumar V, Koike N, Kim T, Chong J, Buhr E, et al. Usf1, a suppressor of the circadian Clock mutant, reveals the nature of the DNA-binding of the CLOCK:BMAL1 complex in mice. elife. 2013;2:e00426 pubmed publisher
  213. Lecona E, Rojas L, Bonasio R, Johnston A, Fernandez-Capetillo O, Reinberg D. Polycomb protein SCML2 regulates the cell cycle by binding and modulating CDK/CYCLIN/p21 complexes. PLoS Biol. 2013;11:e1001737 pubmed publisher
  214. Roland A, Ricobaraza A, Carrel D, Jordan B, Rico F, Simon A, et al. Cannabinoid-induced actomyosin contractility shapes neuronal morphology and growth. elife. 2014;3:e03159 pubmed publisher
  215. Gubelmann C, Schwalie P, Raghav S, Röder E, Delessa T, Kiehlmann E, et al. Identification of the transcription factor ZEB1 as a central component of the adipogenic gene regulatory network. elife. 2014;3:e03346 pubmed publisher
  216. Gouti M, Tsakiridis A, Wymeersch F, Huang Y, Kleinjung J, Wilson V, et al. In vitro generation of neuromesodermal progenitors reveals distinct roles for wnt signalling in the specification of spinal cord and paraxial mesoderm identity. PLoS Biol. 2014;12:e1001937 pubmed publisher
  217. Chiba S, Ikushima H, Ueki H, Yanai H, Kimura Y, Hangai S, et al. Recognition of tumor cells by Dectin-1 orchestrates innate immune cells for anti-tumor responses. elife. 2014;3:e04177 pubmed publisher
  218. Elias S, McGuire J, Yu H, Humbert S. Huntingtin Is Required for Epithelial Polarity through RAB11A-Mediated Apical Trafficking of PAR3-aPKC. PLoS Biol. 2015;13:e1002142 pubmed publisher
  219. Chakraborty S, Mizusaki H, Kenney L. A FRET-based DNA biosensor tracks OmpR-dependent acidification of Salmonella during macrophage infection. PLoS Biol. 2015;13:e1002116 pubmed publisher
  220. McGann J, Oyer J, Garg S, Yao H, Liu J, Feng X, et al. Polycomb- and REST-associated histone deacetylases are independent pathways toward a mature neuronal phenotype. elife. 2014;3:e04235 pubmed publisher
  221. Notani D, Gottimukkala K, Jayani R, Limaye A, Damle M, Mehta S, et al. Global regulator SATB1 recruits beta-catenin and regulates T(H)2 differentiation in Wnt-dependent manner. PLoS Biol. 2010;8:e1000296 pubmed publisher
  222. Jain A, Allton K, Iacovino M, Mahen E, Milczarek R, Zwaka T, et al. p53 regulates cell cycle and microRNAs to promote differentiation of human embryonic stem cells. PLoS Biol. 2012;10:e1001268 pubmed publisher
  223. Fleckenstein M, Reese M, Könen-Waisman S, Boothroyd J, Howard J, Steinfeldt T. A Toxoplasma gondii pseudokinase inhibits host IRG resistance proteins. PLoS Biol. 2012;10:e1001358 pubmed publisher
  224. Grotjohann T, Testa I, Reuss M, Brakemann T, Eggeling C, Hell S, et al. rsEGFP2 enables fast RESOLFT nanoscopy of living cells. elife. 2012;1:e00248 pubmed publisher
  225. Ma S, Kwon H, Johng H, Zang K, Huang Z. Radial glial neural progenitors regulate nascent brain vascular network stabilization via inhibition of Wnt signaling. PLoS Biol. 2013;11:e1001469 pubmed publisher
  226. Bowes A, Khan M, Shi Y, Robertson L, Werstuck G. Valproate attenuates accelerated atherosclerosis in hyperglycemic apoE-deficient mice: evidence in support of a role for endoplasmic reticulum stress and glycogen synthase kinase-3 in lesion development and hepatic steatosis. Am J Pathol. 2009;174:330-42 pubmed publisher
  227. Iannetti A, Pacifico F, Acquaviva R, Lavorgna A, Crescenzi E, Vascotto C, et al. The neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL), a NF-kappaB-regulated gene, is a survival factor for thyroid neoplastic cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:14058-63 pubmed publisher
  228. Fukazawa N, Yokoyama S, Eiraku M, Kengaku M, Maeda N. Receptor type protein tyrosine phosphatase zeta-pleiotrophin signaling controls endocytic trafficking of DNER that regulates neuritogenesis. Mol Cell Biol. 2008;28:4494-506 pubmed publisher
  229. Li B, Du T, Li H, Gu L, Zhang H, Huang J, et al. Signalling pathways for transactivation by dexmedetomidine of epidermal growth factor receptors in astrocytes and its paracrine effect on neurons. Br J Pharmacol. 2008;154:191-203 pubmed publisher
  230. Picard N, Charbonneau C, Sanchez M, Licznar A, Busson M, Lazennec G, et al. Phosphorylation of activation function-1 regulates proteasome-dependent nuclear mobility and E6-associated protein ubiquitin ligase recruitment to the estrogen receptor beta. Mol Endocrinol. 2008;22:317-30 pubmed
  231. Lavender V, Chong S, Ralphs K, Wolstenholme A, Reaves B. Increasing the expression of calcium-permeable TRPC3 and TRPC7 channels enhances constitutive secretion. Biochem J. 2008;413:437-46 pubmed publisher
  232. Gastaldello S, D'Angelo S, Franzoso S, Fanin M, Angelini C, Betto R, et al. Inhibition of proteasome activity promotes the correct localization of disease-causing alpha-sarcoglycan mutants in HEK-293 cells constitutively expressing beta-, gamma-, and delta-sarcoglycan. Am J Pathol. 2008;173:170-81 pubmed publisher
  233. Zhang Z, Harris D, Pandey V. The FUSE binding protein is a cellular factor required for efficient replication of hepatitis C virus. J Virol. 2008;82:5761-73 pubmed publisher
  234. Guo S, Miyake M, Liu K, Shi H. Specific inhibition of hypoxia inducible factor 1 exaggerates cell injury induced by in vitro ischemia through deteriorating cellular redox environment. J Neurochem. 2009;108:1309-21 pubmed publisher
  235. Kawauchi K, Araki K, Tobiume K, Tanaka N. Loss of p53 enhances catalytic activity of IKKbeta through O-linked beta-N-acetyl glucosamine modification. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:3431-6 pubmed publisher
  236. Tateno M, Kato S, Sakurai T, Nukina N, Takahashi R, Araki T. Mutant SOD1 impairs axonal transport of choline acetyltransferase and acetylcholine release by sequestering KAP3. Hum Mol Genet. 2009;18:942-55 pubmed publisher
  237. He Y, Jones C, Fujiki N, Xu Y, Guo B, Holder J, et al. The transcriptional repressor DEC2 regulates sleep length in mammals. Science. 2009;325:866-70 pubmed publisher
  238. Altman B, Wofford J, Zhao Y, Coloff J, Ferguson E, Wieman H, et al. Autophagy provides nutrients but can lead to Chop-dependent induction of Bim to sensitize growth factor-deprived cells to apoptosis. Mol Biol Cell. 2009;20:1180-91 pubmed publisher
  239. Mahoney C, Morgan M, Harrison A, Humphries M, Bass M. Therapeutic ultrasound bypasses canonical syndecan-4 signaling to activate rac1. J Biol Chem. 2009;284:8898-909 pubmed publisher
  240. Hamanaka R, Bobrovnikova-Marjon E, Ji X, Liebhaber S, Diehl J. PERK-dependent regulation of IAP translation during ER stress. Oncogene. 2009;28:910-20 pubmed publisher
  241. Oshikawa M, Usami R, Kato S. Characterization of the arylsulfatase I (ARSI) gene preferentially expressed in the human retinal pigment epithelium cell line ARPE-19. Mol Vis. 2009;15:482-94 pubmed
  242. Smith J, Clarke P, de Billy E, Workman P. Silencing the cochaperone CDC37 destabilizes kinase clients and sensitizes cancer cells to HSP90 inhibitors. Oncogene. 2009;28:157-69 pubmed publisher
  243. Hammond G, Fischer M, Anderson K, Holdich J, Koteci A, Balla T, et al. PI4P and PI(4,5)P2 are essential but independent lipid determinants of membrane identity. Science. 2012;337:727-30 pubmed publisher
  244. Bansal K, Kapoor N, Narayana Y, Puzo G, Gilleron M, Balaji K. PIM2 Induced COX-2 and MMP-9 expression in macrophages requires PI3K and Notch1 signaling. PLoS ONE. 2009;4:e4911 pubmed publisher
  245. Prosser B, Ward C, Lederer W. X-ROS signaling: rapid mechano-chemo transduction in heart. Science. 2011;333:1440-5 pubmed publisher
  246. Chakraborty S, Mohiyuddin S, Gopinath K, Kumar A. Involvement of TSC genes and differential expression of other members of the mTOR signaling pathway in oral squamous cell carcinoma. BMC Cancer. 2008;8:163 pubmed publisher
  247. Mueller J, Pfanzelter J, Winkler C, Narita A, Le Clainche C, Nemethova M, et al. Electron tomography and simulation of baculovirus actin comet tails support a tethered filament model of pathogen propulsion. PLoS Biol. 2014;12:e1001765 pubmed publisher
  248. Yan H, Pablo J, Wang C, Pitt G. FGF14 modulates resurgent sodium current in mouse cerebellar Purkinje neurons. elife. 2014;3:e04193 pubmed publisher
  249. Oyama S, Yamakawa H, Sasagawa N, Hosoi Y, Futai E, Ishiura S. Dysbindin-1, a schizophrenia-related protein, functionally interacts with the DNA- dependent protein kinase complex in an isoform-dependent manner. PLoS ONE. 2009;4:e4199 pubmed publisher
  250. Larabee J, DeGiusti K, Regens J, Ballard J. Bacillus anthracis edema toxin activates nuclear glycogen synthase kinase 3beta. Infect Immun. 2008;76:4895-904 pubmed publisher
  251. Choi M, Salanova B, Rolle S, Wellner M, Schneider W, Luft F, et al. Short-term heat exposure inhibits inflammation by abrogating recruitment of and nuclear factor-{kappa}B activation in neutrophils exposed to chemotactic cytokines. Am J Pathol. 2008;172:367-777 pubmed publisher
  252. Amsili S, Zer H, Hinderlich S, Krause S, Becker-Cohen M, MacArthur D, et al. UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase (GNE) binds to alpha-actinin 1: novel pathways in skeletal muscle?. PLoS ONE. 2008;3:e2477 pubmed publisher
  253. Jahoor A, Patel R, Bryan A, Do C, Krier J, Watters C, et al. Peroxisome proliferator-activated receptors mediate host cell proinflammatory responses to Pseudomonas aeruginosa autoinducer. J Bacteriol. 2008;190:4408-15 pubmed publisher
  254. Reimer J, Backovic M, Deshpande C, Jardetzky T, Longnecker R. Analysis of Epstein-Barr virus glycoprotein B functional domains via linker insertion mutagenesis. J Virol. 2009;83:734-47 pubmed publisher
  255. Wang H, Westin L, Nong Y, Birnbaum S, Bendor J, Brismar H, et al. Norbin is an endogenous regulator of metabotropic glutamate receptor 5 signaling. Science. 2009;326:1554-7 pubmed publisher
  256. Luheshi N, Rothwell N, Brough D. The dynamics and mechanisms of interleukin-1alpha and beta nuclear import. Traffic. 2009;10:16-25 pubmed publisher
  257. Wilson J, de Sessions P, Leon M, Scholle F. West Nile virus nonstructural protein 1 inhibits TLR3 signal transduction. J Virol. 2008;82:8262-71 pubmed publisher
  258. Meunier J, Russell R, Engle R, Faulk K, Purcell R, Emerson S. Apolipoprotein c1 association with hepatitis C virus. J Virol. 2008;82:9647-56 pubmed publisher
  259. Hein J, Boichuk S, Wu J, Cheng Y, Freire R, Jat P, et al. Simian virus 40 large T antigen disrupts genome integrity and activates a DNA damage response via Bub1 binding. J Virol. 2009;83:117-27 pubmed publisher
  260. Shankarling G, Coates P, Dass B, MacDonald C. A family of splice variants of CstF-64 expressed in vertebrate nervous systems. BMC Mol Biol. 2009;10:22 pubmed publisher
  261. Slim C, Lázaro-Diéguez F, Bijlard M, Toussaint M, de Bruin A, Du Q, et al. Par1b induces asymmetric inheritance of plasma membrane domains via LGN-dependent mitotic spindle orientation in proliferating hepatocytes. PLoS Biol. 2013;11:e1001739 pubmed publisher
  262. Mancia F, Assur Z, Herman A, Siegel R, Hendrickson W. Ligand sensitivity in dimeric associations of the serotonin 5HT2c receptor. EMBO Rep. 2008;9:363-9 pubmed publisher
  263. Iqbal J, Dai K, Seimon T, Jungreis R, Oyadomari M, Kuriakose G, et al. IRE1beta inhibits chylomicron production by selectively degrading MTP mRNA. Cell Metab. 2008;7:445-55 pubmed publisher
  264. Beauvais D, Ell B, McWhorter A, Rapraeger A. Syndecan-1 regulates alphavbeta3 and alphavbeta5 integrin activation during angiogenesis and is blocked by synstatin, a novel peptide inhibitor. J Exp Med. 2009;206:691-705 pubmed publisher
  265. Liu B, Du H, Rutkowski R, Gartner A, Wang X. LAAT-1 is the lysosomal lysine/arginine transporter that maintains amino acid homeostasis. Science. 2012;337:351-4 pubmed publisher
  266. Johnson K, Zhu S, Tremblay M, Payette J, Wang J, Bouchez L, et al. A stem cell-based approach to cartilage repair. Science. 2012;336:717-21 pubmed publisher
  267. Salahudeen A, Thompson J, Ruiz J, Ma H, Kinch L, Li Q, et al. An E3 ligase possessing an iron-responsive hemerythrin domain is a regulator of iron homeostasis. Science. 2009;326:722-6 pubmed publisher
  268. Janssen A, van der Burg M, Szuhai K, Kops G, Medema R. Chromosome segregation errors as a cause of DNA damage and structural chromosome aberrations. Science. 2011;333:1895-8 pubmed publisher
  269. Herfst S, Schrauwen E, Linster M, Chutinimitkul S, de Wit E, Munster V, et al. Airborne transmission of influenza A/H5N1 virus between ferrets. Science. 2012;336:1534-41 pubmed publisher
  270. Ferdous Z, Lazaro L, Iozzo R, Hook M, Grande-Allen K. Influence of cyclic strain and decorin deficiency on 3D cellularized collagen matrices. Biomaterials. 2008;29:2740-8 pubmed publisher
  271. De Arcangelis V, Soto D, Xiang Y. Phosphodiesterase 4 and phosphatase 2A differentially regulate cAMP/protein kinase a signaling for cardiac myocyte contraction under stimulation of beta1 adrenergic receptor. Mol Pharmacol. 2008;74:1453-62 pubmed publisher
  272. Wen J, Li R, Lu Y, Shupnik M. Decreased BRCA1 confers tamoxifen resistance in breast cancer cells by altering estrogen receptor-coregulator interactions. Oncogene. 2009;28:575-86 pubmed publisher
  273. Lee K, Qian D, Rey S, Wei H, Liu J, Semenza G. Anthracycline chemotherapy inhibits HIF-1 transcriptional activity and tumor-induced mobilization of circulating angiogenic cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2353-8 pubmed publisher
  274. Das S, Eder S, Schauer S, Diwoky C, Temmel H, Guertl B, et al. Adipose triglyceride lipase contributes to cancer-associated cachexia. Science. 2011;333:233-8 pubmed publisher
  275. Schmidt S, Hommel A, Gawlik V, Augustin R, Junicke N, Florian S, et al. Essential role of glucose transporter GLUT3 for post-implantation embryonic development. J Endocrinol. 2009;200:23-33 pubmed publisher
  276. Heckel T, Czupalla C, Expirto Santo A, Anitei M, Arantzazu Sanchez-Fernandez M, Mosch K, et al. Src-dependent repression of ARF6 is required to maintain podosome-rich sealing zones in bone-digesting osteoclasts. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:1451-6 pubmed publisher
  277. George J, Braun A, Brusko T, Joseph R, Bolisetty S, Wasserfall C, et al. Suppression by CD4+CD25+ regulatory T cells is dependent on expression of heme oxygenase-1 in antigen-presenting cells. Am J Pathol. 2008;173:154-60 pubmed publisher
  278. Zoncu R, Bar-Peled L, Efeyan A, Wang S, Sancak Y, Sabatini D. mTORC1 senses lysosomal amino acids through an inside-out mechanism that requires the vacuolar H(+)-ATPase. Science. 2011;334:678-83 pubmed publisher
  279. Chung S, Kim M, Youn B, Lee N, Park J, Lee I, et al. Glutathione peroxidase 3 mediates the antioxidant effect of peroxisome proliferator-activated receptor gamma in human skeletal muscle cells. Mol Cell Biol. 2009;29:20-30 pubmed publisher
  280. Bitsikas V, Correa I, Nichols B. Clathrin-independent pathways do not contribute significantly to endocytic flux. elife. 2014;3:e03970 pubmed publisher
  281. Bassetti M, White J, Kappler J, Marrack P. Transgenic Bcl-3 slows T cell proliferation. Int Immunol. 2009;21:339-48 pubmed publisher
  282. Faivre E, Daniel A, Hillard C, Lange C. Progesterone receptor rapid signaling mediates serine 345 phosphorylation and tethering to specificity protein 1 transcription factors. Mol Endocrinol. 2008;22:823-37 pubmed publisher
  283. Mao Z, Hine C, Tian X, Van Meter M, Au M, Vaidya A, et al. SIRT6 promotes DNA repair under stress by activating PARP1. Science. 2011;332:1443-6 pubmed publisher
  284. Auffray C, Fogg D, Narni-Mancinelli E, Senechal B, Trouillet C, Saederup N, et al. CX3CR1+ CD115+ CD135+ common macrophage/DC precursors and the role of CX3CR1 in their response to inflammation. J Exp Med. 2009;206:595-606 pubmed publisher
  285. Kami D, Shiojima I, Makino H, Matsumoto K, Takahashi Y, Ishii R, et al. Gremlin enhances the determined path to cardiomyogenesis. PLoS ONE. 2008;3:e2407 pubmed publisher
  286. Samee N, Geoffroy V, Marty C, Schiltz C, Vieux-Rochas M, Levi G, et al. Dlx5, a positive regulator of osteoblastogenesis, is essential for osteoblast-osteoclast coupling. Am J Pathol. 2008;173:773-80 pubmed publisher
  287. Gatto M, Drudi-Metalli V, Torrice A, Alpini G, Cantafora A, Blotta I, et al. Insulin-like growth factor-1 isoforms in rat hepatocytes and cholangiocytes and their involvement in protection against cholestatic injury. Lab Invest. 2008;88:986-94 pubmed publisher
  288. Zhang Q, Guo R, Schwarz E, Boyce B, Xing L. TNF inhibits production of stromal cell-derived factor 1 by bone stromal cells and increases osteoclast precursor mobilization from bone marrow to peripheral blood. Arthritis Res Ther. 2008;10:R37 pubmed publisher
  289. Su Y, Sugiura K, Sun F, Pendola J, Cox G, Handel M, et al. MARF1 regulates essential oogenic processes in mice. Science. 2012;335:1496-9 pubmed publisher
  290. Grespin M, Bonamy G, Roggero V, Cameron N, Adam L, Atchison A, et al. Thyroid hormone receptor alpha1 follows a cooperative CRM1/calreticulin-mediated nuclear export pathway. J Biol Chem. 2008;283:25576-88 pubmed publisher
  291. de Jesus Perez V, Alastalo T, Wu J, Axelrod J, Cooke J, Amieva M, et al. Bone morphogenetic protein 2 induces pulmonary angiogenesis via Wnt-beta-catenin and Wnt-RhoA-Rac1 pathways. J Cell Biol. 2009;184:83-99 pubmed publisher
  292. Vij N, Mazur S, Zeitlin P. CFTR is a negative regulator of NFkappaB mediated innate immune response. PLoS ONE. 2009;4:e4664 pubmed publisher
  293. de Frutos C, Dacquin R, Vega S, Jurdic P, Machuca-Gayet I, Nieto M. Snail1 controls bone mass by regulating Runx2 and VDR expression during osteoblast differentiation. EMBO J. 2009;28:686-96 pubmed publisher
  294. Park S, Rich J, Hanses F, Lee J. Defects in innate immunity predispose C57BL/6J-Leprdb/Leprdb mice to infection by Staphylococcus aureus. Infect Immun. 2009;77:1008-14 pubmed publisher
  295. Narita M, Young A, Arakawa S, Samarajiwa S, Nakashima T, Yoshida S, et al. Spatial coupling of mTOR and autophagy augments secretory phenotypes. Science. 2011;332:966-70 pubmed publisher
  296. Wang W, Li G, Chen C, Xie X, Zhuang X. Chromosome organization by a nucleoid-associated protein in live bacteria. Science. 2011;333:1445-9 pubmed publisher
  297. Chetty C, Lakka S, Bhoopathi P, Kunigal S, Geiss R, Rao J. Tissue inhibitor of metalloproteinase 3 suppresses tumor angiogenesis in matrix metalloproteinase 2-down-regulated lung cancer. Cancer Res. 2008;68:4736-45 pubmed publisher
  298. Chen Y, Honeychurch K, Yang G, Byrd C, Harver C, Hruby D, et al. Vaccinia virus p37 interacts with host proteins associated with LE-derived transport vesicle biogenesis. Virol J. 2009;6:44 pubmed publisher
  299. Li M, Wang I, Li Y, Bruzel A, Richards A, Toung J, et al. Widespread RNA and DNA sequence differences in the human transcriptome. Science. 2011;333:53-8 pubmed publisher
  300. Verma V, Sauer T, Chan C, Zhou M, Zhang C, Maminishkis A, et al. Constancy of ERp29 expression in cultured retinal pigment epithelial cells in the Ccl2/Cx3cr1 deficient mouse model of age-related macular degeneration. Curr Eye Res. 2008;33:701-7 pubmed publisher
  301. Chamberlain S, Yee D, Magnuson T. Polycomb repressive complex 2 is dispensable for maintenance of embryonic stem cell pluripotency. Stem Cells. 2008;26:1496-505 pubmed publisher
  302. Castilow E, Olson M, Meyerholz D, Varga S. Differential role of gamma interferon in inhibiting pulmonary eosinophilia and exacerbating systemic disease in fusion protein-immunized mice undergoing challenge infection with respiratory syncytial virus. J Virol. 2008;82:2196-207 pubmed
  303. Wu K, Wang H, Hong S. Mechanism of mitomycin-induced apoptosis in cultured corneal endothelial cells. Mol Vis. 2008;14:1705-12 pubmed
  304. Fujita T, Liu W, Doihara H, Wan Y. Regulation of Skp2-p27 axis by the Cdh1/anaphase-promoting complex pathway in colorectal tumorigenesis. Am J Pathol. 2008;173:217-28 pubmed publisher
  305. Cruz-Migoni A, Hautbergue G, Artymiuk P, Baker P, Bokori-Brown M, Chang C, et al. A Burkholderia pseudomallei toxin inhibits helicase activity of translation factor eIF4A. Science. 2011;334:821-4 pubmed publisher
  306. Carbone D, Moreno J, Tjalkens R. Nuclear factor kappa-B mediates selective induction of neuronal nitric oxide synthase in astrocytes during low-level inflammatory stimulation with MPTP. Brain Res. 2008;1217:1-9 pubmed publisher
  307. Sen S, Talukdar I, Webster N. SRp20 and CUG-BP1 modulate insulin receptor exon 11 alternative splicing. Mol Cell Biol. 2009;29:871-80 pubmed publisher
  308. Howlin J, Rosenkvist J, Andersson T. TNK2 preserves epidermal growth factor receptor expression on the cell surface and enhances migration and invasion of human breast cancer cells. Breast Cancer Res. 2008;10:R36 pubmed publisher
  309. Provance D, Addison E, Wood P, Chen D, Silan C, Mercer J. Myosin-Vb functions as a dynamic tether for peripheral endocytic compartments during transferrin trafficking. BMC Cell Biol. 2008;9:44 pubmed publisher
  310. Berman S, Chen Y, Qi B, McCaffery J, Rucker E, Goebbels S, et al. Bcl-x L increases mitochondrial fission, fusion, and biomass in neurons. J Cell Biol. 2009;184:707-19 pubmed publisher
  311. Kuiper J, van Horssen R, Oerlemans F, Peters W, van Dommelen M, te Lindert M, et al. Local ATP generation by brain-type creatine kinase (CK-B) facilitates cell motility. PLoS ONE. 2009;4:e5030 pubmed publisher
  312. Czupryn A, Zhou Y, Chen X, McNay D, Anderson M, Flier J, et al. Transplanted hypothalamic neurons restore leptin signaling and ameliorate obesity in db/db mice. Science. 2011;334:1133-7 pubmed publisher
  313. Gold E, Jetly N, O'Bryan M, Meachem S, Srinivasan D, Behuria S, et al. Activin C antagonizes activin A in vitro and overexpression leads to pathologies in vivo. Am J Pathol. 2009;174:184-95 pubmed publisher
  314. Solier S, Sordet O, Kohn K, Pommier Y. Death receptor-induced activation of the Chk2- and histone H2AX-associated DNA damage response pathways. Mol Cell Biol. 2009;29:68-82 pubmed publisher
  315. Yuksek K, Chen W, Chien D, Ou J. Ubiquitin-independent degradation of hepatitis C virus F protein. J Virol. 2009;83:612-21 pubmed publisher
  316. Sõber S, Laan M, Annilo T. MicroRNAs miR-124 and miR-135a are potential regulators of the mineralocorticoid receptor gene (NR3C2) expression. Biochem Biophys Res Commun. 2010;391:727-32 pubmed publisher
  317. Magnus C, Lee P, Atasoy D, Su H, Looger L, Sternson S. Chemical and genetic engineering of selective ion channel-ligand interactions. Science. 2011;333:1292-6 pubmed publisher
  318. Saito D, Takase Y, Murai H, Takahashi Y. The dorsal aorta initiates a molecular cascade that instructs sympatho-adrenal specification. Science. 2012;336:1578-81 pubmed publisher
  319. Cruciat C, Ohkawara B, Acebron S, Karaulanov E, Reinhard C, Ingelfinger D, et al. Requirement of prorenin receptor and vacuolar H+-ATPase-mediated acidification for Wnt signaling. Science. 2010;327:459-63 pubmed publisher
  320. Utsunomiya H, Cheng Y, Lin Z, Reierstad S, Yin P, Attar E, et al. Upstream stimulatory factor-2 regulates steroidogenic factor-1 expression in endometriosis. Mol Endocrinol. 2008;22:904-14 pubmed publisher
  321. Lee H, Zhu X, Casadesus G, Pallas M, Camins A, O'NEILL M, et al. The effect of mGluR2 activation on signal transduction pathways and neuronal cell survival. Brain Res. 2009;1249:244-50 pubmed publisher
  322. Schnizler M, Schnizler K, Zha X, Hall D, Wemmie J, Hell J, et al. The cytoskeletal protein alpha-actinin regulates acid-sensing ion channel 1a through a C-terminal interaction. J Biol Chem. 2009;284:2697-705 pubmed publisher
  323. Dieterich D, Karpova A, Mikhaylova M, Zdobnova I, König I, Landwehr M, et al. Caldendrin-Jacob: a protein liaison that couples NMDA receptor signalling to the nucleus. PLoS Biol. 2008;6:e34 pubmed publisher
  324. Tomishige N, Kumagai K, Kusuda J, Nishijima M, Hanada K. Casein kinase I{gamma}2 down-regulates trafficking of ceramide in the synthesis of sphingomyelin. Mol Biol Cell. 2009;20:348-57 pubmed publisher
  325. Sunwoo H, Dinger M, Wilusz J, Amaral P, Mattick J, Spector D. MEN epsilon/beta nuclear-retained non-coding RNAs are up-regulated upon muscle differentiation and are essential components of paraspeckles. Genome Res. 2009;19:347-59 pubmed publisher
  326. Chae Y, Kang S, Kim M, Woo J, Lee J, Chang S, et al. Human AQP5 plays a role in the progression of chronic myelogenous leukemia (CML). PLoS ONE. 2008;3:e2594 pubmed publisher
  327. Baumforth K, Birgersdotter A, Reynolds G, Wei W, Kapatai G, Flavell J, et al. Expression of the Epstein-Barr virus-encoded Epstein-Barr virus nuclear antigen 1 in Hodgkin's lymphoma cells mediates Up-regulation of CCL20 and the migration of regulatory T cells. Am J Pathol. 2008;173:195-204 pubmed publisher
  328. Friedman J, Lackner L, West M, DiBenedetto J, Nunnari J, Voeltz G. ER tubules mark sites of mitochondrial division. Science. 2011;334:358-62 pubmed publisher
  329. Roger T, Froidevaux C, Le Roy D, Reymond M, Chanson A, Mauri D, et al. Protection from lethal gram-negative bacterial sepsis by targeting Toll-like receptor 4. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2348-52 pubmed publisher
  330. Oldenburg M, Krüger A, Ferstl R, Kaufmann A, Nees G, Sigmund A, et al. TLR13 recognizes bacterial 23S rRNA devoid of erythromycin resistance-forming modification. Science. 2012;337:1111-5 pubmed publisher
  331. Simon D, Vadakkadath Meethal S, Wilson A, Gallego M, Weinecke S, Bruce E, et al. Activin receptor signaling regulates prostatic epithelial cell adhesion and viability. Neoplasia. 2009;11:365-76 pubmed
  332. Shen Y, Tenney A, Busch S, Horn K, Cuascut F, Liu K, et al. PTPsigma is a receptor for chondroitin sulfate proteoglycan, an inhibitor of neural regeneration. Science. 2009;326:592-6 pubmed publisher
  333. Beck H, Semisch M, Culmsee C, Plesnila N, Hatzopoulos A. Egr-1 regulates expression of the glial scar component phosphacan in astrocytes after experimental stroke. Am J Pathol. 2008;173:77-92 pubmed publisher
  334. Ní Chonghaile T, Sarosiek K, Vo T, Ryan J, Tammareddi A, Moore V, et al. Pretreatment mitochondrial priming correlates with clinical response to cytotoxic chemotherapy. Science. 2011;334:1129-33 pubmed publisher
  335. Lee B, Moon J, Shu J, Yuan L, Newman Z, Schekman R, et al. UNC93B1 mediates differential trafficking of endosomal TLRs. elife. 2013;2:e00291 pubmed publisher
  336. Fine B, Hodakoski C, Koujak S, Su T, Saal L, Maurer M, et al. Activation of the PI3K pathway in cancer through inhibition of PTEN by exchange factor P-REX2a. Science. 2009;325:1261-5 pubmed publisher
  337. Butler T, Smith K, Self R, Braden B, Prendergast M. Sex differences in the neurotoxic effects of adenosine A1 receptor antagonism during ethanol withdrawal: reversal with an A1 receptor agonist or an NMDA receptor antagonist. Alcohol Clin Exp Res. 2008;32:1260-70 pubmed publisher
  338. Fogg D, Sibon C, Miled C, Jung S, Aucouturier P, Littman D, et al. A clonogenic bone marrow progenitor specific for macrophages and dendritic cells. Science. 2006;311:83-7 pubmed
  339. Nishitsuji K, Tomiyama T, Ishibashi K, Ito K, Teraoka R, Lambert M, et al. The E693Delta mutation in amyloid precursor protein increases intracellular accumulation of amyloid beta oligomers and causes endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis in cultured cells. Am J Pathol. 2009;174:957-69 pubmed publisher
  340. Yu L, Saile K, Swartz C, He H, Zheng X, Kissling G, et al. Differential expression of receptor tyrosine kinases (RTKs) and IGF-I pathway activation in human uterine leiomyomas. Mol Med. 2008;14:264-75 pubmed publisher
  341. Riquelme C, Magida J, Harrison B, Wall C, Marr T, Secor S, et al. Fatty acids identified in the Burmese python promote beneficial cardiac growth. Science. 2011;334:528-31 pubmed publisher
  342. Sathish N, Zhu F, Yuan Y. Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus ORF45 interacts with kinesin-2 transporting viral capsid-tegument complexes along microtubules. PLoS Pathog. 2009;5:e1000332 pubmed publisher
  343. Alerte T, Akinfolarin A, Friedrich E, Mader S, Hong C, Perez R. Alpha-synuclein aggregation alters tyrosine hydroxylase phosphorylation and immunoreactivity: lessons from viral transduction of knockout mice. Neurosci Lett. 2008;435:24-9 pubmed publisher
  344. Zella L, Shevde N, Hollis B, Cooke N, Pike J. Vitamin D-binding protein influences total circulating levels of 1,25-dihydroxyvitamin D3 but does not directly modulate the bioactive levels of the hormone in vivo. Endocrinology. 2008;149:3656-67 pubmed publisher
  345. Dressel R, Schindehütte J, Kuhlmann T, Elsner L, Novota P, Baier P, et al. The tumorigenicity of mouse embryonic stem cells and in vitro differentiated neuronal cells is controlled by the recipients' immune response. PLoS ONE. 2008;3:e2622 pubmed publisher
  346. Freed W, Chen J, Bäckman C, Schwartz C, Vazin T, Cai J, et al. Gene expression profile of neuronal progenitor cells derived from hESCs: activation of chromosome 11p15.5 and comparison to human dopaminergic neurons. PLoS ONE. 2008;3:e1422 pubmed publisher
  347. Cho H, Cho H, Lee H, Song M, Seo J, Bae Y, et al. Vascular calcifying progenitor cells possess bidirectional differentiation potentials. PLoS Biol. 2013;11:e1001534 pubmed publisher
  348. Lebon L, Lee T, Sprinzak D, Jafar-Nejad H, Elowitz M. Fringe proteins modulate Notch-ligand cis and trans interactions to specify signaling states. elife. 2014;3:e02950 pubmed publisher
  349. Wachter E, Quante T, Merusi C, Arczewska A, Stewart F, Webb S, et al. Synthetic CpG islands reveal DNA sequence determinants of chromatin structure. elife. 2014;3:e03397 pubmed publisher
  350. Yeruva S, Ramadori G, Raddatz D. NF-kappaB-dependent synergistic regulation of CXCL10 gene expression by IL-1beta and IFN-gamma in human intestinal epithelial cell lines. Int J Colorectal Dis. 2008;23:305-17 pubmed
  351. Gottipati S, Cammarata P. Mitochondrial superoxide dismutase activation with 17 beta-estradiol-treated human lens epithelial cells. Mol Vis. 2008;14:898-905 pubmed
  352. Ma G, Miettinen S, Porola P, Hedman K, Salo J, Konttinen Y. Human parainfluenza virus type 2 (HPIV2) induced host ADAM8 expression in human salivary adenocarcinoma cell line (HSY) during cell fusion. BMC Microbiol. 2009;9:55 pubmed publisher
  353. Menacho-Marquez M, García-Escudero R, Ojeda V, Abad A, Delgado P, Costa C, et al. The Rho exchange factors Vav2 and Vav3 favor skin tumor initiation and promotion by engaging extracellular signaling loops. PLoS Biol. 2013;11:e1001615 pubmed publisher
  354. Che X, Reichelt M, Sommer M, Rajamani J, Zerboni L, Arvin A. Functions of the ORF9-to-ORF12 gene cluster in varicella-zoster virus replication and in the pathogenesis of skin infection. J Virol. 2008;82:5825-34 pubmed publisher
  355. Suvorova E, Gripentrog J, Oppermann M, Miettinen H. Role of the carboxyl terminal di-leucine in phosphorylation and internalization of C5a receptor. Biochim Biophys Acta. 2008;1783:1261-70 pubmed publisher
  356. Hammar P, Leroy P, Mahmutovic A, Marklund E, Berg O, Elf J. The lac repressor displays facilitated diffusion in living cells. Science. 2012;336:1595-8 pubmed publisher
  357. Chang E, Charn T, Park S, Helferich W, Komm B, Katzenellenbogen J, et al. Estrogen Receptors alpha and beta as determinants of gene expression: influence of ligand, dose, and chromatin binding. Mol Endocrinol. 2008;22:1032-43 pubmed publisher
  358. Roth D, Hutt D, Tong J, Bouchecareilh M, Wang N, Seeley T, et al. Modulation of the maladaptive stress response to manage diseases of protein folding. PLoS Biol. 2014;12:e1001998 pubmed publisher
  359. Round J, Lee S, Li J, Tran G, Jabri B, Chatila T, et al. The Toll-like receptor 2 pathway establishes colonization by a commensal of the human microbiota. Science. 2011;332:974-7 pubmed publisher
  360. Zhao Y, Takeyama K, Sawatsubashi S, Ito S, Suzuki E, Yamagata K, et al. Corepressive action of CBP on androgen receptor transactivation in pericentric heterochromatin in a Drosophila experimental model system. Mol Cell Biol. 2009;29:1017-34 pubmed publisher
  361. Nold-Petry C, Nold M, Zepp J, Kim S, Voelkel N, Dinarello C. IL-32-dependent effects of IL-1beta on endothelial cell functions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:3883-8 pubmed publisher
  362. McCartney S, Thackray L, Gitlin L, Gilfillan S, Virgin H, Virgin Iv H, et al. MDA-5 recognition of a murine norovirus. PLoS Pathog. 2008;4:e1000108 pubmed publisher
  363. Tran T, Temkin V, Shi B, Pagliari L, Daniel S, Ferran C, et al. TNFalpha-induced macrophage death via caspase-dependent and independent pathways. Apoptosis. 2009;14:320-32 pubmed publisher
  364. Guo X, Zhang G, Wang J, Liu W, Wang F, Dong J, et al. Prognostic relevance of Centromere protein H expression in esophageal carcinoma. BMC Cancer. 2008;8:233 pubmed publisher
  365. Le Clorennec C, Ouk T, Youlyouz-Marfak I, Panteix S, Martin C, Rastelli J, et al. Molecular basis of cytotoxicity of Epstein-Barr virus (EBV) latent membrane protein 1 (LMP1) in EBV latency III B cells: LMP1 induces type II ligand-independent autoactivation of CD95/Fas with caspase 8-mediated apoptosis. J Virol. 2008;82:6721-33 pubmed publisher
  366. Schneider D, Manzan M, Crawford R, Chen W, Kaminski N. 2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin-mediated impairment of B cell differentiation involves dysregulation of paired box 5 (Pax5) isoform, Pax5a. J Pharmacol Exp Ther. 2008;326:463-74 pubmed publisher
  367. Campos-Toimil M, Keravis T, Orallo F, Takeda K, Lugnier C. Short-term or long-term treatments with a phosphodiesterase-4 (PDE4) inhibitor result in opposing agonist-induced Ca(2+) responses in endothelial cells. Br J Pharmacol. 2008;154:82-92 pubmed publisher
  368. Kim T, Oh S, Kim Y, Lee M, Kim H, Myung S. Granulocyte macrophage colony-stimulating factor may modulate the post-transcription pathway of interleukin-6 expression in prostate carcinoma cells. J Korean Med Sci. 2008;23:94-7 pubmed publisher
  369. Martín-Vílchez S, Molina-Jiménez F, Alonso-Lebrero J, Sanz-Cameno P, Rodríguez-Muñoz Y, Benedicto I, et al. AM3, a natural glycoconjugate, induces the functional maturation of human dendritic cells. Br J Pharmacol. 2008;154:698-708 pubmed publisher
  370. Arenas F, Hervias I, Uriz M, Joplin R, Prieto J, Medina J. Combination of ursodeoxycholic acid and glucocorticoids upregulates the AE2 alternate promoter in human liver cells. J Clin Invest. 2008;118:695-709 pubmed publisher
  371. Capitini C, Herby S, Milliron M, Anver M, Mackall C, Fry T. Bone marrow deficient in IFN-{gamma} signaling selectively reverses GVHD-associated immunosuppression and enhances a tumor-specific GVT effect. Blood. 2009;113:5002-9 pubmed publisher
  372. Cardoso C, Groth-Pedersen L, Høyer-Hansen M, Kirkegaard T, Corcelle E, Andersen J, et al. Depletion of kinesin 5B affects lysosomal distribution and stability and induces peri-nuclear accumulation of autophagosomes in cancer cells. PLoS ONE. 2009;4:e4424 pubmed publisher
  373. Olszak T, An D, Zeissig S, Vera M, Richter J, Franke A, et al. Microbial exposure during early life has persistent effects on natural killer T cell function. Science. 2012;336:489-93 pubmed publisher
  374. Hyman M, Petrovic-Djergovic D, Visovatti S, Liao H, Yanamadala S, Bouïs D, et al. Self-regulation of inflammatory cell trafficking in mice by the leukocyte surface apyrase CD39. J Clin Invest. 2009;119:1136-49 pubmed publisher
  375. Rosengren A, Jokubka R, Tojjar D, Granhall C, Hansson O, Li D, et al. Overexpression of alpha2A-adrenergic receptors contributes to type 2 diabetes. Science. 2010;327:217-20 pubmed publisher
  376. Yavelsky V, Rohkin S, Shaco-Levy R, Tzikinovsky A, Amir T, Kohn H, et al. Native human autoantibodies targeting GIPC1 identify differential expression in malignant tumors of the breast and ovary. BMC Cancer. 2008;8:247 pubmed publisher
  377. Kron K, Pethe V, Briollais L, Sadikovic B, Ozcelik H, Sunderji A, et al. Discovery of novel hypermethylated genes in prostate cancer using genomic CpG island microarrays. PLoS ONE. 2009;4:e4830 pubmed publisher
  378. Thaunat O, Granja A, Barral P, Filby A, Montaner B, Collinson L, et al. Asymmetric segregation of polarized antigen on B cell division shapes presentation capacity. Science. 2012;335:475-9 pubmed publisher
  379. Wu W, Alexis N, Chen X, Bromberg P, Peden D. Involvement of mitogen-activated protein kinases and NFkappaB in LPS-induced CD40 expression on human monocytic cells. Toxicol Appl Pharmacol. 2008;228:135-43 pubmed publisher
  380. Lam W, Tang J, Yeung A, Chiu L, Sung J, Chan P. Avian influenza virus A/HK/483/97(H5N1) NS1 protein induces apoptosis in human airway epithelial cells. J Virol. 2008;82:2741-51 pubmed publisher
  381. Zhang Y, Liu T, Yan P, Huang T, DeWille J. Identification and characterization of CCAAT/Enhancer Binding proteindelta (C/EBPdelta) target genes in G0 growth arrested mammary epithelial cells. BMC Mol Biol. 2008;9:83 pubmed publisher
  382. Lu Q, Zhang J, Allison R, Gay H, Yang W, Bhowmick N, et al. Identification of extracellular delta-catenin accumulation for prostate cancer detection. Prostate. 2009;69:411-8 pubmed publisher
  383. Voth D, Heinzen R. Sustained activation of Akt and Erk1/2 is required for Coxiella burnetii antiapoptotic activity. Infect Immun. 2009;77:205-13 pubmed publisher
  384. Jin D, Ojcius D, Sun D, Dong H, Luo Y, Mao Y, et al. Leptospira interrogans induces apoptosis in macrophages via caspase-8- and caspase-3-dependent pathways. Infect Immun. 2009;77:799-809 pubmed publisher
  385. Issar N, Roux E, Mattei D, Scherf A. Identification of a novel post-translational modification in Plasmodium falciparum: protein sumoylation in different cellular compartments. Cell Microbiol. 2008;10:1999-2011 pubmed publisher
  386. Li Y, Maedler K, Shu L, Haataja L. UCP-2 and UCP-3 proteins are differentially regulated in pancreatic beta-cells. PLoS ONE. 2008;3:e1397 pubmed publisher
  387. Perfettini J, Nardacci R, Bourouba M, Subra F, Gros L, Séror C, et al. Critical involvement of the ATM-dependent DNA damage response in the apoptotic demise of HIV-1-elicited syncytia. PLoS ONE. 2008;3:e2458 pubmed publisher
  388. Longo N, Lugar P, Yavuz S, Zhang W, Krijger P, Russ D, et al. Analysis of somatic hypermutation in X-linked hyper-IgM syndrome shows specific deficiencies in mutational targeting. Blood. 2009;113:3706-15 pubmed publisher
  389. Yap O, Bhat G, Liu L, Tollefsbol T. Epigenetic modifications of the Estrogen receptor beta gene in epithelial ovarian cancer cells. Anticancer Res. 2009;29:139-44 pubmed
  390. Tan Y, Abad C, Lopez R, Dong H, Liu S, Lee A, et al. Pituitary adenylyl cyclase-activating polypeptide is an intrinsic regulator of Treg abundance and protects against experimental autoimmune encephalomyelitis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2012-7 pubmed publisher
  391. Yang H, Shen L, Siliciano R, Pomerantz J. Isolation of a cellular factor that can reactivate latent HIV-1 without T cell activation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:6321-6 pubmed publisher
  392. Sprynski A, Hose D, Caillot L, Reme T, Shaughnessy J, Barlogie B, et al. The role of IGF-1 as a major growth factor for myeloma cell lines and the prognostic relevance of the expression of its receptor. Blood. 2009;113:4614-26 pubmed publisher
  393. Dianzani C, Brucato L, Gallicchio M, Rosa A, Collino M, Fantozzi R. Celecoxib modulates adhesion of HT29 colon cancer cells to vascular endothelial cells by inhibiting ICAM-1 and VCAM-1 expression. Br J Pharmacol. 2008;153:1153-61 pubmed
  394. Wu W, Sung J, Wu Y, Li Z, Yu L, Cho C. Bone morphogenetic protein signalling is required for the anti-mitogenic effect of the proteasome inhibitor MG-132 on colon cancer cells. Br J Pharmacol. 2008;154:632-8 pubmed publisher
  395. Fan H, Zhao Z, Cheng J, Su X, Wu Q, Shan Y. Overexpression of DNA methyltransferase 1 and its biological significance in primary hepatocellular carcinoma. World J Gastroenterol. 2009;15:2020-6 pubmed
  396. Jain M, Nilsson R, Sharma S, Madhusudhan N, Kitami T, Souza A, et al. Metabolite profiling identifies a key role for glycine in rapid cancer cell proliferation. Science. 2012;336:1040-4 pubmed publisher
  397. Schuller H, Al-Wadei H, Majidi M. Gamma-aminobutyric acid, a potential tumor suppressor for small airway-derived lung adenocarcinoma. Carcinogenesis. 2008;29:1979-85 pubmed publisher
  398. Wang W, Zhao X, Wang H, Liang Y. Increased fatty acid synthase as a potential therapeutic target in multiple myeloma. J Zhejiang Univ Sci B. 2008;9:441-7 pubmed publisher
  399. Xie Z, Wroblewska L, Prochazka L, Weiss R, Benenson Y. Multi-input RNAi-based logic circuit for identification of specific cancer cells. Science. 2011;333:1307-11 pubmed publisher
  400. Djoba Siawaya J, Roberts T, Babb C, Black G, Golakai H, Stanley K, et al. An evaluation of commercial fluorescent bead-based luminex cytokine assays. PLoS ONE. 2008;3:e2535 pubmed publisher
  401. Adrain C, Zettl M, Christova Y, Taylor N, Freeman M. Tumor necrosis factor signaling requires iRhom2 to promote trafficking and activation of TACE. Science. 2012;335:225-8 pubmed publisher
  402. Bogunovic D, Byun M, Durfee L, Abhyankar A, Sanal O, Mansouri D, et al. Mycobacterial disease and impaired IFN-γ immunity in humans with inherited ISG15 deficiency. Science. 2012;337:1684-8 pubmed
  403. Vincent B, Lancaster A, Scherz-Shouval R, Whitesell L, Lindquist S. Fitness trade-offs restrict the evolution of resistance to amphotericin B. PLoS Biol. 2013;11:e1001692 pubmed publisher
  404. Stros M, Polanská E, Struncová S, Pospisilova S. HMGB1 and HMGB2 proteins up-regulate cellular expression of human topoisomerase IIalpha. Nucleic Acids Res. 2009;37:2070-86 pubmed publisher
  405. Godinez I, Raffatellu M, Chu H, Paixao T, Haneda T, Santos R, et al. Interleukin-23 orchestrates mucosal responses to Salmonella enterica serotype Typhimurium in the intestine. Infect Immun. 2009;77:387-98 pubmed publisher
  406. Amoruso A, Bardelli C, Gunella G, Ribichini F, Brunelleschi S. A novel activity for substance P: stimulation of peroxisome proliferator-activated receptor-gamma protein expression in human monocytes and macrophages. Br J Pharmacol. 2008;154:144-52 pubmed publisher
  407. Janic B, Iskander A, Rad A, Soltanian-Zadeh H, Arbab A. Effects of ferumoxides-protamine sulfate labeling on immunomodulatory characteristics of macrophage-like THP-1 cells. PLoS ONE. 2008;3:e2499 pubmed publisher
  408. Bonneh-Barkay D, Bissel S, Wang G, Fish K, Nicholl G, Darko S, et al. YKL-40, a marker of simian immunodeficiency virus encephalitis, modulates the biological activity of basic fibroblast growth factor. Am J Pathol. 2008;173:130-43 pubmed publisher
  409. Khandrika L, Lieberman R, Koul S, Kumar B, Maroni P, Chandhoke R, et al. Hypoxia-associated p38 mitogen-activated protein kinase-mediated androgen receptor activation and increased HIF-1alpha levels contribute to emergence of an aggressive phenotype in prostate cancer. Oncogene. 2009;28:1248-60 pubmed publisher
  410. Yang J, Zhao T, Goldstein J, Brown M. Inhibition of ghrelin O-acyltransferase (GOAT) by octanoylated pentapeptides. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:10750-5 pubmed publisher
  411. Kowalski M, Wolska A, Grzegorczyk J, Hilt J, Jarzebska M, Drobniewski M, et al. Increased responsiveness to toll-like receptor 4 stimulation in peripheral blood mononuclear cells from patients with recent onset rheumatoid arthritis. Mediators Inflamm. 2008;2008:132732 pubmed publisher
  412. Petersen A, Carlsson T, Karlsson J, Jonhede S, Zetterberg M. Effects of dexamethasone on human lens epithelial cells in culture. Mol Vis. 2008;14:1344-52 pubmed
  413. Kirino Y, Takeno M, Watanabe R, Murakami S, Kobayashi M, Ideguchi H, et al. Association of reduced heme oxygenase-1 with excessive Toll-like receptor 4 expression in peripheral blood mononuclear cells in Behçet's disease. Arthritis Res Ther. 2008;10:R16 pubmed publisher
  414. Schiller H, Szekeres A, Binder B, Stockinger H, Leksa V. Mannose 6-phosphate/insulin-like growth factor 2 receptor limits cell invasion by controlling alphaVbeta3 integrin expression and proteolytic processing of urokinase-type plasminogen activator receptor. Mol Biol Cell. 2009;20:745-56 pubmed publisher
  415. Cao M, Mao Z, Kam C, Xiao N, Cao X, Shen C, et al. PICK1 and ICA69 control insulin granule trafficking and their deficiencies lead to impaired glucose tolerance. PLoS Biol. 2013;11:e1001541 pubmed publisher
  416. Brochet M, Collins M, Smith T, Thompson E, Sebastian S, Volkmann K, et al. Phosphoinositide metabolism links cGMP-dependent protein kinase G to essential Ca²⁺ signals at key decision points in the life cycle of malaria parasites. PLoS Biol. 2014;12:e1001806 pubmed publisher
  417. Huang Y, Bao Y, Peng W, Goldberg M, Love K, Bumcrot D, et al. Claudin-3 gene silencing with siRNA suppresses ovarian tumor growth and metastasis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:3426-30 pubmed publisher
  418. Esteban V, Heringer-Walther S, Sterner-Kock A, de Bruin R, van den Engel S, Wang Y, et al. Angiotensin-(1-7) and the g protein-coupled receptor MAS are key players in renal inflammation. PLoS ONE. 2009;4:e5406 pubmed publisher
  419. Kuerten S, Schlingmann T, Rajasalu T, Angelov D, Lehmann P, Tary-Lehmann M. Lack of disease specificity limits the usefulness of in vitro costimulation in HIV- and HCV-infected patients. Clin Dev Immunol. 2008;2008:590941 pubmed publisher
  420. Slipicevic A, Jørgensen K, Skrede M, Rosnes A, Trøen G, Davidson B, et al. The fatty acid binding protein 7 (FABP7) is involved in proliferation and invasion of melanoma cells. BMC Cancer. 2008;8:276 pubmed publisher
  421. Burdak-Rothkamm S, Rothkamm K, Prise K. ATM acts downstream of ATR in the DNA damage response signaling of bystander cells. Cancer Res. 2008;68:7059-65 pubmed publisher
  422. Chan C, Wong N, Liu Y, Bicknell D, Turley H, Hollins L, et al. Gastrointestinal differentiation marker Cytokeratin 20 is regulated by homeobox gene CDX1. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:1936-41 pubmed publisher
  423. Vaishnava S, Yamamoto M, Severson K, Ruhn K, Yu X, Koren O, et al. The antibacterial lectin RegIIIgamma promotes the spatial segregation of microbiota and host in the intestine. Science. 2011;334:255-8 pubmed publisher
  424. Kwon H, Oh S, Kim J. Glabridin, a functional compound of liquorice, attenuates colonic inflammation in mice with dextran sulphate sodium-induced colitis. Clin Exp Immunol. 2008;151:165-73 pubmed
  425. Peng T, Chen J, Mao W, Liu X, Tao Y, Chen L, et al. Potential therapeutic significance of increased expression of aryl hydrocarbon receptor in human gastric cancer. World J Gastroenterol. 2009;15:1719-29 pubmed
  426. Pessina F, Lowndes N. The RSF1 histone-remodelling factor facilitates DNA double-strand break repair by recruiting centromeric and Fanconi Anaemia proteins. PLoS Biol. 2014;12:e1001856 pubmed publisher
  427. Colombatti M, Grasso S, Porzia A, Fracasso G, Scupoli M, Cingarlini S, et al. The prostate specific membrane antigen regulates the expression of IL-6 and CCL5 in prostate tumour cells by activating the MAPK pathways. PLoS ONE. 2009;4:e4608 pubmed publisher
  428. Chen Y, Hsu H, Chen Y, Tsai T, How C, Wang C, et al. Oct-4 expression maintained cancer stem-like properties in lung cancer-derived CD133-positive cells. PLoS ONE. 2008;3:e2637 pubmed publisher
  429. Sigulinsky C, Green E, Clark A, Levine E. Vsx2/Chx10 ensures the correct timing and magnitude of Hedgehog signaling in the mouse retina. Dev Biol. 2008;317:560-75 pubmed publisher
  430. Shin Y, Kim M, Oh J, Wee W, Lee J, Ko J, et al. Short-term Efficacy of Topical Immunosuppressive Agents on the Survival of Cultivated Allo-Conjunctival Equivalents. Korean J Ophthalmol. 2008;22:123-9 pubmed publisher
  431. Simeone A, McMurtry V, Nieves-Alicea R, Saavedra J, Keefer L, Johnson M, et al. TIMP-2 mediates the anti-invasive effects of the nitric oxide-releasing prodrug JS-K in breast cancer cells. Breast Cancer Res. 2008;10:R44 pubmed publisher
  432. Schroering A, Williams K. Rapid induction of chromatin-associated DNA mismatch repair proteins after MNNG treatment. DNA Repair (Amst). 2008;7:951-69 pubmed publisher
  433. Korhonen H, Fisslthaler B, Moers A, Wirth A, Habermehl D, Wieland T, et al. Anaphylactic shock depends on endothelial Gq/G11. J Exp Med. 2009;206:411-20 pubmed publisher
  434. Maître J, Berthoumieux H, Krens S, Salbreux G, Jülicher F, Paluch E, et al. Adhesion functions in cell sorting by mechanically coupling the cortices of adhering cells. Science. 2012;338:253-6 pubmed publisher
  435. Maluykova I, Gutsal O, Laiko M, Kane A, Donowitz M, Kovbasnjuk O. Latrunculin B facilitates Shiga toxin 1 transcellular transcytosis across T84 intestinal epithelial cells. Biochim Biophys Acta. 2008;1782:370-7 pubmed publisher
  436. Dylla D, Michele D, Campbell K, McCray P. Basolateral entry and release of New and Old World arenaviruses from human airway epithelia. J Virol. 2008;82:6034-8 pubmed publisher
  437. Reber L, Vermeulen L, Haegeman G, Frossard N. Ser276 phosphorylation of NF-kB p65 by MSK1 controls SCF expression in inflammation. PLoS ONE. 2009;4:e4393 pubmed publisher
  438. Liu D, Jin L, Wang H, Zhao H, Zhao C, Duan C, et al. Silencing alpha-synuclein gene expression enhances tyrosine hydroxylase activity in MN9D cells. Neurochem Res. 2008;33:1401-9 pubmed publisher
  439. Zhang S, Balch C, Chan M, Lai H, Matei D, Schilder J, et al. Identification and characterization of ovarian cancer-initiating cells from primary human tumors. Cancer Res. 2008;68:4311-20 pubmed publisher
  440. Bernardino A, Myers T, Alvarez X, Hasegawa A, Philipp M. Toll-like receptors: insights into their possible role in the pathogenesis of lyme neuroborreliosis. Infect Immun. 2008;76:4385-95 pubmed publisher
  441. Tan Y, Zhang B, Wu T, Skogerbø G, Zhu X, Guo X, et al. Transcriptional inhibiton of Hoxd4 expression by miRNA-10a in human breast cancer cells. BMC Mol Biol. 2009;10:12 pubmed publisher
  442. Lechner S, Frenzel H, Wang R, Lewin G. Developmental waves of mechanosensitivity acquisition in sensory neuron subtypes during embryonic development. EMBO J. 2009;28:1479-91 pubmed publisher
  443. Brohawn S, del Mármol J, MacKinnon R. Crystal structure of the human K2P TRAAK, a lipid- and mechano-sensitive K+ ion channel. Science. 2012;335:436-41 pubmed publisher
  444. Brough D, Pelegrin P, Rothwell N. Pannexin-1-dependent caspase-1 activation and secretion of IL-1beta is regulated by zinc. Eur J Immunol. 2009;39:352-8 pubmed publisher
  445. Garbarini N, Delpire E. The RCC1 domain of protein associated with Myc (PAM) interacts with and regulates KCC2. Cell Physiol Biochem. 2008;22:31-44 pubmed publisher
  446. Martínez-Sanz E, Del Río A, Barrio C, Murillo J, Maldonado E, Garcillán B, et al. Alteration of medial-edge epithelium cell adhesion in two Tgf-beta3 null mouse strains. Differentiation. 2008;76:417-30 pubmed
  447. Lei P, Abdelrahim M, Cho S, Liu S, Chintharlapalli S, Safe S. 1,1-Bis(3'-indolyl)-1-(p-substituted phenyl)methanes inhibit colon cancer cell and tumor growth through activation of c-jun N-terminal kinase. Carcinogenesis. 2008;29:1139-47 pubmed publisher
  448. Hockings J, Degner S, Morgan S, Kemp M, Romagnolo D. Involvement of a specificity proteins-binding element in regulation of basal and estrogen-induced transcription activity of the BRCA1 gene. Breast Cancer Res. 2008;10:R29 pubmed publisher
  449. Harduf H, Goldman S, Shalev E. Progesterone receptor A and c-Met mediates spheroids-endometrium attachment. Reprod Biol Endocrinol. 2009;7:14 pubmed publisher
  450. Mense S, Chhabra J, Bhat H. Preferential induction of cytochrome P450 1A1 over cytochrome P450 1B1 in human breast epithelial cells following exposure to quercetin. J Steroid Biochem Mol Biol. 2008;110:157-62 pubmed publisher
  451. Makarem M, Kannan N, Nguyen L, Knapp D, Balani S, Prater M, et al. Developmental changes in the in vitro activated regenerative activity of primitive mammary epithelial cells. PLoS Biol. 2013;11:e1001630 pubmed publisher
  452. Stoikos C, Harrison C, Salamonsen L, Dimitriadis E. A distinct cohort of the TGFbeta superfamily members expressed in human endometrium regulate decidualization. Hum Reprod. 2008;23:1447-56 pubmed publisher
  453. Sengupta P, Philip F, Scarlata S. Caveolin-1 alters Ca(2+) signal duration through specific interaction with the G alpha q family of G proteins. J Cell Sci. 2008;121:1363-72 pubmed publisher
  454. Sato Y, Iketani M, Kurihara Y, Yamaguchi M, Yamashita N, Nakamura F, et al. Cartilage acidic protein-1B (LOTUS), an endogenous Nogo receptor antagonist for axon tract formation. Science. 2011;333:769-73 pubmed publisher
  455. Werner S, Dotzlaf J, Smith R. MMP-28 as a regulator of myelination. BMC Neurosci. 2008;9:83 pubmed publisher
  456. Ramamoorthi K, Fropf R, Belfort G, Fitzmaurice H, McKinney R, Neve R, et al. Npas4 regulates a transcriptional program in CA3 required for contextual memory formation. Science. 2011;334:1669-75 pubmed publisher
  457. Liang M, Wendland J, Chuang D. Lithium inhibits Smad3/4 transactivation via increased CREB activity induced by enhanced PKA and AKT signaling. Mol Cell Neurosci. 2008;37:440-53 pubmed
  458. Cambray S, Pedraza N, Rafel M, Garí E, Aldea M, Gallego C. Protein kinase KIS localizes to RNA granules and enhances local translation. Mol Cell Biol. 2009;29:726-35 pubmed publisher
  459. Ko H, Bailey R, Smith W, Liu Z, Shin J, Lee Y, et al. CHIP regulates leucine-rich repeat kinase-2 ubiquitination, degradation, and toxicity. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2897-902 pubmed publisher
  460. Flora A, Klisch T, Schuster G, Zoghbi H. Deletion of Atoh1 disrupts Sonic Hedgehog signaling in the developing cerebellum and prevents medulloblastoma. Science. 2009;326:1424-7 pubmed publisher
  461. Treusch S, Hamamichi S, Goodman J, Matlack K, Chung C, Baru V, et al. Functional links between Aβ toxicity, endocytic trafficking, and Alzheimer's disease risk factors in yeast. Science. 2011;334:1241-5 pubmed publisher
  462. Singh D, Chan J, Zoppoli P, Niola F, Sullivan R, Castaño A, et al. Transforming fusions of FGFR and TACC genes in human glioblastoma. Science. 2012;337:1231-5 pubmed publisher
  463. Sancho R, Blake S, Tendeng C, Clurman B, Lewis J, Behrens A. Fbw7 repression by hes5 creates a feedback loop that modulates Notch-mediated intestinal and neural stem cell fate decisions. PLoS Biol. 2013;11:e1001586 pubmed publisher
  464. Bosveld F, Bonnet I, Guirao B, Tlili S, Wang Z, Petitalot A, et al. Mechanical control of morphogenesis by Fat/Dachsous/Four-jointed planar cell polarity pathway. Science. 2012;336:724-7 pubmed publisher
  465. Deng H, Hughes S, Bell J, Simmonds A. Alternative requirements for Vestigial, Scalloped, and Dmef2 during muscle differentiation in Drosophila melanogaster. Mol Biol Cell. 2009;20:256-69 pubmed publisher
  466. Schultz K, Wetter J, Fiore D, Friesen P. Transactivator IE1 is required for baculovirus early replication events that trigger apoptosis in permissive and nonpermissive cells. J Virol. 2009;83:262-72 pubmed publisher
  467. Whitfield Z, Chisholm J, Hawley R, Orr-Weaver T. A meiosis-specific form of the APC/C promotes the oocyte-to-embryo transition by decreasing levels of the Polo kinase inhibitor matrimony. PLoS Biol. 2013;11:e1001648 pubmed publisher
  468. Colombani J, Andersen D, Leopold P. Secreted peptide Dilp8 coordinates Drosophila tissue growth with developmental timing. Science. 2012;336:582-5 pubmed publisher
  469. Wilson P, Fazzone W, LaBonte M, Lenz H, Ladner R. Regulation of human dUTPase gene expression and p53-mediated transcriptional repression in response to oxaliplatin-induced DNA damage. Nucleic Acids Res. 2009;37:78-95 pubmed publisher
  470. Su L, Zhai R, Sheu C, Gallagher D, Gong M, Tejera P, et al. Genetic variants in the angiopoietin-2 gene are associated with increased risk of ARDS. Intensive Care Med. 2009;35:1024-30 pubmed publisher
  471. Vos M, Esposito G, Edirisinghe J, Vilain S, Haddad D, Slabbaert J, et al. Vitamin K2 is a mitochondrial electron carrier that rescues pink1 deficiency. Science. 2012;336:1306-10 pubmed publisher
  472. Zhao T, Graham O, Raposo A, St Johnston D. Growing microtubules push the oocyte nucleus to polarize the Drosophila dorsal-ventral axis. Science. 2012;336:999-1003 pubmed publisher
  473. Janda C, Waghray D, Levin A, Thomas C, Garcia K. Structural basis of Wnt recognition by Frizzled. Science. 2012;337:59-64 pubmed publisher
  474. Mendiburo M, Padeken J, Fülöp S, Schepers A, Heun P. Drosophila CENH3 is sufficient for centromere formation. Science. 2011;334:686-90 pubmed publisher
  475. Garelli A, Gontijo A, Miguela V, Caparros E, Dominguez M. Imaginal discs secrete insulin-like peptide 8 to mediate plasticity of growth and maturation. Science. 2012;336:579-82 pubmed publisher
  476. Djuranovic S, Nahvi A, Green R. miRNA-mediated gene silencing by translational repression followed by mRNA deadenylation and decay. Science. 2012;336:237-40 pubmed publisher
  477. Gu H, Roizman B. The two functions of herpes simplex virus 1 ICP0, inhibition of silencing by the CoREST/REST/HDAC complex and degradation of PML, are executed in tandem. J Virol. 2009;83:181-7 pubmed publisher
  478. Lee I, Kawai Y, Fergusson M, Rovira I, Bishop A, Motoyama N, et al. Atg7 modulates p53 activity to regulate cell cycle and survival during metabolic stress. Science. 2012;336:225-8 pubmed publisher
  479. Login F, Balmand S, Vallier A, Vincent-Monegat C, Vigneron A, Weiss-Gayet M, et al. Antimicrobial peptides keep insect endosymbionts under control. Science. 2011;334:362-5 pubmed publisher
  480. Hoskins A, Friedman L, Gallagher S, Crawford D, Anderson E, Wombacher R, et al. Ordered and dynamic assembly of single spliceosomes. Science. 2011;331:1289-95 pubmed publisher
  481. Li Z, Yi Y, Yin X, Zhang Z, Liu J. Expression of foot-and-mouth disease virus capsid proteins in silkworm-baculovirus expression system and its utilization as a subunit vaccine. PLoS ONE. 2008;3:e2273 pubmed publisher
  482. Heisel S, Ketter R, Keller A, Klein V, Pallasch C, Lenhof H, et al. Increased seroreactivity to glioma-expressed antigen 2 in brain tumor patients under radiation. PLoS ONE. 2008;3:e2164 pubmed publisher
  483. Li B, Li D, Li G, Wang H, Yu A. P58(IPK) inhibition of endoplasmic reticulum stress in human retinal capillary endothelial cells in vitro. Mol Vis. 2008;14:1122-8 pubmed
  484. Li B, Zhang H, Shi Y, Min Y, Lin S, Wu K, et al. Overexpression of nuclear transport factor 2 may protect against diabetic retinopathy. Mol Vis. 2009;15:861-9 pubmed
  485. Mangan S, Clancy P, Golledge J. Modulation of endothelial cell thrombomodulin by PPAR ligands--variation according to environment. Thromb Res. 2008;121:827-34 pubmed
  486. Choi Y, Nicholas J. Autocrine and paracrine promotion of cell survival and virus replication by human herpesvirus 8 chemokines. J Virol. 2008;82:6501-13 pubmed publisher
  487. Imaeda A, Watanabe A, Sohail M, Mahmood S, Mohamadnejad M, Sutterwala F, et al. Acetaminophen-induced hepatotoxicity in mice is dependent on Tlr9 and the Nalp3 inflammasome. J Clin Invest. 2009;119:305-14 pubmed publisher
  488. Julien S, Kreppel F, Beck S, Heiduschka P, Brito V, Schnichels S, et al. A reproducible and quantifiable model of choroidal neovascularization induced by VEGF A165 after subretinal adenoviral gene transfer in the rabbit. Mol Vis. 2008;14:1358-72 pubmed
  489. Zhang L, Wu Y, Jia Z, Zhang Y, Shen H, Wang X. Protective effects of a compound herbal extract (Tong Xin Luo) on free fatty acid induced endothelial injury: implications of antioxidant system. BMC Complement Altern Med. 2008;8:39 pubmed publisher
  490. Castillo-Acosta V, Ruiz-Perez L, Yang W, Gonzalez-Pacanowska D, Vidal A. Identification of a residue critical for the excision of 3'-blocking ends in apurinic/apyrimidinic endonucleases of the Xth family. Nucleic Acids Res. 2009;37:1829-42 pubmed publisher
  491. Yi Z, Cho S, Zhao H, Wu Y, Luo J, Li D, et al. A novel peptide from human apolipoprotein(a) inhibits angiogenesis and tumor growth by targeting c-Src phosphorylation in VEGF-induced human umbilical endothelial cells. Int J Cancer. 2009;124:843-52 pubmed publisher
  492. Clarke C, Forman S, Pritchett J, Ohanian V, Ohanian J. Phospholipase C-delta1 modulates sustained contraction of rat mesenteric small arteries in response to noradrenaline, but not endothelin-1. Am J Physiol Heart Circ Physiol. 2008;295:H826-34 pubmed publisher
  493. Karanikas V, Speletas M, Zamanakou M, Kalala F, Loules G, Kerenidi T, et al. Foxp3 expression in human cancer cells. J Transl Med. 2008;6:19 pubmed publisher
  494. Strååt K, de Klark R, Gredmark-Russ S, Eriksson P, Soderberg-Naucler C. Infection with human cytomegalovirus alters the MMP-9/TIMP-1 balance in human macrophages. J Virol. 2009;83:830-5 pubmed publisher
  495. O'Hagan K, Cocchiglia S, Zhdanov A, Tambuwala M, Tambawala M, Cummins E, et al. PGC-1alpha is coupled to HIF-1alpha-dependent gene expression by increasing mitochondrial oxygen consumption in skeletal muscle cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:2188-93 pubmed publisher
  496. Sarrazin A, Peel A, Averof M. A segmentation clock with two-segment periodicity in insects. Science. 2012;336:338-41 pubmed publisher
  497. Dho S, Deverman B, Lapid C, Manson S, Gan L, Riehm J, et al. Control of cellular Bcl-xL levels by deamidation-regulated degradation. PLoS Biol. 2013;11:e1001588 pubmed publisher
  498. Milovanova T, Bhopale V, Sorokina E, Moore J, Hunt T, Hauer-Jensen M, et al. Lactate stimulates vasculogenic stem cells via the thioredoxin system and engages an autocrine activation loop involving hypoxia-inducible factor 1. Mol Cell Biol. 2008;28:6248-61 pubmed publisher
  499. Ross E, Freeman S, Zhao Y, Dhanjal T, Ross E, Lax S, et al. A novel role for PECAM-1 (CD31) in regulating haematopoietic progenitor cell compartmentalization between the peripheral blood and bone marrow. PLoS ONE. 2008;3:e2338 pubmed publisher
  500. Levi B, Yilmaz O, Duester G, Morrison S. Aldehyde dehydrogenase 1a1 is dispensable for stem cell function in the mouse hematopoietic and nervous systems. Blood. 2009;113:1670-80 pubmed publisher
  501. He H, Wang Y, Guo X, Ramchandani S, Ma J, Shen M, et al. Pot1b deletion and telomerase haploinsufficiency in mice initiate an ATR-dependent DNA damage response and elicit phenotypes resembling dyskeratosis congenita. Mol Cell Biol. 2009;29:229-40 pubmed publisher
  502. Hensel Z, Weng X, Lagda A, Xiao J. Transcription-factor-mediated DNA looping probed by high-resolution, single-molecule imaging in live E. coli cells. PLoS Biol. 2013;11:e1001591 pubmed publisher
  503. Maddaluno L, Verbrugge S, Martinoli C, Matteoli G, Chiavelli A, Zeng Y, et al. The adhesion molecule L1 regulates transendothelial migration and trafficking of dendritic cells. J Exp Med. 2009;206:623-35 pubmed publisher
  504. Oganesian A, Armstrong L, Migliorini M, Strickland D, Bornstein P. Thrombospondins use the VLDL receptor and a nonapoptotic pathway to inhibit cell division in microvascular endothelial cells. Mol Biol Cell. 2008;19:563-71 pubmed
  505. Homer H, Gui L, Carroll J. A spindle assembly checkpoint protein functions in prophase I arrest and prometaphase progression. Science. 2009;326:991-4 pubmed publisher
  506. Oh J, Susor A, Conti M. Protein tyrosine kinase Wee1B is essential for metaphase II exit in mouse oocytes. Science. 2011;332:462-5 pubmed publisher
  507. Gari K, León Ortiz A, Borel V, Flynn H, Skehel J, Boulton S. MMS19 links cytoplasmic iron-sulfur cluster assembly to DNA metabolism. Science. 2012;337:243-5 pubmed publisher
  508. Lu Z, Wang Z, Liu Y, Wu C, Wang C, Zhang B, et al. Association of estrogen receptor alpha gene polymorphisms with cytokine genes expression in systemic lupus erythematosus. Croat Med J. 2009;50:117-23 pubmed
  509. Peacock J, Palmer J, Fink D, Ip S, Pietras E, Mui A, et al. PTEN loss promotes mitochondrially dependent type II Fas-induced apoptosis via PEA-15. Mol Cell Biol. 2009;29:1222-34 pubmed publisher
  510. Bright R, Carter D, Crevar C, Toapanta F, Steckbeck J, Cole K, et al. Cross-clade protective immune responses to influenza viruses with H5N1 HA and NA elicited by an influenza virus-like particle. PLoS ONE. 2008;3:e1501 pubmed publisher
  511. Corti D, Voss J, Gamblin S, Codoni G, Macagno A, Jarrossay D, et al. A neutralizing antibody selected from plasma cells that binds to group 1 and group 2 influenza A hemagglutinins. Science. 2011;333:850-6 pubmed publisher
  512. Schirle N, Macrae I. The crystal structure of human Argonaute2. Science. 2012;336:1037-40 pubmed publisher
  513. Chowdhury T, Arghandawi S, Brand J, Akanji O, Bader D, Salter D, et al. Dynamic compression counteracts IL-1beta induced inducible nitric oxide synthase and cyclo-oxygenase-2 expression in chondrocyte/agarose constructs. Arthritis Res Ther. 2008;10:R35 pubmed publisher
  514. Yang X, Goldberg M, He M, Xu H, Blevins J, Norgard M. Differential expression of a putative CarD-like transcriptional regulator, LtpA, in Borrelia burgdorferi. Infect Immun. 2008;76:4439-44 pubmed publisher
  515. Jenkins S, Rückerl D, Cook P, Jones L, Finkelman F, Van Rooijen N, et al. Local macrophage proliferation, rather than recruitment from the blood, is a signature of TH2 inflammation. Science. 2011;332:1284-8 pubmed publisher
  516. Tao X, Avalos J, Chen J, MacKinnon R. Crystal structure of the eukaryotic strong inward-rectifier K+ channel Kir2.2 at 3.1 A resolution. Science. 2009;326:1668-74 pubmed publisher
  517. Chen J, Li H, Addabbo F, Zhang F, Pelger E, Patschan D, et al. Adoptive transfer of syngeneic bone marrow-derived cells in mice with obesity-induced diabetes: selenoorganic antioxidant ebselen restores stem cell competence. Am J Pathol. 2009;174:701-11 pubmed publisher
  518. Shirato H, Ogawa S, Ito H, Sato T, Kameyama A, Narimatsu H, et al. Noroviruses distinguish between type 1 and type 2 histo-blood group antigens for binding. J Virol. 2008;82:10756-67 pubmed publisher
  519. Somvanshi V, Sloup R, Crawford J, Martin A, Heidt A, Kim K, et al. A single promoter inversion switches Photorhabdus between pathogenic and mutualistic states. Science. 2012;337:88-93 pubmed publisher
  520. Iliev I, Funari V, Taylor K, Nguyen Q, Reyes C, Strom S, et al. Interactions between commensal fungi and the C-type lectin receptor Dectin-1 influence colitis. Science. 2012;336:1314-7 pubmed publisher
  521. Epstein J, Tewari K, Lyke K, Sim B, Billingsley P, Laurens M, et al. Live attenuated malaria vaccine designed to protect through hepatic CD8⁺ T cell immunity. Science. 2011;334:475-80 pubmed publisher
  522. Moore D, Blackmore M, Hu Y, Kaestner K, Bixby J, Lemmon V, et al. KLF family members regulate intrinsic axon regeneration ability. Science. 2009;326:298-301 pubmed publisher
  523. Lu W, Casanueva M, Mahowald A, Kato M, Lauterbach D, Ferguson E. Niche-associated activation of rac promotes the asymmetric division of Drosophila female germline stem cells. PLoS Biol. 2012;10:e1001357 pubmed publisher
  524. Walser R, Burke J, Gogvadze E, Bohnacker T, Zhang X, Hess D, et al. PKCβ phosphorylates PI3Kγ to activate it and release it from GPCR control. PLoS Biol. 2013;11:e1001587 pubmed publisher
  525. Chae Y, Woo J, Kim M, Kang S, Kim M, Lee J, et al. Expression of aquaporin 5 (AQP5) promotes tumor invasion in human non small cell lung cancer. PLoS ONE. 2008;3:e2162 pubmed publisher
  526. Song Y, Smith R, To B, Millar A, Imaizumi T. FKF1 conveys timing information for CONSTANS stabilization in photoperiodic flowering. Science. 2012;336:1045-9 pubmed publisher
  527. Fisher M, Huang Y, Li X, McIver K, Toukoki C, Eichenbaum Z. Shr is a broad-spectrum surface receptor that contributes to adherence and virulence in group A streptococcus. Infect Immun. 2008;76:5006-15 pubmed publisher
  528. Circu M, Rodriguez C, Maloney R, Moyer M, Aw T. Contribution of mitochondrial GSH transport to matrix GSH status and colonic epithelial cell apoptosis. Free Radic Biol Med. 2008;44:768-78 pubmed publisher
  529. John K, Ragavan N, Pratt M, Singh P, Al-Buheissi S, Matanhelia S, et al. Quantification of phase I/II metabolizing enzyme gene expression and polycyclic aromatic hydrocarbon-DNA adduct levels in human prostate. Prostate. 2009;69:505-19 pubmed publisher
  530. Kang S, Akerblad P, Kiviranta R, Gupta R, Kajimura S, Griffin M, et al. Regulation of early adipose commitment by Zfp521. PLoS Biol. 2012;10:e1001433 pubmed publisher
  531. Eagle R, Flack G, Warford A, Martinez-Borra J, Jafferji I, Traherne J, et al. Cellular expression, trafficking, and function of two isoforms of human ULBP5/RAET1G. PLoS ONE. 2009;4:e4503 pubmed publisher
  532. Endsley M, Thill R, Choudhry I, Williams C, Kajdacsy-Balla A, Campbell W, et al. Expression and function of fatty acid amide hydrolase in prostate cancer. Int J Cancer. 2008;123:1318-26 pubmed publisher
  533. Liu C, Fu X, Liu L, Ren X, Chau C, Li S, et al. Sequential establishment of stripe patterns in an expanding cell population. Science. 2011;334:238-41 pubmed publisher
  534. Stenzel W, Muller U, Kohler G, Heppner F, Blessing M, McKenzie A, et al. IL-4/IL-13-dependent alternative activation of macrophages but not microglial cells is associated with uncontrolled cerebral cryptococcosis. Am J Pathol. 2009;174:486-96 pubmed publisher
  535. Wu X, Zhou T, Zhu J, Zhang B, Georgiev I, Wang C, et al. Focused evolution of HIV-1 neutralizing antibodies revealed by structures and deep sequencing. Science. 2011;333:1593-602 pubmed publisher
  536. Chatoo W, Abdouh M, David J, Champagne M, Ferreira J, Rodier F, et al. The polycomb group gene Bmi1 regulates antioxidant defenses in neurons by repressing p53 pro-oxidant activity. J Neurosci. 2009;29:529-42 pubmed publisher
  537. Nancy P, Tagliani E, Tay C, Asp P, Levy D, Erlebacher A. Chemokine gene silencing in decidual stromal cells limits T cell access to the maternal-fetal interface. Science. 2012;336:1317-21 pubmed publisher
  538. Szabó A, Papin C, Zorn D, Ponien P, Weber F, Raabe T, et al. The CK2 kinase stabilizes CLOCK and represses its activity in the Drosophila circadian oscillator. PLoS Biol. 2013;11:e1001645 pubmed publisher
  539. Xu J, Peng C, Sankaran V, Shao Z, Esrick E, Chong B, et al. Correction of sickle cell disease in adult mice by interference with fetal hemoglobin silencing. Science. 2011;334:993-6 pubmed publisher
  540. Tian Y, Sommerville L, Cuneo A, Kelemen S, Autieri M. Expression and suppressive effects of interleukin-19 on vascular smooth muscle cell pathophysiology and development of intimal hyperplasia. Am J Pathol. 2008;173:901-9 pubmed publisher
  541. Kent D, Li J, Tanna H, Fink J, Kirschner K, Pask D, et al. Self-renewal of single mouse hematopoietic stem cells is reduced by JAK2V617F without compromising progenitor cell expansion. PLoS Biol. 2013;11:e1001576 pubmed publisher
  542. Chang K, Zhong S, Weirauch M, Hon G, Pelizzola M, Li H, et al. Temporal transcriptional response to ethylene gas drives growth hormone cross-regulation in Arabidopsis. elife. 2013;2:e00675 pubmed publisher
ISSN : 2329-5139